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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7574#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 977 fasta sequence
[ATGAAGAAATAGTTTGCGATCTTATTGACAAATTAGGCAACATAGATAGAGTCATTGTTGTTGCAGTGTTATTCTCATGTGTAAACGATGTTGTTTCGATTGTTGGTACGATATCAGTAACTGATGTTTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGTAAAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTATTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTTGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAATTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTGAAGCTAGTGAAAGCGACCAACTAGGGTGGTTGTCTGAATCAGAAATGGATGTATGGTTCAGATTGAATGAGCGAGATATAGAGTACTCATTTTGTTGATGTTCAGACGGCTTTAAGCTGCTTAAGTCTGGTAATTGTTCACTACCTTGGTCAAATGAAGGAGAAGACGAAAAAAGATATCCTCTGATTGAACTATCCTGAAGTGTATCAACGATCTGTGTAGATTTCTTACTTAGTTGTATGTTGTCAGAATTTCCCCCAGTATCCTTTGATTCTTCATGTTTTCTCTGGTCAGATAAAGATATATGGTCATCTCGAGAATTAAGAAAGGCATCCATTCTTAAATTAAGTTGAGACAGTGATGTGACTGCATTCTGAGCG]
[+] EMBL CD114304 [ATGAAGAAATAGTTTGCGATCTTATTGACAAATTAGGCAACATAGATAGAGTCATTGTTGTTGCAGTGTTATTCTCATGTGTAAACGATGTTGTTTCGATTGTTGGTACGATATCAGTAACTGATGTTTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGT AAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTGTTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTCGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAGTTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTTGAGCTAGTGAA ]
[-] EMBL CD194867 [ cCAGTGTTATTCTCATGTGTAAACGATGTTGTTTCGATTGTTGGTACGATATCAGTAACTGATGTTTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGTAAAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTATTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTTGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAATTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAA ]
[-] EMBL CD195087 [ GTGTATTTCTCATGTG AAACGATGTTG TTCGATTG TGGTACGATATCAGTAACTGATG TTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGTAAAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTATTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTTGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAATTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAA ]
[+] EMBL CD069713 [ GGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTGAAGCTAGTGAAAGCGACCAACTAGGGTGGTTGTCTGAATCAGAAATGGATGTATGGTTCAGATTGAATGAGCGAGATATAGAGTACTCATTTTGTTGATGTTCAGACGGCTTTAAGCTGCTTAAGTCTGGTAATTGTTCACTACCTTGGTCAAATGAAGGAGAAGACGAAAAAAGATATCCTCTGATTGAACTATCCTGAAGTGTATCAACGATCTGTGTAGATTTCTTACTTAGTTGTATGTTGTCAGAATTTCCCCCAGTATCCTTTGATTCTTCATGTTTTCTCTGGTCAGATAAAGATATATGGTCATCTCGAGAATTAAGAAAGGCATCCATTCTTAAATTAAGTTGAGACAGTGATGTGACTGCATTCTGAGCG]
[+] EMBL CD069764 [ GGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTGAAGCTAGTGAAAGCGACCAACTAGGGTGGTTGTCTGAATCAGAAATGGATGTATGGTTCAGATTGAATGAGCGAGATATAGAGTACTCATTTTGTTGATGTTCAGACGGCTTTAAGCTGCTTAAGTCTGGTAATTGTTCACTACCTTGGTCAAATGAAGGAGAAGACGAAAAAAGATATCCTCTGATTGAACTATCCTGAAGTGTATCAACGATCTGTGTAGATTTCTTACTTAGTTGTATGTTGTCAGAATTTCCCCCAGTATCCTTTGATTCTTCATGTTTTCTCTGGTCAGATAAAGATATATGGTCATCTCGAGAATTAAGAAAGGCATCCATTCTTAAATTAAGTTGAGACAGTGATG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||