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Schistosoma mansoni
cluster # 7576 cluster # 7576       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7576#0 length = 700 sequences # 5  

consensusID : consensus_7576#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 700
fasta sequence
                              [GAACCTGAGATTTTACGACTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAGTGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGATATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTGAAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATACATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGCTGATGGAATGAAAGTGCAATACATACGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTGAAAACAACTAGATTTCGATTGTAATCCTTGTCACCAAATGATATACCTTTTTTCAAAAGAAAATTTACTTTTCTCCCTCGGCAAATAATGAAGCTGTATTAAATACAAAAAAGTAAATATTCATGGTTATGTTTTGTGTCTAAATGAGCTATAAACAGTGGAAAACCTTCCATTCTAGAAATGGAGGACACTTTCTGACCATATTAATTCAAATCATTATTTTATGATCAAATCAAGAAATTATGTCGACTTTTATAAGTAATCATTGATTTCTGTTGATTTCCTTTACCGTCTTANGAATC-CCG-AAATATCAAATAACTTACAAGTATTAAACTAACAC]

[+] EMBL CD161902             [GAACCTGAGATTTTACGACTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAGTGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGATATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTGAAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATACATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGCTGATGGAATGAAAGTGCAATACATACGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTGAAAACAACTAGATTTCGATTGTAATCCTTGTCACCAAATGATATACCTTTTTTCAAAAGAAAATTTACTTTTCTCCCTCGGCAAATAATGAAGCTGTATTAAATACAAAAAAGTAAATATTCATGGTTATGTTTTGTGTCTAAATGAGCTATAAACAGTGGAAAACCTTCCATTCTAGAAATGGAGGACACTTTCTGACCATATTAATTCAAATCATTATTTTATGATCAAATCAAGAAATTATGTCGACTTTTATAAGTAATCATTGATTTCTGTTGATTTCCTTTACCGTCTTANGAATCNCCG ANATATCAAATAACTTACAAGTATTAAACTAACAC]
[+] EMBL CD161819             [                 ACTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAGTGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGATATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTGAAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATACATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGCTGATGGAACGAAAGTGCAATACATGCGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD161901             [                  CTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAGTGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGATATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTGAAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATACATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGCTGATGGAATAAAAGTGCAATACATACGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTGAAAACAACTAGATTTCGATTGTAATCCTTGTCACCAAATGATATACCTTTTTTCAAAAGAAAATTTACTTTTCTCCCTCGGCAAATAATGAAGCTGTATTAAATACAAAAAAGTAAATATTCATGGTTATGTTTTGTGTCTAAATGAGCTATAAACAGTGGAAAACCTTCCATTCTAGAAATGGAGGACACTTTCTGACCATATTAATTCAAATCATTATTTTATGATCAAATCAAGAAATTATGTCGACTTTTATAAGTAATCATTGATTTCTGTTGATTTCCTTTACCGTCTTAAGAATC CCG AAATATCANATAACTTACAAGTATTAAACT     ]
[+] EMBL CD161809             [                  CTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAGTGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGATATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTGAAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATACATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGCTGATGGAATGAAAGTGCAATACATACGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTGAAAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD161938             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTCATGGTTATCTTTTGTGTGTAAATGAGCTATAAACAGTGCAAAACCTTCCATTCTAGAAATGGAGGACACTTTCTGACCATATTAATTCAAATCATTATTTTATGATCGAATCAAGAAATTATGTCGGCTTGTATAAGTAATCATTCATGTCTGTTGATTTCCTTTACCGTATTAGGAATC CCGAAAATATCGAATAACTTACAAGTATTAAACTAA   ]


>consensus_7576#0 GAACCTGAGATTTTACGACTGAGTTATTCGGATCAAGCGATGTTACGTTATTCAGACTAG TGACCACCATTTGACTTGATCGGTAAAACTTGATCTGAACTAAGAACTTGATAAAATGAT ATTTGTTATTACTCAATGACTGAATAATTTAGAGCTTATGTTGATTAAAAGAAATAGTTG AAGAGACAGTATGATCTAATCAATAAACTATGAATATCAGTTACCTGTTTATGTCAAATA CATATTAATTACGGTATCTAGAATATGAATAAAAGATCATTGACTTAAAACTTAAACAGC TGATGGAATGAAAGTGCAATACATACGGGAAGGATTTCTCAACCTTTGATTAGTAATCTG AAAACAACTAGATTTCGATTGTAATCCTTGTCACCAAATGATATACCTTTTTTCAAAAGA AAATTTACTTTTCTCCCTCGGCAAATAATGAAGCTGTATTAAATACAAAAAAGTAAATAT TCATGGTTATGTTTTGTGTCTAAATGAGCTATAAACAGTGGAAAACCTTCCATTCTAGAA ATGGAGGACACTTTCTGACCATATTAATTCAAATCATTATTTTATGATCAAATCAAGAAA TTATGTCGACTTTTATAAGTAATCATTGATTTCTGTTGATTTCCTTTACCGTCTTANGAA TCCCGAAATATCAAATAACTTACAAGTATTAAACTAACAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)