These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7582#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 580 fasta sequence [CTAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTAAAACTGCTGGGAATTGAGTTTTATATGGTTNNTAT-ACATCTGANNATGTGTTCCTAACTAG] [+] EMBL CD088661 [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTCATTTAAGTTATCTACACAGTGACAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTANAACTGCTGGGAATTGAGTTTTATATGGTTNNTAT ACATCTGANNATGTGTTCCTAACTAG] [+] EMBL CD088629 [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTAAAACTGCTGGGAATTGAGTTNTATATGGTTta ] [+] EMBL CD088718 [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGCCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTNAAACTGCTGGGAATTGAGTTNTA ] [+] EMBL CD088604 [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGGGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTAAAACTGCTG ] [+] EMBL CD088624 [catGTGGANTGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTANAACTGCTGCGAATTGAGTTTTATATGGTT TTATAACATCT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||