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Schistosoma mansoni
cluster # 7582 cluster # 7582       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7582#0 length = 580 sequences # 5  

consensusID : consensus_7582#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 580
fasta sequence
                              [CTAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTAAAACTGCTGGGAATTGAGTTTTATATGGTTNNTAT-ACATCTGANNATGTGTTCCTAACTAG]

[+] EMBL CD088661             [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTCATTTAAGTTATCTACACAGTGACAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTANAACTGCTGGGAATTGAGTTTTATATGGTTNNTAT ACATCTGANNATGTGTTCCTAACTAG]
[+] EMBL CD088629             [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTAAAACTGCTGGGAATTGAGTTNTATATGGTTta                              ]
[+] EMBL CD088718             [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGCCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTNAAACTGCTGGGAATTGAGTTNTA                                       ]
[+] EMBL CD088604             [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGGGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTAAAACTGCTG                                                     ]
[+] EMBL CD088624             [catGTGGANTGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTANAACTGCTGCGAATTGAGTTTTATATGGTT TTATAACATCT                    ]


>consensus_7582#0 CTAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTG TTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCG AAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGG GTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGT TGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAA ATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTT GTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACA TTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGA ATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTAAAACTGCTGGGAATTGAGTTT TATATGGTTNNTATACATCTGANNATGTGTTCCTAACTAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)