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Schistosoma mansoni
cluster # 7586 cluster # 7586       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7586#0 length = 560 sequences # 5  

consensusID : consensus_7586#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 560
fasta sequence
                              [CTTATTCACTGGACTATTCGTTCACTTATTATTACATCTGTCATGTTAATAAATTCTTTGATCTTATAGTGTTGATGAAACAAGATTTACTGACTAGTTATCTGAACGGGTTTAGTTTCGATTAGATCTTTTAAATTAACATATAATCTTTCATTTCACATATAAATTCAATGTTCATTTTATTGAATATTCAACGTGTGAATTCATAAATATATGTTTGTATATTCTTTCTTTGAGGCTATTATTACGTGATTTCCATGCATCATGGGGTTTAACTGCACTGTGGTCTGTATGGATTGCAGCAATTTTCGGTGGTGCATTCCAATATGTTTATCT-AGGTAGGTAAGTAGAATATCTCACAATGTGTTTCAAAATTTTTCTCTATATGAATCGGGAATCTTTCTAGGTGTTCTTTCTTTGTCAAAGTCTTCAAAATAATCAGTTGCTANGAGTTCAGAAAATAATTACTGAGTTCAAAAAAACAATAGTTTCTTGTAGTTAAGCCATCAACATGATATTGGTTTTACCAACCAACCTATTATCATGAACCTCATAGAACA]

[+] EMBL CD161682             [CTTATTCACTGGACTATTCGTTCACTTATTATTTCATCTGTCATGTTAATAAATTCTTTGATCTTATAGTGTTGATGAAACAAGATTTACTGACTAGTTATCTGAACGGGTTTAGTTTCGATTAGATCTTTTAAATTAACATATAATCTTTCATTTCACATATAAATTCAATGTTCATTTTATTGAATATTCAACGTGTGAATTCATAAATATATGTTTGTATATTCTTTCTTTGAGGCTATTATTACGTGATTTCCATGCATCATGGGGTTTAACTGCACTGTGGTCTGTATGGATTGCAGCAATTTTCGGTGGTGCATTCCAATATGTTTATCT AGGTAGGTAAGTAGAATATCTCACAATGTGTTTCAAAATTTTTCTCTATATGAATCGGGAATCTTTCTAGGTGTTCTTTCTTTGTCAAAGTCTTCAAAATAATCAGTTGCTAGGAGTTCAGAAAATAATTACTGAGTTCAAAAAAACAATAGTTTCTTGTAGTTAAGCCATCAACATGATATTGGTTTTACCAACCAACCTATTATCATGAAACTCATAGAACA]
[+] EMBL CD161690             [CTTATTCACTGGACTATTCGTTCACTTATTATTTCATCTGTCATGTTAATAAATTCTTTGATCTTATAGTGTTGATGAAACAAGATTTACTGACTAGTTATCTGAACGGGTTTAGTTTCGATTAGATCTTTTAAATTAACATATAATCTTTCATTTCACATATAAATTCAATGTTCATTTTATTGAATATTCAACGTGTGAATTCATAAATATATGTTTGTATATTCTTTCTTTGAGGCTATTATTACGTGATTTCCATGCATCATGGGGTTTAACTGCACTGTGGTCTGTATGGATTGCAGCAATTTTCGGTGGTGCATTCCAATATGTTTATCT AGGTAGGTAAGTAGAATATCTCACAATGTGTTTCAAAATTTTTCTCTATATGAATCGGGAATCTTTCTAGGTGTTCTTTCTTTGTCAAAGTCTTCAAAATAATCAGTTGCTANGAGTTCAGAAAATAATTACTGAGTTCAAAAAAACAATAGTTTCTTGTAGTTAAGCCATCAACATGATATTGGTTTTTAAAACCAAACTAATATCATGAACCTCATANAACc]
[+] EMBL CD161720             [CTTATTCACTGGACTATTCGTTCACTTATTATTACATCTGTCATGTTGATAAATTCTTTGATCTTATAGTGTTGATGAAACAAGATTTACTGACTAGTTATCTGAACGGGTTTAGTTTCGATTAGATCTTTTAAATTAACATATAATCTTTCATTTCACATATAAATTCAATGCTCATTTTATTGAATATTCAACGTGTGAATTCATAAATATATGTTTGTATATTCTTTCTTTGAGGCTATTATTACGTGATTTCCATGCATCATGGGGTTTAACTGCACTGTGGTCTGTATGGATTGCAGCAATTTTCGGTGGTGCATTCCAATATGTTTATCTAAGATAGGTAAGTAGAATATCTCACAATGTGTTTCAAAATTTTTCTCTATATGAATCGGGAATCTTTCTAGGTGTTCTTTCTTTGTCAAAGTCTTCAAAATAATCAGTTGCTANGAGTTCAG AAATAATTACTGAGTT AAAAAAACAAT GTTTCTTATAGTTAAGCCATCAACATGATATTGGTTNTACCAACCAACTAATTATCATGAACCTCATAGAACA]
[+] EMBL CD161664             [CTTATTCACTGGACTATTCGTTCACTTATTATTACATCTGTCATGTTAATAAATTCTTTGATCTTATAGTGTTGATGAAACAAGATTTACTGACTAGTTATCTGAACGGGTTTAGTTTCGATTAGATCTTTTAAATTAACATATAATCTTTCATTTCACATATAAATTCAATGTTCATTTTATTGAATATTCAACGTGTGAATTCATAAATATATGTTTGTATATTCTTTCTTTGAGGCTATTATTACGTGATTTCCATGCATCATGGGGTTTAACTGCACTGTGGTCTGTATGGATTGCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD161652             [CTTATTCACTGGACTATTCGTTCACTTATTATTACATCTGTCATGTTAATAAATTCTTTGATCTTATAGTGTTGATGAAACAAGATTTACTGACTAGTTATCTGAACGGGTTTAGTTTCGATTAGATCTTTTAAATTAACATATAATCTTTCATTTCACATATAAATTCAATGTTCATTTTATTGAATATTCAACGTGTGAATTCATAAATATATGTTTGGATATTCTTTCTTTGAGGCTATTATTACGTGATTTCCATGCATCATGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]


>consensus_7586#0 CTTATTCACTGGACTATTCGTTCACTTATTATTACATCTGTCATGTTAATAAATTCTTTG ATCTTATAGTGTTGATGAAACAAGATTTACTGACTAGTTATCTGAACGGGTTTAGTTTCG ATTAGATCTTTTAAATTAACATATAATCTTTCATTTCACATATAAATTCAATGTTCATTT TATTGAATATTCAACGTGTGAATTCATAAATATATGTTTGTATATTCTTTCTTTGAGGCT ATTATTACGTGATTTCCATGCATCATGGGGTTTAACTGCACTGTGGTCTGTATGGATTGC AGCAATTTTCGGTGGTGCATTCCAATATGTTTATCTAGGTAGGTAAGTAGAATATCTCAC AATGTGTTTCAAAATTTTTCTCTATATGAATCGGGAATCTTTCTAGGTGTTCTTTCTTTG TCAAAGTCTTCAAAATAATCAGTTGCTANGAGTTCAGAAAATAATTACTGAGTTCAAAAA AACAATAGTTTCTTGTAGTTAAGCCATCAACATGATATTGGTTTTACCAACCAACCTATT ATCATGAACCTCATAGAACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)