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Schistosoma mansoni
cluster # 7592 cluster # 7592       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7592#0 length = 1271 sequences # 5  

consensusID : consensus_7592#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1271
fasta sequence
                              [CCGTCGCAGTTAAACGTGAACTATGATCCTCGTTTAATTGTTCACGTTGTCTAGCTCTTTGTAATTCTGATTGGATTTCATTCATTTCAACTTCCATATCTTTAATACGTTCTTCAGCTGTAGATAATTGTACACGTAATTCATCAACAACTGTCACATTAGGATTATTATTGTTACTGTTATTATTACTAACTAAATGAGAACTTTTGCTGTTTTTAATAGTTTTTTCATCATCGGAAATAGTTTCATTTTCAATAGATTCAATAAATTCGCCACCATTTTCAATAGCTGAGTGTTCTGTCGATGTTGTTGTTGTTACAGTTGCAGGTGTATTCACTTTCTCATTTTGTTGCATTGTATTCACTTTGACAATGGCTAATTCATTTTGTACTGTTTCTAATTCGCTAACCAAATGATTGGCATGATCTTTTGCTTGTTTCAATTCAATTTCACGTGTAATCAATTCTGACTGAGCTCGACTAAGTCTATCCAACGTACCAGTAGCTTCACGTTGTGTAGCAAGATAACGTTGTTCCAAAGTTGCGATACGAGCTTCTTGATCTTCACGTTGAGCTTCCAACTCTCTTAATTCTCTTTGTAAACGAGAAATCTGATCATGAGCACGTGATAATTCCTTTTGTAATGTTGTATTAGATGCTTCTAAATCTCTAGATTTTGTAGTGACTTCAACAAGTTTACGTTCAACAGCTACAGCACTGGCAGCAGCCGCCGCTGCAGCTGCAGCAACTGATGCAACTGTTTTTGCACCGGAATTTTCTGAAGAATTCACTGCTGATGAACTTTCATCGTTTGAATCTTTTGATGTGATTGGTGGTCCACCTGGNAGTAATGAGGCTAGTTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAATCAAC--ATTTAAAGACAAAAAGAAATTACAAACCATAAAAACTGTACGAACATCTAATGTTAAACAACATAGGTAATTAATGAATTTTAGAAGATACTGACTAAAGTTATTTATTTAACATTTGATATGAAACTGAAGTGTGGAAGAATTCAACTTTTTACAGGTTTCAAGAATGTATTAAGTGGAAAAGTCCTAAACTATTTATTGCCTAGTGATAATCTTGCTAGTACCACATTCATTAGTGGTACAATTTAATAGAAGAACCTTAATAAAGGCAAAACTAGTGTATCACATCCATCTACTTTCTTTCTATCTTCTCTACAAACATTATAACAGCAAAGTGATTTGTTTC]

[-] EMBL CD063257             [CCGTCGCAGTTAAACGTGAACTATGATCCTCGTTTAATTGTTCACGTTGTCTAGCTCTTTGTAATTCTGATTGGATTTCATTCATTTCAACTTCCATATCTTTAATACGTTCTTCAGCTGTAGATAATTGTACACGTAATTCATCAACAACTGTCACATTAGGATTATTATTGTTACTGTTATTATTACTAACTAAATGAGAACTTTTGCTGTTTTTAATAGTTTTTTCATCATCGGAAATAGTTTCATTTTCAATAGATTCAATAAATTCGCCACCATTTTCAATAGCTGAGTGTTCTGTCGATGTTGTTGTTGTTACAGTTGCAGGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD065027             [                                                                                                    TTTAATACGTTCTTCAGCTGTAGATAATTGTACACGTAATTCGTCAACAACTGTCACATTAGGATTATTATTGTTACTGTTATTATTACTAACTAAATGAGAACTTTTGCTGTTTTTGATAGTTTTTTCATCATCGGAGATAGTTTCATTTCCAATAGATTCAATAAATTCGCCACCATTTTCAATAGCTGAGTGTTCCGTCGATGTTGTTGTTGTTACAGTTGCAGGTGTATTCACTTTCTCATTTTGTTGCATTGTATTCACTTTGACAATGGCTAATTCATTTTGTACTGTTTCTAATTCGCTAACCAAATGATTGGCATGATCTTTTGCTTGTTTCAATTCAATTTCACGTGTAATCAATTCTGACTGAGCTCGACTAAGTCTATCCAACGTACCAGTAGCTTCACGTTGTGTAGCAAGATAACGTTGTTCCAAAGTTGCGATACGAGCTTCTTGATCTTCACGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD193249             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTATTCACTTTGACAATGGCTAATTCATTTTGTACTGTTTCTAATTCGCTAACCAAATGATTGGCATGATCTTTTGCTTGTTTCAATTCAATTTCACGTGTAATCAATTCTGACTGAGCTCGACTAAGTCTATCCAACGTACCAGTAGCTTCACGTTGTGTAGCAAGATAACGTTGTTCCAAAGTTGCGATACGAGCTTCTTGATCTTCACGTTGAGCTTCCAACTCTCTTAATTCTCTTTGTAAACGAGAAATCTGATCATGAGCACGTGATAATTCCTTTTGTAATGTTGTATTAGATGCTTCTAAATCTCTAGATTTTGTAGTGACTTCAACAAGTTTACGTTCAACAGCTACAGCACTGGCAGCAGCCGCCGCTGCAGCTGCAGCAACTGATGCAACTGTTTTTGCACCGGAATTTTCTGAAGAATTCACTGCTGATGAACTTTCATCGTTTGAATCTTTTGATGTGATTGGTGGTCCACCTGGNAGTAATGAGGCTAGTTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAATCAAC  ATTTcc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD197333             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAATGAGGCTAGTTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAGTCAACTGATTTAAAGACAAAAAGAAATTACAAACCATAAAAACTGTACGAACATCTAATGTTAAACAACATAGGTAATTAATGAATTTTAGAAGATACTGACTAAAGTTATTTATTTAACATTTGATATGAAACTGAAGTGTGGAAGAATTCAACTTTTTACAGGTTTCAAGAATGTATTAAGTGGAAAAGTCCTAAACTATTTATTGCCTAGTGATAATCTTGCTAGTACCACATTCATTAGTGGTACAATTTAATAGAAGAACCTTAATAAAGGCAAAACTAGTGTATCACATCCATCTACTTTCTTTCTATCTTCTCTACAAACATTATAACAGCAAAGTGATTTGTTTC]
[-] EMBL CD197860             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAATCAACTGATTTAAAGACAAAAAGAAATTACAAACCATAAAAACTGTACGAACATCTAATGTTAAACAACATAGGTAATTAATGAATTTTAGAAGATACTGACTAAAGTTATTTATTTAACATTTGATATGAAACTGAAGTGTGGAAGAATTCAACTTTTTACAGGTTTCAAGAATGTATTAAGTGGAAAAGTCCTAAACTTTTTATTGCCTAGTGATAATCTTGCTAGTACCACATTCATTAGTGGTACAATTTAATAGAAGAACCTTAATAAAGGCAAAACTAGTGTATCACATCCATCTACTTTCTTTCTATCTTCTCTACAAACATTATAACAGCAAAGTGATTTGTTTC]


>consensus_7592#0 CCGTCGCAGTTAAACGTGAACTATGATCCTCGTTTAATTGTTCACGTTGTCTAGCTCTTT GTAATTCTGATTGGATTTCATTCATTTCAACTTCCATATCTTTAATACGTTCTTCAGCTG TAGATAATTGTACACGTAATTCATCAACAACTGTCACATTAGGATTATTATTGTTACTGT TATTATTACTAACTAAATGAGAACTTTTGCTGTTTTTAATAGTTTTTTCATCATCGGAAA TAGTTTCATTTTCAATAGATTCAATAAATTCGCCACCATTTTCAATAGCTGAGTGTTCTG TCGATGTTGTTGTTGTTACAGTTGCAGGTGTATTCACTTTCTCATTTTGTTGCATTGTAT TCACTTTGACAATGGCTAATTCATTTTGTACTGTTTCTAATTCGCTAACCAAATGATTGG CATGATCTTTTGCTTGTTTCAATTCAATTTCACGTGTAATCAATTCTGACTGAGCTCGAC TAAGTCTATCCAACGTACCAGTAGCTTCACGTTGTGTAGCAAGATAACGTTGTTCCAAAG TTGCGATACGAGCTTCTTGATCTTCACGTTGAGCTTCCAACTCTCTTAATTCTCTTTGTA AACGAGAAATCTGATCATGAGCACGTGATAATTCCTTTTGTAATGTTGTATTAGATGCTT CTAAATCTCTAGATTTTGTAGTGACTTCAACAAGTTTACGTTCAACAGCTACAGCACTGG CAGCAGCCGCCGCTGCAGCTGCAGCAACTGATGCAACTGTTTTTGCACCGGAATTTTCTG AAGAATTCACTGCTGATGAACTTTCATCGTTTGAATCTTTTGATGTGATTGGTGGTCCAC CTGGNAGTAATGAGGCTAGTTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGA TTTGTGTGATATGATTAGAATCAACATTTAAAGACAAAAAGAAATTACAAACCATAAAAA CTGTACGAACATCTAATGTTAAACAACATAGGTAATTAATGAATTTTAGAAGATACTGAC TAAAGTTATTTATTTAACATTTGATATGAAACTGAAGTGTGGAAGAATTCAACTTTTTAC AGGTTTCAAGAATGTATTAAGTGGAAAAGTCCTAAACTATTTATTGCCTAGTGATAATCT TGCTAGTACCACATTCATTAGTGGTACAATTTAATAGAAGAACCTTAATAAAGGCAAAAC TAGTGTATCACATCCATCTACTTTCTTTCTATCTTCTCTACAAACATTATAACAGCAAAG TGATTTGTTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)