These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7627#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1647 fasta sequence [AGAGACTGAATAGTAAATTATGTTATAAACATTTATTATATGTTCTCATAAAGATTAAATTTCTTTTTAATAATGGCTTCTCAACATTGTTCAATTCGTTTAATTCGTCAAGATACATCTATTCCATGGGGTTTTCGATTAGAAGGCGGTACTGATTTTGGTCATTCTATTACTATACAACATGTAAATCCTGGAAGTATAGCCGATTACAGTGGACTTCGGGCTGGTGATCATGTAGTACGAATTAATCAATCTGAAACTAAATGGATGAGACATGATGATGCGAAAATGGAGATCATACGATCAAGTAATGATTTAGAATTGTTTGTTCAACGTAGTGACATAGCAAATACATATACACATCAAAATAATTTTTCTCCATCACCAAAACATTCTTTAAGTAGATCACCAAAACCAGTTTCTCCACAACCAGTTAATCGACAAACTATTTGGCAACCTAAAATTGTTTCATCTGTTCAAATGTCACCAAATAATAGTCATAATAATCATCAAGCATATGGGACTCATGTTAATTTAGAGGCTACATCGCAAAATGAAGAGTCATCATCNTATCGGAGTTAAACACAATATCTCACCACTTCCATTTGGTCAATCACCACCGGCACCCGGAGAAAACGTACTAACAAAAGTCGGTGAGGGACGTTATAGAAAAATTAGCCACTCATCATAC-ATTCACCTATGGGTTNTATATAATCAAAAAAATAGAAATCAAACATTTGAAAGAACATTATCTAATGCTACAGGTAATCAACTTGATGGTGCAGCACCTCGAGTATCACCAACAACACCGCCATCAANGCATTGCGGATCATGTGGAGGTTTTATACGCGGTGTTTTTGTTAAAGTACAAGGTCGTATCCCAATGCATCCTGAATGCCTTAAATGTTGTAAATGTGGAATAGGTTTACGCAATATTGGTTATTTCTACATTAAAGAACAATTATATTGTGAAACTCATGCTAAACAGGCTGCACCACCTCCTGAACCTGGCATGAAAGCTGTTGTTGTTTATAAATAACAGGTGAACTTTGAAAAAAAAAATAATAATAATTTCAGTTCTATAAAAGATATTTAATACCCAATTATTTCCTGGCAACAAAATGTTTAGTTTATAAAATTTGTTACTAAAATCACTAGAATTAGTTTAAAATTGGATATTATGTAAAGCCATCTTAACTCTCATCATCAGTTGGTATGTATATTAAATTATAACTTATATAACTTTAAATGATATGAAATAAATATCTACAATTTATTATACCCCTTCTGTTTGCTTTGAGAAGAAAAACAACAAANAAAGCTCTCTTCCCGATTATCAGTCAATTTTTTTTGGGGGGGATTCAAGGAAATATTTACAACCTTTCTAGATGTTTCATTCTAATTATTCTGTAGTTTACTTAATTATCTTCAATAATATTCATCATTAATGATCGTAATTATAAAATTGTAGTTGTTTAACTAATCAGAAATTGATTTTATTGATTAGATTATTGTTAATTGCGATCAATTTATGAACCTTTTAAATATTGATTGTGTATCCGGTAATAGAATCATCAATTTAGTTTTATCAAAATTGTTATGACCATTTCAATGAAGATAAAAGAAAAGAAAGTATGTTTAAAAAAA] [+] EMBL CD079988 [AGAGACTGAATAGTAAATTATGTTATAAACATTTATTATATGTTCTCATAAAGATTAAATTTCTTTTTAATAATGGCTTCTCAACATTGTTCAATTCGTTTAATTCGTCAAGATACATCTATTCCATGGGGTTTTCGATTAGAAGGCGGTACTGATTTTGGTCATTCTATTACTATACAACATGTAAATCCTGGAAGTATAGCCGATTACAGTGGACTTCGGGCTGGTGATCATGTAGTACGAATTAATCAATCTGAAACTAAATGGATGAGACATGATGATGCGAAAATGGAGATCATACGATCAAGTAATGATTTAGAATTGTTTGTTCAACGTAGTGACATAGCAAATACATATACACATCAAAATAATTTTTCTCCATCACCAAAACATTCTTTAAGTAGATCACCAAAACCAGTTTCTCCACAACCAGTTAATCGACAAACTATTTGGCAACCTAAAATTGTTTCATCTGTTCAAATGTCACCAAATAATAGTCATAATAATCATCAAGCATATGGGACTCATGTTAATTTAGAGGCTACATCGCAAAATGAAGAGTCATCATCNTATCGGAGTTAAACACAATATCTCACCACTTCCATTTGGTCAATCACCACCGGCACCCGGAGAAAACGTACTAACAAAAGTCGGTGAGGGACGTTATAGAAAAATTAGCCACTCATCATAC ATTCACCTATGGGTTNTATA ] [-] EMBL CD063647 [ AAATGGAGATCATACGATCAAGTAATGA NTAGAA TGTGTGTTCAACGTAGTGACATAGCAAATACATATACACATCAAAATAA TTTTCTCCATCACCAAAACATTCTTTAAGTAGATCACCAAAACCAGTTTCTCCACAACCAGTTAATCGACAAACTATTTGGCAACCTAAAATTGTTTCATCTGTTCAAATGTCACCAAATAATAGTCATAATAATCATCAAGCATATGGGACTCATGTTAATTTAGAGGCTACATCGCAAAATGAAGAGTCATCATC TATCGGAGTTAAACACAATATCTCACCACTTCCATTTGGTCAATCACCACCGGCACCCGGAGAAAACGTACTAACAAAAGTCGGTGAGGGACGTTATAGAAAAATTAGCCACTCATCATACAATTCACCTATGGGTT TATATAATCAAAAAAATAGAAATCAAACATTTGAAAGAACATTATCTAATGCTACAGGTAATCAACTTGATGGTGCAGCACCTCGAGTATCACCAACAACACCGCCATCAANGCA ] [+] EMBL CD080296 [ aggctAACTTGATGGTGCAGCACCTCGAGTATCACCAACAACACCGCCATCAATGCATTGCGGATCATGTGGAGGTTTTATACGCGGTGTTTTTGTTAAAGTACAAGGTCGTATCCCAATGCATCCTGAATGCCTTAAATGTTGTAAATGTGGAATAGGTTTACGCAATATTGGTTATTTCTACATTAAAGAACAATTATATTGTGAAACTCATGCTAAACAGGCTGCACCACCTCCTGAACCTGGCATGAAAGCTGTTGTTGTTTATAAATAACAGGTGAACTTTGAAAAAAAAAATAATAATAATTTCAGTTCTATAAAAGATATTTAATACCCAATTATTTCCTGGCAACAAAATGTTTAGTTTATAAAATTTGTTACTAAAATCACTAGAATTAGTTTAAAATTGGATATTATGTAAAGCCATCTTAACTCTCATCATCAGTTGGTATGTATATTAAATTATAACTTATATAACTTTAAATGATATGAAATAAATATCTACAATTTATTATACCCCTTCTGTTTGCTTTGAGAAGAAAAACAACAAANAAAGCTCTCTTCCCGATTATCAGTCAATTTTTTTTGGGGGGGATTCAAGGAAATATTTACAACCTTTCTAGATGTTTCATTCTAATTATTCTGTAGTTTACTTAATTATCT ] [+] EMBL CD197835 [ TTATACGCGGTGTTTTTGTTAAAGTACAAGGTCGTATCCCAATGCATCCTGAATGCCTTAAATGTTGTAAATGTGGAATAGGTTTACGCAATATTGGTTATTTCTACATTAAAGAACAATTATATTGTGAAACTCATGCTAAACAGGCTGCACCACCTCCTGAACCTGGCATGAAAGCTGTTGTTGTTTATAAATAACAGGTGAACTTTGAAAAAAAAAATAATAATAATTTCAGTTCTATAAAAGATATTTAATACCCAATTATTTCCTGGCAACAAAATGTTTAGTTTATAAAATTTGTTACTAAAATCACTAGAATTAGTTTAAAATTGGATATTATGTAAAGCCATCTTAACTCTCATCATCAGTTGGTATGTATATTAAATTATAACTTATATAACTTTAAATGATATGAAATAAATATCTACAAT ] [-] EMBL CD074214 [ GAACTTTGAAAAAAAAAATAATAATAATTTCAGTTCTATAAAAGATATTTAATACCCAATTATTTCCTGGCAACAAAATGTTTAGTTTATAAAATTTGTTACTAAAATCACTAGAATTAGTTTAAAATTGGATATTATGTAAAGCCATTTTAACTTTCATCATCAGTTGGTATGTATATTAAATTATAACTTATATAACTTTAAATGATATGAAATAAATATTTACAATTTATTATACCCCTTCTGTTTGCTTTGAGAAGAAAAACAACAAAAAAAGCTTTTTTCCCGATTATCAGTCAATTTTTTTTGGGGGGGATTCAAGGAAATATTTACAACCTTTTTAGATGTTTCATTTTAATTATTCTGTAGTTTACTTAATTATTTTCAATAATATTCATCATTAATGATCGTAATTATAAAATTGTAGTTGTTTAACTAATCAGAAATTGATTTTATTGATTAGATTATTGTTAATTGCGATCAATTTATGAACCTTTTAAATATTGATTGTGTATCCGGTAATAGAATCATCAATTTAGTTTTATCAAAATTGTTATGACCATTTCAATGAAGATAAAAGAAAAGAAAGTATGTTTAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||