These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7639#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1380 fasta sequence [GTTGAGTGTACCGATTCCATATCTATATATTCATTTAAAGAAAGTGCGTAGTCATATTTTTCAACAATGCAGACCGAAAAAAAGAAGGTTGAGGTACCTCCTACTATGAAGTTTATATTGGGTGGAACTTCTGGAATGTGTGCTTCTGTTTGCGTTCAACCTTTGGACCTCGTCAAAAATAGGATGCAAATGAGCGGTATCGGAAGTGCTACTTCTGGTCAACGTAATAGTCTTCAGGTGCTTCTATCAGTTATTAAAAATGAAGGATTTTTGGCAATATACTCAGGTTTATCAGCTGGATTACTTCGTCAAGCCACCTACTCAACTGCACGTCTAGGCATGTATACAAATTTATTTGAACAATATACAAAGCGAAAAAAAGAATCTCCCAATTTCTTCACTAAAATAAGTATAGCTGTAACTGCTGGGATATGCGGCGCATTCATTGGTACACCAGCTGAAATTTGTCTTATCCGTATGACATCCGATGGCAGATTACCACCAGCAGAACGTCTCAATTATTCCAATGTATTCAATGCTCTAACAAGAATCGCTCGTGAAGAAGGAGTGTTAACATTGTGGCGGGGTGCAGTCCCAACTATGGGTCGAGCAGCTGTAGTTAATGGTGCACAATTAGCCACTTATTCTCAAGCCAAACAAAAACTTATTGAAATCGGTCATTTCACTGATGGCTTAGGTGTACATATAATGGCTAGTTTATTAAGTGGATTTACTACATCTGTTTTCTCTTTACCAATTGATATTGCTAAGACCAGAATTCAAAATATGAAAACTATTGATGGAAAACCAGAGTATAAAAATATGGGGGATGTTATTTTACGAGTAATACGAAATGAAGGTATTCCATCATTATGGAAAGGTTTTACACCATATTTCTTACGTATTGGACCTCATACAGTATTGACATTTATCTTTTTAGAACAATTAAATCGTTTATATATAAAACATATAATAGGTGATTCAAGTGGTCAACGTTCCGGTGGACTTTAGAAATTAATCAATTCTTCACTATTCTTATTATGTTTTCTAGTATCGATTAAAGCAATAGCATTCCTTATTGTATATAATTTGTGTATGCTCCATTTTTACTATCTATACATAAGGAATTATATATGTATGTATGTGTGTGTGTATTGCATAGTTAATTTTGAGTTTCCTAGTAGTGTTTTATTGTTTCCTATCATTTATTTGTTTTCACTTCAAAATTTTGATTGCAATATTTATCTTAGATGATATTTAAATGTTACAATGATTCAATTTACCTATCGAAAGTTTTTGTTTATGCAATTCGTTTCACTTTCATTTGTGATTCAATGTTTAATTTTTATTCTATCTCTGTGTAAGTGCATATAATACAAT] [+] EMBL CD079078 [GTTGAGTGTACCGATTCCATATCTATATATTCATTTAAAGAAAGTGCGTAGTCATATTTTTCAACAATGCAGACCGAAAAAAAGAAGGTTGAGGTACCTCCTACTATGAAGTTTATATTGGGTGGAACTTCTGGAATGTGTGCTTCTGTTTGCGTTCAACCTTTGGACCTCGTCAAAAATAGGATGCAAATGAGCGGTATCGGAAGTGCTACTTCTGGTCAACGTAATAGTCTTCAGGTGCTTCTATCAGTTATTAAAAATGAAGGATTTTTGGCAATATACTCAGGTTTATCAGCTGGATTACTTCGTCAAGCCACCTACTCAACTGCACGTCTAGGCATGTATACAAATTTATTTGAACAATATACAAAGCGAAAAAAAGAATCTCCCAATTTCTTCACTAAAATAAGTATAGCTGTAACTGCTGGGATATGCGGCGCATTCATTGGTACACCAGCTGAAATTTGTCTTATCCGTATGACATCCGATGGCAGATTACCACCAGCATAACGTCTCAATTATTCCAATGTATTCAATGCTCTATCAAGAATCGC ] [-] EMBL CD063722 [ CAGTTATTAAAAATGAAGGATTTTTGGCAATATACTCAGGTTTATCAGCTGGATTACTTCGTCAAGCCACCTACTCAACTGCACGTTTAGGCATCTATACAAATTTATTTGAACAATATACAAAGCGAAAAAAAGAATCTCCCAATTTCTTCACTAAAATAAGTATAGCTGTAACTGCTGGGATATGCGGCGCATTCATTGGTACACCAGCTGAAATTTGTCTCATCCGTATGACATCCGATGGCAGATTACCACCAGCAGAACGTCTCAATTATTCCAATGTATTCAATGCTCTAACAAGAATCGCTCGTGAAGAAGGAGTGTTAACATTCTGGCGGGTTGCAGTCACAACTATGGGTCGAGCAGCTGTAGTTAATGGTGCACAATTAGCCACTTATTCTCAAGCCAAACAAAAACT ] [-] EMBL CD189674 [ CGGCGCATTCATTGGTACACCAGCTG AATTGTTCTTATCCGTATGACATCCGATGGCAGATACCCACCAGCAGAACGTCTCAATTATTCCAATGTATTCAATGCTCTAACAAGAATCGCTCGTGAAGAAGGAGTGTTAACATTGTGGCGGGGTGCGGTCCCAACTATGGGTCGAGCAGCTGTAGTTAATGGTGCACAATTAGCCACTTATTCTCAAGCCAAACAAAAACTTATTGAAATCGGTCATTTCACTGATGGCTTAGGTGTACATATAATGGCTAGTTTATTAAGTGGATTTACTACATCTGTTTTCTCTTTACCAATTGATA ] [+] EMBL CD191637 [ TCTAACAAGAATCGCTCGTGAAGAAGGAGTGTTAACATTGTGGCGGGGTGCAGTCCCAACTATGGGTCGAGCAGCTGTAGTTAATGGTGCACAATTAGCCACTTATTCTCAAGCCAAACAAAAACTTATTGAAATCGGTCATTTCACTGATGGCTTAGGTGTACATATAATGGCTAGTTTATTAAGTGGATTTACTACATCTGTTTTCTCTTTACCAATTGATATTGCTAAGACCAGAATTCAAAATATGAAAACTATTGATGGAAAACCAGAGTATAAAAATATGGGGGATGTTATTTTACGAGTAATACGAAATGAAGGTATTCCATCATTATGGAAAGGTTTTACACCATATTTCTTACGTATTGGACCTCATACAGTATTGACATTTATCTTTTTAGAACAATTAAATCGTTTATATATAAAACATATAATAGGTGAT ] [-] EMBL CD073532 [ CGAAATGAAGGTATTCCATCATTATGGAAAGGTTTTACACCATATTTCTTACGTATTGGACCTCATACAGTATTGACATTTATCTTTTTAGAACAATTAAATCGTTTATATATAACACATATAATAGGTGATTCAAGTGGTCAACGTTCCGGTGGACTTTAGAAATTAATCAATTCTTCACTATTCTTATTATGTTTTCTAGTATCGATTAAAGCAATAGCATTCCTTATTGTATATAATTTGTGTATGCTCCATTTTTACTATCTATACATAAGGAATTATATATGTATGTATGTGTGTGTGTATTGCATAGTTAATTTTGAGTTTCCTAGTAGTGTTTTATTGTTTCCTATCATTTATTTGTTTTCACTTCAAAATTTTGATTGCAATATTTATCTTAGATGATATTTAAATGTTACAATGATTCAATTTACCTATCGAAAGTTTTTGTTTATGCAATTCGTTTCACTTTCATTTGTGATTCAATGTTTAATTTTTATTCTATCTCTGTGTAAGTGCATATAATACAAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||