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Schistosoma mansoni
cluster # 7658 cluster # 7658       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7658#0 length = 620 sequences # 5  

consensusID : consensus_7658#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 620
fasta sequence
                              [AAATTCGCTTGTGGCGGTAATTCGCGTGGCTAGTTCTTTGGTGCTGAGCGATGGCGGATTTTAACAATCCTTTGCAAAAGTTTAAGCTGGTGTTTTTGGGAGAACAGAGTGTCGGGAAGACATCCCTCATTACTAGGTTTATGTATGAAACTTTTGATAATCTGTATCAGGCAACAATTGGTATTGACTTCTTATCAAAAACTATGTACCTTGAAGATCGAACTATTCGTCTGCAATTATGGGACACTGCGGGACAGGAACGTTTTCGAAGTTTGATTCCCAGCTACATACGTGACTCTTCAGCTGCAGTTGTTGTTTATGACATATGCAATGCTGGATCTTTTCACCAGGCTTCAAAGTGGGTTGATGACGTCAGAAACGAACGTGGGGGGGATGTTATTATTATCCTCGTTGGAAACAAAACGGATCTGTCTGATAAAAGAAAAGTAACTACTGAAGAGGGTGAGCTTCTTGCTAAAAAACTAGAAGTCATGTTTATTGAAACGAGTGCGAAGGCTGGATATAATGTCAAAGTTCTGTTCCGTCGAATCGCTACAGAATTGGACGATCAAAATAGTCCACTATCCATACATGATGATTATATTGAACTGAAACCAATT]

[+] EMBL CD202881             [AAATTCGCTTGTGGCGGTAATTCGCGTGGCTAGTTCTTTGGTGCTGAGCGATGGCGGATTTTAACAATCCTTTGCAAAAGTTTAAGCTGGTGTTTTTGGGAGAACAGAGTGTCGGGAAGACATCCCTCATTACTAGGTTTATGTATGAAACTTTTGATAATCTGTATCAGGCAACAATTGGTATTGACTTCTTATCAAAAACTATGTACCTTGAAGATCGAACTATTCGTCTGCAATTATGGGACACTGCGGGACAGGAACGTTTTCGAAGTTTGATTCCCAGCTACATACGTGACTCTTCAGCTGCAGTTGTTGTTTATGACATATGCAATGCTGGATCTTTTCACCAGGCTTCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI974966             [                             CTAGTTCTTTGGTGCTGAGCGATGGCGGATTTTAACAATCCTTTGCAAAAGTTTAAGCTGGTGTTTTTGGGAGAACAGAGTGTCGGGAAGACATCCCTCATTACTAGGTTTATGTATGAAACTTTTGATAATCTGTATCAGGCAACAATTGGTATTGACTTCTTATCAAAAACTATGTACCTTGAAGATCGAACTATTCGTCTGCAATTATGGGACACTGCGGGACAGGAACGTTTTCGAAGTTTGATTCCCAGCTACATACGTGACTCTTCAGCTGCAGTTGTTGTTTATGACATATGCAATGCTGGATCTTTTCACCAGGCTTCAAAGTGGGTTGATGACGTCAGAAACGAACGTGGGGGGGATGTTATTATTATCCTCGCTGGAAACAAAACGGATCTGTCTGATAAAAGAGAAGTAACTACTGAAGAGGGTGAGCTTCTTGCTAAAAAACTAGAAGTCATGTTTATTGAAACGAGTtg                                                                                                             ]
[+] EMBL AI067225             [                               AGTTCTTTGGTGCTGAGCGATGGCGGATTTTAACAATCCTTTGCAAAAGTTTAAGCTGGTGTTTTTGGGAGAACAGAGTGTCGGGAAGACATCCCTCATTACTAGGTTTATGTATGAAACTTTTGATAATCTGTATCAGGCAACAATTGGTATTGACTTCTTATCAAAAACTATGTACCTTGAAGATCGAACTATTCGTCTGCAATTATGGGACACTGCGGGACAGGAACGTTTTCGAAGTTTGATTCCCAGCTACATACGTGACTCTTCAGCTGCAGTTGTTGTTTATGACATATGCAATGCTGGATCTTTTCACCAGGCTTCAAAGTGGGTTGATGACGTCAGAAACGAACGTGGGGGGGATGTTATTATTATCCTCGTTGGAAACAAAACGGATCTGTCTGATAAAAGAAAAGTAACTACTGAAGAGGGTGAGCTTCTTGCTAAAAAACTAGAAGTCATGTTTATTGAAACGAGTGCGAAGGCTGGATATAATGTCAAAGTTCTG                                                                                 ]
[+] EMBL AI067359             [                                     TTGGTGCTGAGCGATGGCGGATTTTAACAATCCTTTGCAAAAGTTTAAGCTGGTGTTTTTGGGAGAACAGAGTGTCGGGAAGACATCCCTCATTACTAGGTTTATGTATGAAACTTTTGATAATCTGTATCAGGCAACAATTGGTATTGACTTCTTATCAAAAACTATGTACCTTGAAGATCGAACTATTCGTCTGCAATTATGGGACACTGCGGGACAGGAACGTTTTCGAAGTTTGATTCCCAGCTACATACGTGACTCTTCAGCTGCAGTTGTTGTTTATGACATATGCAATGCTGGATCTTTTCACCAGGCTTCAAAGTGGGTTGATGACGTCAGAAACGAACGTGGGGGGGATGTTATTATTATCCTCGTTGGAAACAAGACGGATCTGTCTGATAAAAGAAAAGTAACTACTGAAGAGGGTGAGCTTCTTGCTAAAATACTAGAAGTCATGTTTATTGAAACGAGTGCGAAGGCTGGATATAATGTCAAAGTTCTGTTCCGTCGAATCGCTACAGAATTGGACGATCAAAATAGTCCACTATCCATACATGATGATTATATTGAACTGAAACCAATT]
[+] EMBL CD188754             [                                                                                                                                                                                                                                                                   ACGTTTTCGAAGTTTGATTCCCAGCTACATACGAGACACTTCAGCTGCAGTTGTTGTTTATGACATATGCAATGCTGGATCTTTTCACCAGGCTTCAAAGTGGGTTGATGACGTCAGAAACGAACGTGGGGGGGATGTTATTATTATCCTCGTTGGAAACAAAACGGATCTGTCTGATAAAAGAAAAGTAACTACTGAAGAGGGTGAGCTTCTTGCTAAAAAACTAGAAGTCATGTTTATTGAAACGAGTGCGAAGGCTGGATATAATGTCAAAGTTCTGTTCCGTCGAATCGCTACAGAATTGGTCGATCAAAAg                                             ]


>consensus_7658#0 AAATTCGCTTGTGGCGGTAATTCGCGTGGCTAGTTCTTTGGTGCTGAGCGATGGCGGATT TTAACAATCCTTTGCAAAAGTTTAAGCTGGTGTTTTTGGGAGAACAGAGTGTCGGGAAGA CATCCCTCATTACTAGGTTTATGTATGAAACTTTTGATAATCTGTATCAGGCAACAATTG GTATTGACTTCTTATCAAAAACTATGTACCTTGAAGATCGAACTATTCGTCTGCAATTAT GGGACACTGCGGGACAGGAACGTTTTCGAAGTTTGATTCCCAGCTACATACGTGACTCTT CAGCTGCAGTTGTTGTTTATGACATATGCAATGCTGGATCTTTTCACCAGGCTTCAAAGT GGGTTGATGACGTCAGAAACGAACGTGGGGGGGATGTTATTATTATCCTCGTTGGAAACA AAACGGATCTGTCTGATAAAAGAAAAGTAACTACTGAAGAGGGTGAGCTTCTTGCTAAAA AACTAGAAGTCATGTTTATTGAAACGAGTGCGAAGGCTGGATATAATGTCAAAGTTCTGT TCCGTCGAATCGCTACAGAATTGGACGATCAAAATAGTCCACTATCCATACATGATGATT ATATTGAACTGAAACCAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)