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Schistosoma mansoni
cluster # 7659 cluster # 7659       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7659#0 length = 779 sequences # 5  

consensusID : consensus_7659#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 779
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTTTTAAAACCAAATACACTTTACTTCATAAAATCTTTTGAACAAAAACAAAAAATAATTAAGACTTTAAATTGGTGTACAAGGATAACTCAATACTTCTATTTCACAAATGGTGAAACAATAACCTTTTTTTAAAAAAAAGGGAACTTATGGTGTATGTATAGTGGAGACACATGGATCAACAACAATAAAAGATACATTTAAACAAAATTAGTCTATATATATGGAATAGGAATATATATATTTCGATTGGTTCTTCTATGACCAACCAAACATATAACCTAGTGCCTTAGAAAATAATCCAGAATCTCTATCTTGTCGAACACTTGTAGTTCGTGATAAATTAGTTGGTCGTGAAGATGCAGCTAATGATCGCATGGAATTATGTCGTCCAATATTGTTTGCTGATTTGT-CTGTAAAAATATTAGCAGAATCAGTGCCAGAATTGGTCGCACCATTACCAACACCGCCGACACCATTCAATGACCTTATTCCGCTTAAATCACGTAACGGTGTTTTATTCATTGCACCAGTTGTTGTTTTACAGTTTTCATCAATAGTACGTTTCATATTCATTGGATTATGATGACCGTTTGATGGACTAAGAAATGAGGAATCATTTACACTAGATGGGTTTGTTTGCTTTGAAACGAAACCACACTTATCATCATGCATAACTTGAGAATCGGTACAGACTGATACACCGACCATGGTATTATCCCCGAATACTTTGCCGTTNTTATTTAAAGCACAATGAGCTTGCATTTT]

[+] EMBL AI395551             [TTTTTTTTTTTTTTTTAAAACCAAATACACTTTACTTCATAAAATCTTTTGAACAAAAACAAAAAATAATTAAGACTTTAAATTGGTGTACAAGGATAACTCAATACTTCTATTTCACAAATGGTGAAACAATAACCTTTTTTT AAAAAAAGGGAACTTATGGTGTATGTATAGTGGAGACACATGGATCAACAACAATAAAAGATACATTTAAACAAAATTAGTCTATATATATGGAATAGGAATATATATATTTCGATTGGTTCTTCTATGACCAACCAAACATATAACCTAGTGCCTTAGAAAATAATCCAGAATCTCTATCTTGTCGAACACTTGTAGTTCGTGATAAATTAGTTGGTCGTGAAGATGCAGCTAATGATCGCATGGAATTATGTCGTCCAATATTGTTTGCTGATTTGTCCTGTAAAAATATTAACAGAATCAGTGgc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD073534             [                    CCAAATACACTTTACTTCATAAAATCTTTTGAACAAAAACAAAAAATAATTAAAACTTTAAATTGGTGTACAAGGATAACTCAATACTTCTATTTCACAAATGGTGAAACAATAACCTTTTTTTAAAAAAAAGGGAACTTATGGTGTATGTATAGTGGAGACACATGGATCAACAACAATAAAAGATACATTTAAACAAAATTAGTCTATATATATGGAATAGGAATATATATATTTCGATTGGTTCTTCTATGACCAACCAAACATATAACCTAGTGCCTTAAAAAATAATCCAAAATCTCTATCTTGTCAAACACTTGTAGTTCGTGATAAATTAGTTGGTCGTGAAAATGCAGCTAATGATCGCATGGAATTATGTCGTCCAATATTGTTTGCTGATTTGT CTGTAAAAATATTAGCAAAATCAGTGCCAAAATTGGTCGCACCATTACCAACACCGCCGACACCATTCAATGACCTTATTCCGCTTAAATCACGTAACGGTGTTTTATTCATTGCACCAGTTGTTGTTTTACAGTTTTCATCAATAGTA                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD075568             [                         TACACTTTACTTCATAAAATCTTTTGAACAAAAACAAAAAATAATTAAGACTTTAAATTGGTGTACAAGGATAACTCAATACTTCTATTTCACAAATGGTGAAACAATAACCTTTTTTTAAAAAAAAGGGAACTTATGGTGTATGTATAGTGGAGACACATGGATCAACAACAATAAAAGATACATTTAAACAAAATTAGTCTATATATATGGAATAGGAATATATATATTTCGATTGGTTCTTCTATGACCAACCAAACATATAACCTAGTGCCTTAGAAAATAATCCAGAATCTCTATCTTGTCGAACACTTGTAGTTCGTGATAAATTAGTTGGTCGTGAAGATGCAGCTAATGATCGCATGGAATTATGTCGTCCAATATTGTTTGCTGATTTGT CTGTAAAAATATTAGCAGAATCAGTGCCAGAATTGGTCGCACCATTACCAACACCGCCGACACCATTCAATGACCTTATTCCGCTTAAATCACGTAACGGTGTTTTATTCATTGCACCAGTTGTTGTTTTACAGTTTTCATCAATAGTACGTTTCATATTCATTGGATTATGATGACCGTTTGATGGACTAAGAAAATAGGA                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD096409             [                                                                                                                                                                                GGAGACACATGGATCAACAACAATAAAAGATACATTTAAACAAAATTAGTCTATATATATGGAATAGGAATATATATATTTCGATTGGTTCTTCTATGACCAACCAAACATATAACCTAGTGCCTTAGAAAATAATCCAGAATCTCTATCTTGTCGAACACTTGTAGTTCGTGATAAATTAGTTGGTCGTGAAGATGCAGCTAATGATCGCATGGAATTATGTCGTCCAATATTGTTTGCTGATTTGT CTGTAAAAATATTAGCAGAATCAGTGCCAGAATTGGTCGCACCATTACCAACACCGCCGACACCATTCAATGACCTTATTCCGCTTAAATCACGTAACGGTGTTTTATTCATTGCACCAGTTGTTGTTTTACAGTTTTCATCAATAGTACGTTTCATATTCATTGGATTATGATGACCGTTTGATGGACTAAGAAATGAGGAATCATTTACACTAGATGGGTTTGTTTGCTTTGAAACGAAACCACACTTATCATCATGCATAACTTGAGAATCGGTACAGACTGATACACCGACCATGGTATTATCCCCGAATACTTTGCCGTTNTTATTTAAAGCACAATGAGCTTGC     ]
[-] EMBL CD079081             [                                                                                                                                                                                                nCACCAATAAAAGATACATTTAAACANAATTAGTCTATATATATGGAATAGGAATATATATATTTCGATTGGTTCTTCTATGACCAACCAAACATATAACCTAGTGCCTTAGAAAATAATCCAGAATCTCTATCTTGTCGAACACTTGTAGTTCGTGATAAATTAGTTGGTCGTGAAGATGCAGCTAATGATCGCATGGAATTATGTCGTCCAATATTGTTTGCTGATTTGT CTGTAAAAATATTAGCAGAATCAGTGCCAGAATTGGTCGCACCATTACCAACACCGCCGACACCATTCAATGACCTTATTCCGCTTAAATCACGTAACGGTGTTTTATTCATTGCACCAGTTGTTGTTTTACAGTTTTCATCAATAGTACGTTTCATATTCATTGGATTATGATGACCGTTTGATGGACTAAGAAATAAGGAATCATTTACACTAGATGGGTTTGTTTGCTTTGAAAATAAACCACACTTATCATCATCCATAACTTGAGAATCGGTACAGACTGATACACCGACCATGGTATTATCCCCGAATACTTTGCCGTTTTTATTTAAAGCACAATGAGCTTGCATTTT]


>consensus_7659#0 TTTTTTTTTTTTTTTTAAAACCAAATACACTTTACTTCATAAAATCTTTTGAACAAAAAC AAAAAATAATTAAGACTTTAAATTGGTGTACAAGGATAACTCAATACTTCTATTTCACAA ATGGTGAAACAATAACCTTTTTTTAAAAAAAAGGGAACTTATGGTGTATGTATAGTGGAG ACACATGGATCAACAACAATAAAAGATACATTTAAACAAAATTAGTCTATATATATGGAA TAGGAATATATATATTTCGATTGGTTCTTCTATGACCAACCAAACATATAACCTAGTGCC TTAGAAAATAATCCAGAATCTCTATCTTGTCGAACACTTGTAGTTCGTGATAAATTAGTT GGTCGTGAAGATGCAGCTAATGATCGCATGGAATTATGTCGTCCAATATTGTTTGCTGAT TTGTCTGTAAAAATATTAGCAGAATCAGTGCCAGAATTGGTCGCACCATTACCAACACCG CCGACACCATTCAATGACCTTATTCCGCTTAAATCACGTAACGGTGTTTTATTCATTGCA CCAGTTGTTGTTTTACAGTTTTCATCAATAGTACGTTTCATATTCATTGGATTATGATGA CCGTTTGATGGACTAAGAAATGAGGAATCATTTACACTAGATGGGTTTGTTTGCTTTGAA ACGAAACCACACTTATCATCATGCATAACTTGAGAATCGGTACAGACTGATACACCGACC ATGGTATTATCCCCGAATACTTTGCCGTTNTTATTTAAAGCACAATGAGCTTGCATTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)