These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7664#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 971 fasta sequence [TCCGAGCCAATAATTCGGCACGAGGGAAAGTTATTAGGACAAATTATTGGTCAATTGGCAATCTTTTACCAAGTGTATCATTCAATAAGAAGAGTAAAAAATATTTATTTTTTCAAAAATCTGTTAATCAGAATAGTCGAGTGTGGAAAAGTGTATTTCGAGCAACATTGAGTTCATAATACCATATATATACTTTTTTCTGAATCCTGTTTTTGTTTGGATTAAGCGGATATACATGAATTCAAATTAATGAGTCATTTGAGATAAACATATAGAACAAATTTATTACTTACTTGCTTAAACATGCCACCCTTATTGAGGCATAGGCTAACAACTAGAGATCTCTAACCAAAATTGTGCTGAGTTCTTAATTTAGTTGTTGTCGGGTGTTATCCTTTTTCTTGATGTCTGCCCCCAGCTTCCGTTACCATGTCTTTTTCTGACTGCCTGTTTTCTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTAGGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGAGTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTCTAACTAATAGATATGG--AGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACTTGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTCTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGCTTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTCTTGAATGACAGTTCTTAAGTCCCAGATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTTTTAAATCTGCATGTGATCCTTCTTGTTTAGCGCTGATTTTGTTCATTTATGTAAAGGCTTTCACCTCTTCCAGGG-TTCACCACC-AGTGTAACT-TGA-TTGTA-CCACTTTA-TGTGCA-TAAAATCTTACATTTTTGTTTTTGA] [+] EMBL CD082847 [TCCGAGCCAATAATTCGGCACGAGGGAAAGTTATTAGGACAAATTATTGGTCAATTGGCAATCTTTTACCAAGTGTATCATTCAATAAGAAGAGTAAAAAATATTTATTTTTTCAAAAATCTGTTAATCAGAATAGTCGAGTGTGGAAAAGTGTATTTCGAGCAACATTGAGTTCATAATACCATATATATACTTTTTTCTGAATCCTGTTTTTGTTTGGATTAAGCGGATATACATGAATTCAAATTAATGAGTCATTTGAGATAAACATATAGAACAAATTTATTACTTACTTGCTTAAACATGCCACCCTTATTGAGGCATAGGCTAACAACTAGAGATCTCTAACCAAAATTGTGCTGAGTTCTTAATTTAGTTGTTGTCGGGTGTTATCCTTTTTCTTGATGTCTGCCCCCAGCTTCCGTTACCATGTCTTTTTCTGACTGCCTGTTTTCTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTAGGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGAGTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTCTAACTAATAGATATGG AGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAA ] [+] EMBL CD082217 [ acgagACTTTTTTCTGAATCCTGTTTTTGTTTGGATTATTCGGATATACATGAATTCAAATTAATGAGTCATTTGAGATAAACATATAGAACAAATTTATTACTTACTTGCTTAAACATGCCACCCTTATTGAGGCATAGGCTAACAACTAGAGATCTCTAACCAAAATTGTGCTGAGTTCTTAATTTAGTTGTTGTCGGGTGTTATCCTTTTTCTTGATGTCTGCCCCCAGCTTCCGTTACCATGTCTTTTTCTGACTGCCTGTTTTCTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTAGGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGAGTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTCTAACTAATAGATATGGNAACTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACTTGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTCTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGCTTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTCTTGAATGACAGTTCTTAAGTCCCAGATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTNTTAAATCTGCATGTGATCCTTCTTG TTAGCGCTGATTNTGNTCATTTATGTAAAGGGCTTCA CTCTTNCAGGG NTCACCANC AGTGTAACTNNGA TTGTA CCACTTTA TGTGCA TAAAAT ] [-] EMBL CD076433 [ CCCAGCTTCCGTTACCATGTCTTTTTCTGACTGCCTGTTTTCTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTAGGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGAGTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTCTAACTAATAGATATGG AGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACTTGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTCTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGCTTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTCTTGAATGACAGTTCTTAAGTCCCAGATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTTTTAAATCTGCATGTGATCCTTCTTGTTTAGCGCTGATTTTGTTCATTTATGTAAAGGCTTTCACCTCTTCCAGGGTTTCACCACCAAGTGTAACT TGATTTGTACCCACTTTATTGTGCATTAAAATCTTACATTTTTGTTTTTGA] [+] EMBL CD084309 [ gTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTAGGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGAGTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTCTAACTAATAGATATGG AGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACTTGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTCTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGCTTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTCTTGAATGACAGTTCTTAAGTCCCAGATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTTTTAAATCTGCATGTGATCCTTCTTGTTTAGCGCTGATTTTGTTCATTTATGTAAAGGCTTTCACCTCTTCCAGGG ] [-] EMBL CD075829 [ TTGCAACTAATTTGTTTTTTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTTTAACTAATAGATATGG AGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACTTGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTTTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGCTTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTTTTGAATGACAGTTTTTAAGTCCCAGATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTTTTAAATTTGCATGTGATCCTTTTTGTTTAGCGCTGATTTTGTTCATTTATGTAAAGGCTTTCACCTTTTTCAGGGTTTCACCCCCAAGTGTAACT TGATTTGTACCCCCTTTATTGTGCATTAAAATTTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||