These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7692#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1082 fasta sequence [CAAGAATCGGCACGAGGCCGCAAAAGTAATGCTGAACAAGATTATTATGACATTCTTGGGATAAGTAAATCAGCCTCGAATAGTGATGTTAAAAAAGCCTTCCGTAAACTAGCGTTAAAATATCATCCAGATAAAAATAAAGATGAAGACGCACAGAAAAAGTTTGTGAAAATTGCTGAAGCTTATGATGTTCTCTCTGATGATGAAAAACGTAGACAGTATGATAGTGTTGGACATAGTTATTATACACAACAGCCTGGTGGAAATGGTGCTCCAGATTTTGATTTTAATAGCTTCTTCCGAAACTTCGATATGTTTCGTCAGCACAGACATTCTGATGATCATGGTTCGTTCTTCAATTTCCGTGGATTATTTGACGACGATGATGGTGATGACGATGGCTTTTTTTCACCATTCGGCGGTATGTTCCATTCATCAGATGAATCTCATGGGTTTATTAGACATCAAGGTCAACAAAACTGTCAAACTCAAACTATACGAAGAGGTAACACAATTATTACTCAAACACGTTGTTCTTAATTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCACGGTTGTTTGCCCTCTTGATAAGCTTAAAATTTTGTACAGCCGATGATCGTTATTATAGTGGTTCACAACGTCATTTTGTGTATATGAACGTTGCATTAC-TTTTTCTATTAATCCACATAAAATAACTGGTTGTTTATATCACAAAGTGTTTTGTTTTTTTTGAAAAATGATTTTTATATACAAAGACGTATCTTTACTTGTTCATCTCTTCTGCTTTATTATGTTGAGACCATTGTCTTTCTCTTCTCATTGATTGATGTGGATAATTTTAAAAAGTAAAGAAAGTGTGTAAATGGGGATTTCCACAAACAATAGAAAAACCATGATAAATAAAAATTTCCATCACTTCATTTGTTGGATAGATATAACCAACTGTTGGTTTTTGTTTGGTTTAACAAATTTTCATAATAAAAATTAAAGCCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTTCCGTACTGCG] [+] EMBL CD081425 [CAAGAATCGGCACGAGGCCGCAAAAGTAATGCTGAACAAGATTATTATGACATTCTTGGGATAAGTAAATCAGCCTCGAATAGTGATGTTAAAAAAGCCTTCCGTAAACTAGCGTTAAAATATCATCCAGATAAAAATAAAGATGAAGACGCACAGAAAAAGTTTGTGAAAATTGCTGAAGCTTATGATGTTCTCTCTGATGATGAAAAACGTAGACAGTATGATAGTGTTGGACATAGTTATTATACACAACAGCCTGGTGGAAATGGTGCTCCAGATTTTGATTTTAATAGCTTCTTCCGAAACTTCGATATGTTTCGTCAGCACAGACATTCTGATGATCATGGTTCGTTCTTCAATTTCCGTGGATTATTTGACGACGATGATGGTGATGACGATGGCTTTTTTTCACCATTCGGCGGTATGTTCCATTCATCAGATGAATCTCATGGGTTTATTAGACATCAAGGTCAACAAAACTGTCAAACTCAAACTATACGAAGAGGTAACACAATTATTACTCAAACACGTTGTTCTTAATTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCACGGTTGTTTGCCCTCTTGATAAGCTTAAAATTNTGTACAGCCGATGATCGTTATTATAGTGGTTCACAACGTCAT ] [+] EMBL CD083719 [ gCGCACAGAAAAAGTTTGTGAAAATTGCTGAAGCTTATGATGTTCTCTCTGATGATGAAAAACGTAGACAGTATGATAGTGTTGGACATAGTTATTATACACAACAGCCTGGTGGAAATGGTGCTCCAGATTTTGATTTTAATAGCTTCTTCCGAAACTTCGATATGTTTCGTCAGCACAGACATTCTGATGATCATGGTTCGTTCTTCAATTTCCGTGGATTATTTGACGACGATGATGGTGATGACGATGGCTTTTTTTCACCATTCGGCGGTATGTTCCATTCATCAGATGAATCTCATGGGTTTATTAGACATCAAGGTCAACAAAACTGTCAAACTCAAACTATACGAAGAGGTAACACAATTATTACTCAAACACGTTGTTCTTAATTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCACGGTTGT ] [-] EMBL CD160021 [ ACAGCCTGGTGGAAATGGTGCTCCAGATTTTGATTTTAATAGCTTCTTCCGAAACTTCGATATGTTTCGTCAGCACAGACATCCTGATGATCATGGTTCGTTCTTCAATTTCCGTGGATTATTTGACGGCGATGATGGTGGTGACGATGGCTTTTCTTCACCATTCGGCGGTATGTTCCATTCATCAGATGAATCTCATGGGTTTATTAGACATCAAGGTCAACAAAACTGTCAAACTCAAACTATACGAAGAGGTAACACAATTATTACTCAAACACGTTGTTCTTAATTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCACGGTTGTTTGCCCTCTTGATAAGCTTAAAATTTTGTACA ] [-] EMBL CD075251 [ AAACACG TGTTCTTAATTACATCCTAAAAGTGATTTCATTGATATTATTTTGTACGATTTTACGGAAATGTCTCACGGTTGTTTGCCCTCTTGATAAGCTTAAAATTTTGTACAGCCGATGATCGTTATTATAGTGTTTCACAACGTCATTTTGTGTATATGAACGTTGCATTAC TTTTTCTATTAATCCACATAAAATAACTGGTTGTTTATATCACAAAGTGTTTTGTTTTTTTTGAAAAATGATTTTTATATACAAAGACGTATCTTTACTTGTTCATCTCTTCTGCTTTATTATGTTGAGACCATTGTCTTTCTCTTCTCATTGATTGATGTGGATAATTTTAAAAAGTAAAGAAAGTGTGTAAATGGGGATTTCCACAAACAATAGAAAAACCATGATAAATAAAAATTTCCATCACTTCATTTGTTGGATAGATATAACCAACTGTTGGTTTTTGTTTGGTTTAACAAATTTTCATAATAAAAATT ] [-] EMBL AI974968 [ CACAACGTCATTTTGTGTATATGAACGCTGCATAACTTTTTTCTATTAATCCACAAAAAATAATTGGTTGTTTAAATCACAAAGTGTTATGTTTTTTTTGAAAAATGATTTTTATATACAAAGACGTATCTTTACTTGTTCATCTATTCTGCTTTATTATGTTGAGACCATTGTCTTTCTCTTCTCATTGATTGATGAGAATAATTTTAAAAAGTAAAGAAAGTGTGTAAATGGGGATTTCCACAAACAATAGAAAAACCATGATAAATAAAAATTTCCATCACTTCATTTGTTGGATAGAAATAACCAACTGTTGGTTTTTGTTTGGTTTAACAAATTTTAATAATAAAAATTAAAGCCATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTTCCGTACTGCG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||