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Schistosoma mansoni
cluster # 7699 cluster # 7699       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7699#0 length = 474 sequences # 5  

consensusID : consensus_7699#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 474
fasta sequence
                              [TCATTTATTAGACAGACGATAGGTAGTCTTTGAAGTGATAATAATTGATGATATTCTACTCACAAAACCATGGATAATTATGTTTTTAGTGGGGAAGTTTTCAAACTTTTGACTATTAAGTTGGAGGGTCTGCTACTGATGTGTGCTAATTCGATCAAGATTTATAAATTGTGCAAAATTTTCACCTAATCTATTATTGATCAAGTACATAGTTCAGTTAACAAATGTTGACTAGTTGATGAAATACATATGAAAATAATGTAATATTTCGGACTCTTTAGTTTTAAAAAAAGAATGGTGACTACATAAAAAGTTAGTTATGTACTCCAGGTACTAACAGAATAATCTTAATGTATTTTCACATACGATCAATTCAGATTGTTGTATCAAAGTAAAAACTAACGTTTTACGCTTCAGATCACGACTAAGTTTGACTTCGTTGATTGTGAGAAATTTGTGTTCGTAAGAAGCAAA]

[+] EMBL CD093985             [TCATTTATTAGACAGACGATAGGTAGTCTTTGAAGTGATAATAATTGATGATATTCTACTCACAAAACCATGGATAATTATGTTTTTAGTGGGGAAGTTTTCAAACTTTTGACTATTAAGTTGGAGGGTCTGCTACTGATGTGTGCTAATTCGATCAAGATTTATAAATTGTGCAAAATTTTCACCTAATCTATTATTGATCAAGTACATAGTTCAGTTAACAAATGTTGACTAGTTGATGAAATACATATGAAAATAATGTAATATTTCGGACTCTTTAGTTTTAAAAAAAGAATGGTGACTACATAAAAAGTTAGTTATGTACTCCAGGTACTAACAGAATAATCTTAATGTATTTTCACATACGATCAATTCAGATTGTTGTATCAAAGTAAAAACTAACGTTTTACGCTTCAGATCACGACTAAGTTTGACTTCGTTGATTGTGAGAAAT                    ]
[+] EMBL CD093995             [TCATTTATTAGACAGACGATAGGTAGTCTTTGAAGTGATAATAATTGATGATATTCTACTCACAAAACCATGGATAATTATGTTTTTAGTGGGGAAGTTTTCAAACTTTTGACTATTAAGTTGGAGGGTCTGCTACTGATGTGTGCTAATTCGATCAAGATTTATAAATTGTGCAAAATTTTCACCTAATCTATTATTGATCAAGTACATAGTTCAGTTAACAAATGTTGACTAGTTGATGAAATACATATGAAAATAATGTAATATTTCGGACTCTTTAGTTTTAAAAAAAGAATGGTGACTACATAAAAAGTTAGTTATGTACTCCAGGTACTAACAGAATAATCTTAATGTATTTTCACATACGATCAATTCAGATTGTTGTATCAAAGTAAAAACTAACGTTTTACGCTTCAGATCACGACTAAGTTTGACTTCGTTGATTGTGAGAAAT                    ]
[+] EMBL CD093982             [TCATTTATTAGATAGACGATAGGTAGTCTTTGAAGTGATAATAATTGATGATATTCTACTCACAAAACCATGGATAATTATGTTTTTAGTGGGGAAGTTTTCAAACTTTTGACTATTAAGTTGGAGGGTCTGCTACTGATGTGTGCTAATTCGATCAAGATTTATGAATTGTGCAAAATTTTCACCTAATCTATTATTGATCAAGTACATAGTTCAGTTAACAAATGTTGACTAGTTGATGAAATACATATGAAAATAATGTAATATTTCGGACTCTTTAGTTTTAAAAAAAGAATGGTGACTACATAAAAAGTTAGTTATGTACTCCAGGTACTAACAGAATAATCTTAATGTATTTTCACATACGATCAATTCAGATTGTTGTATCAAAGTAAAAACTAACGTTTTACGCTTCAGATCACGACTAAGTTTGACTTCGTTGATTGTGAGAAAT                    ]
[+] EMBL CD094002             [TCATTTATTAGATAGACGATAGGTAGTCTTTGAAGTGATAATAATTGATGATATTCTACTCACAAAACCATGGATAATTATGTTTTTAGTGGGGAAGTTTTCAAACTTTTGACTATTAAGTTGGAGGGTCTGCTACTGATGTGTGCTAATTCGATCAAGATTTATAAATTGTGCAAAATTTTCACCTAATCTATTATTGATCAAGTACATAGTTCAGTTAACAAATGTTGACTAGTTGATGAAATACATATGAAAATAATGTAATATTTCGGACTCTTTAGTTTT AAAAAAGAATGGTGACTACATAAAAAGTTAGTTATGTACTCCAGGTACTAACAGAATAATCTTAATGTATTTTCACATACGATCAATTCAGATTGTTGTATCAAAGTAAAAACTAACGTTTTACGCTTCAGATCACGACTAAGTTTGACTTCGTTGATTGTGAGAAAT                    ]
[-] EMBL CD190078             [                                                                                                                                                                                                ATTATTGATCAAGTACATAGTTCAGTTAACAAGTGTTGACTAGTTGATGAAATACATATGAAAATAATGTAATATTTCGGACTCTTTAGTTTTAAAAAAAGAATGGTGACTACATAAAAAGTTAGTTATGTACTCCAGGTACTAACAGAATAATCTTAATGTATTTTCACATACGATCAATTCAGATTGTTGTATCAAAGTAAAAACTAACGTTTTACGCTTCAGATCACGACTAAGTTTGACTTCGTTGATTGTGAGAAATTTGTGTTCGTAAGAAGCAAA]


>consensus_7699#0 TCATTTATTAGACAGACGATAGGTAGTCTTTGAAGTGATAATAATTGATGATATTCTACT CACAAAACCATGGATAATTATGTTTTTAGTGGGGAAGTTTTCAAACTTTTGACTATTAAG TTGGAGGGTCTGCTACTGATGTGTGCTAATTCGATCAAGATTTATAAATTGTGCAAAATT TTCACCTAATCTATTATTGATCAAGTACATAGTTCAGTTAACAAATGTTGACTAGTTGAT GAAATACATATGAAAATAATGTAATATTTCGGACTCTTTAGTTTTAAAAAAAGAATGGTG ACTACATAAAAAGTTAGTTATGTACTCCAGGTACTAACAGAATAATCTTAATGTATTTTC ACATACGATCAATTCAGATTGTTGTATCAAAGTAAAAACTAACGTTTTACGCTTCAGATC ACGACTAAGTTTGACTTCGTTGATTGTGAGAAATTTGTGTTCGTAAGAAGCAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)