cluster # 7727

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Schistosoma mansoni
cluster # 7727 cluster # 7727 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7727#0 length = 483 sequences # 5

consensusID : consensus_7727#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 483
fasta sequence

                              [TATGTCATTTGTTATTCACTGAATATTAGTTTATTCATAACGACTTTCATATTTGATATTCCATAGTACTTATTTCAGTTTTGTTTACTACCACTACTGATTTGACACAGCTTCATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAAATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATAGTGCCAGTTGCAGGGTTATGCCAAGTGAAATTTCATACTCAATATCTATCGACTACTAAGTAGTAACAAACAATTATTCATGATAGATGAATGGTTGAATCTCTTTATGAAAGCTTTCTCAAC]

[+] EMBL CD159953             [TATGTCATTTGTTATTCACTGAATATTAGTTTATTCATAACGACTTTCATATTTGATATTCCATAGTACTTATTTCAGTTTTGTTTACTACCACTACTGATTTGACACAGCTTCATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAAATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATAGTGCCAGTTGCAGGGTTATGCCAAGTGAAATTTCATACTCAATATCTATCGACTACTA                                                                 ]
[+] EMBL CD159948             [TATGTCATTTGTTATTCACTGAATATTAGTTTATTCATAACGACTTTCATATTTGATATTCCATAGTACTTATTTCAGTTTTGTTTACTACCACTACTGATTTGACACAGCTTCATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAAATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTCTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATCCGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATAG                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD159910             [TATGTCATTTGTTATTCACTGAATATTAGTTTATTCATAACGACTTTCATATTTGATATTCCATAGTACTTATTTCAGTTTTGTTTACTACCACTACTGATTTGACACAGCTTCATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAAATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATct                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD159925             [                                                                                 TGTTTACTACCACTACTGATTGGACACAGCTTCATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACACTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAAATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATAGTGCCAGTTGCAGGGTTATGCCAAGTGAAATTTCATACTCAATATCTATCGACAACTAAGTAGTAACAAACAATTATTCATGATAGATGAATGGTTGAATCTCTTTATGAAAGCTTTCTCAAC]
[-] EMBL CD159913             [                                                                                                                  ATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAGATACCTAGAAAGTTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATAGTGCCAGTTGCAGGGTTATGCCAAGTGAAATTTCATACTCAATATCTATCGACTACTAAGTAGTAACAAACAATTATTCATGATAGATGAATGGTTGAATCTCTTTATGAAAGCTTTCTCAAC]




>consensus_7727#0
TATGTCATTTGTTATTCACTGAATATTAGTTTATTCATAACGACTTTCATATTTGATATT
CCATAGTACTTATTTCAGTTTTGTTTACTACCACTACTGATTTGACACAGCTTCATTCTG
TCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTA
AATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATAT
TTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTT
CTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATA
GTGCCAGTTGCAGGGTTATGCCAAGTGAAATTTCATACTCAATATCTATCGACTACTAAG
TAGTAACAAACAATTATTCATGATAGATGAATGGTTGAATCTCTTTATGAAAGCTTTCTC
AAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case