These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7727#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 483 fasta sequence [TATGTCATTTGTTATTCACTGAATATTAGTTTATTCATAACGACTTTCATATTTGATATTCCATAGTACTTATTTCAGTTTTGTTTACTACCACTACTGATTTGACACAGCTTCATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAAATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATAGTGCCAGTTGCAGGGTTATGCCAAGTGAAATTTCATACTCAATATCTATCGACTACTAAGTAGTAACAAACAATTATTCATGATAGATGAATGGTTGAATCTCTTTATGAAAGCTTTCTCAAC] [+] EMBL CD159953 [TATGTCATTTGTTATTCACTGAATATTAGTTTATTCATAACGACTTTCATATTTGATATTCCATAGTACTTATTTCAGTTTTGTTTACTACCACTACTGATTTGACACAGCTTCATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAAATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATAGTGCCAGTTGCAGGGTTATGCCAAGTGAAATTTCATACTCAATATCTATCGACTACTA ] [+] EMBL CD159948 [TATGTCATTTGTTATTCACTGAATATTAGTTTATTCATAACGACTTTCATATTTGATATTCCATAGTACTTATTTCAGTTTTGTTTACTACCACTACTGATTTGACACAGCTTCATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAAATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTCTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATCCGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATAG ] [+] EMBL CD159910 [TATGTCATTTGTTATTCACTGAATATTAGTTTATTCATAACGACTTTCATATTTGATATTCCATAGTACTTATTTCAGTTTTGTTTACTACCACTACTGATTTGACACAGCTTCATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAAATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATct ] [-] EMBL CD159925 [ TGTTTACTACCACTACTGATTGGACACAGCTTCATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACACTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAAATACCTAGAAAATTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATAGTGCCAGTTGCAGGGTTATGCCAAGTGAAATTTCATACTCAATATCTATCGACAACTAAGTAGTAACAAACAATTATTCATGATAGATGAATGGTTGAATCTCTTTATGAAAGCTTTCTCAAC] [-] EMBL CD159913 [ ATTCTGTCAATAATTCGTTGGCCTACATTCTGCTTTATCGTGCCTTGAAGAGTTACTATTGTCTTAGATACCTAGAAAGTTGAGTAACTCTTTTCTCAGAAAAATTTCTTTCTCTGACTTTAATATTTTACACTTAACTCAGTCGTTTGCCGCGAATCCTCGAACGGGTCGAATACATACGTTGTTCTTAATGTTACTTGAGTTTTGCTACAATATTCTTAACTTGATAGATCTATTATTTTAATAGTGCCAGTTGCAGGGTTATGCCAAGTGAAATTTCATACTCAATATCTATCGACTACTAAGTAGTAACAAACAATTATTCATGATAGATGAATGGTTGAATCTCTTTATGAAAGCTTTCTCAAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||