These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7728#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 914 fasta sequence [TAGATGAACTAATGATGTAATTGAAACAAATAATGGAACATGATAAATTATACAGTTTGTATACGAAAATAAAACTAGAATTCTAC-GTTAATCA-GTATATATCA-GGGGTAATCATCAT-GATTGAATATTTTAATTAG-TAAGCAGAGATGTTATGGTGGCTATCAATGGAATCCAGGACGCGACTTGTCAGCAGGATGTACCTGTATCGACTCTGGGACGCAGGTACATCCAGTTAATGAGTCACAAATAGGACGAAACGCGTTTCATGTATTCCTTTTATTACTACCATCATCTCTAGTTATAATTCTTGTGACATAAGGTGATATCGAGTCATTCCTCACAGGATGTACATATACTGAAAGAGATTGATCAATTTCAGTCCTAATCATCGATGGGAAAATTCAAACAACCAATACAAAAATGTACTTTAATT-AATGTTTAACAAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTG-TTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATATTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGATGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCGACGAAATGGCTGTTTACTGCTTCCTGGTTTATAATA] [+] EMBL CD084794 [TAGATGAACTAATGATGTAATTGAAACAAATAATGGAACATGATAAATTATACAGTTTGTATACGAAAATAAAACTAGAATTCTAC GTTAATCA GTATATATCA GGGGTAATCATCAT GATTGAATATTTTAATTAG TAAGCAGAGATGTTATGGTGGCTATCAATGGAATCCAGGACGCGACTTGTCAGCAGGATGTACCTGTATCGACTCTGGGACGCAGGTACATCCAGTTAATGAGTCACAAATAGGACGAAACGCGTTTCATGTATTCCTTTTATTACTACCATCATCTCTAGTTATAATTCTTGTGACATAAGGTGATATCGAGTCATTCCTCACAGGATGTACATATACTGAAAGAGATTGATCAATTTCAGTCCTAATCATCGATGGGAAAATTCAAACAACCAATACAAAAATGTACTTTAATTCAATGTTTAACAAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTG ] [+] EMBL CD084692 [ GATGAACTAATGATGTAATTGAAACAAATAATGGAACATGATAAATTATACAGTTTGTATACGAAAATAAAACTAGAATTCTACNGTTAATCANGTATATATCANGGGGTAATCATCATNGATTGAATATTTTAATTAGNTAAGCAGAGATGTTATGGTGGCTATCAATGGAATCCAGGACGCGACTTGTCAGCAGGATGTACCTGTATCGACTCTGGGACGCAGGTACATCCAGTTAATGAGTCACAAATAGGACGAAACGCGTTTCATGTATTCCTTTTATTACTACCATCATCTCTAGTTATAATTCTTGTGACATAAGGTGATATCGAGTCATTCCTCACAGGATGTACATATACTGAAGGAGATTGATCAATTTCAGTCCTAATCATCGATGGGAAAATTCAAACAACCAATACAAAAATGTACTTTAATT AATGTTTAACAAGGATATAGACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATC ] [-] EMBL CD084778 [ TTAATT AATGTTTAACAAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTG TTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATATTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGATGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCGACGAAATGGCTGTTTACTGCTTCCTGGTTTATAATA] [-] EMBL CD084734 [ AAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCAATTAAATTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTG TTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATATTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGACGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCGACGAAATGGCTGTATACTGC TCCTGGTTAATAAgc] [-] EMBL CD084793 [ CTTCTCTTTTTTTCAATTAAGTTTGTTCTTGAATTTGTCAATTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGAATTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTGTTTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATACTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGATGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCAACGAAATGGCTGTTTACTGCTTCCTGGTTTTTAATA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||