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Schistosoma mansoni
cluster # 7728 cluster # 7728       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7728#0 length = 914 sequences # 5  

consensusID : consensus_7728#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 914
fasta sequence
                              [TAGATGAACTAATGATGTAATTGAAACAAATAATGGAACATGATAAATTATACAGTTTGTATACGAAAATAAAACTAGAATTCTAC-GTTAATCA-GTATATATCA-GGGGTAATCATCAT-GATTGAATATTTTAATTAG-TAAGCAGAGATGTTATGGTGGCTATCAATGGAATCCAGGACGCGACTTGTCAGCAGGATGTACCTGTATCGACTCTGGGACGCAGGTACATCCAGTTAATGAGTCACAAATAGGACGAAACGCGTTTCATGTATTCCTTTTATTACTACCATCATCTCTAGTTATAATTCTTGTGACATAAGGTGATATCGAGTCATTCCTCACAGGATGTACATATACTGAAAGAGATTGATCAATTTCAGTCCTAATCATCGATGGGAAAATTCAAACAACCAATACAAAAATGTACTTTAATT-AATGTTTAACAAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTG-TTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATATTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGATGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCGACGAAATGGCTGTTTACTGCTTCCTGGTTTATAATA]

[+] EMBL CD084794             [TAGATGAACTAATGATGTAATTGAAACAAATAATGGAACATGATAAATTATACAGTTTGTATACGAAAATAAAACTAGAATTCTAC GTTAATCA GTATATATCA GGGGTAATCATCAT GATTGAATATTTTAATTAG TAAGCAGAGATGTTATGGTGGCTATCAATGGAATCCAGGACGCGACTTGTCAGCAGGATGTACCTGTATCGACTCTGGGACGCAGGTACATCCAGTTAATGAGTCACAAATAGGACGAAACGCGTTTCATGTATTCCTTTTATTACTACCATCATCTCTAGTTATAATTCTTGTGACATAAGGTGATATCGAGTCATTCCTCACAGGATGTACATATACTGAAAGAGATTGATCAATTTCAGTCCTAATCATCGATGGGAAAATTCAAACAACCAATACAAAAATGTACTTTAATTCAATGTTTAACAAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD084692             [  GATGAACTAATGATGTAATTGAAACAAATAATGGAACATGATAAATTATACAGTTTGTATACGAAAATAAAACTAGAATTCTACNGTTAATCANGTATATATCANGGGGTAATCATCATNGATTGAATATTTTAATTAGNTAAGCAGAGATGTTATGGTGGCTATCAATGGAATCCAGGACGCGACTTGTCAGCAGGATGTACCTGTATCGACTCTGGGACGCAGGTACATCCAGTTAATGAGTCACAAATAGGACGAAACGCGTTTCATGTATTCCTTTTATTACTACCATCATCTCTAGTTATAATTCTTGTGACATAAGGTGATATCGAGTCATTCCTCACAGGATGTACATATACTGAAGGAGATTGATCAATTTCAGTCCTAATCATCGATGGGAAAATTCAAACAACCAATACAAAAATGTACTTTAATT AATGTTTAACAAGGATATAGACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD084778             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTAATT AATGTTTAACAAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTG TTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATATTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGATGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCGACGAAATGGCTGTTTACTGCTTCCTGGTTTATAATA]
[-] EMBL CD084734             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCAATTAAATTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTG TTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATATTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGACGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCGACGAAATGGCTGTATACTGC TCCTGGTTAATAAgc]
[-] EMBL CD084793             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTTCTCTTTTTTTCAATTAAGTTTGTTCTTGAATTTGTCAATTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGAATTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTGTTTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATACTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGATGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCAACGAAATGGCTGTTTACTGCTTCCTGGTTTTTAATA]


>consensus_7728#0 TAGATGAACTAATGATGTAATTGAAACAAATAATGGAACATGATAAATTATACAGTTTGT ATACGAAAATAAAACTAGAATTCTACGTTAATCAGTATATATCAGGGGTAATCATCATGA TTGAATATTTTAATTAGTAAGCAGAGATGTTATGGTGGCTATCAATGGAATCCAGGACGC GACTTGTCAGCAGGATGTACCTGTATCGACTCTGGGACGCAGGTACATCCAGTTAATGAG TCACAAATAGGACGAAACGCGTTTCATGTATTCCTTTTATTACTACCATCATCTCTAGTT ATAATTCTTGTGACATAAGGTGATATCGAGTCATTCCTCACAGGATGTACATATACTGAA AGAGATTGATCAATTTCAGTCCTAATCATCGATGGGAAAATTCAAACAACCAATACAAAA ATGTACTTTAATTAATGTTTAACAAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTGT TCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGA ACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTGTTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAA ATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATATTGAGCATTCATTCTTCT ACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAG TTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGT GATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGATGGG TTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCGACGAAATGGCTGTTTACTGCTT CCTGGTTTATAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)