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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7736#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 780 fasta sequence
[TCACCTCAGGCAATTTTATATTCTGCTACAGTAATTTGCATGTATGGAAAGTAGTAAAATACCGGAAAAGAAAACTCGCAAACTTTCGAAAGCAACTGATTTTAGTATTCTTCCCGCTAACCAATTTTACAGAAAGTGGTGAGATTTCTAGATAGGTTCTGGTTGTCCATTAAACCCTATTTTTATTCGATTTTGTCACACAAAATTATAGATAATATTGTGAAAAACGCTATCCAACATTTCATGGATTAAT-CCCTTACCAGGAGGTTAGGTTTACAGCTTGGAATACGCAGACAGCAAACTCCCATTAAATGAAAACATTGGTAGTGCGGTCTCCTGATCACTGTGAATTACAATACATGTCTGAAATGTTTTTCTTTCTCGGACGTAATATGTAGCTTTAGAACTGGTCTGTACCACCGCCTAAACTGATCACAGAGAGTACGGCAGTTAAATGCGCTGGACTTATTTCGGTATCATTAGCCCTGGCAGATTTATTCTGCTGAAATATTAGTAAGGATTCAAAAAGCTCTTTTGGTTTTGGTCAACACGTATATCCGCTAACGGTGGGTGAGCATGCTGCTATGAAGTTTGCTTTGTATTACTCTATGGNTGT-AAACATGCTTAAGAGAAGTATAAGACGTGCGCAGGTTGCAGAATTTTGATCATAAGTGAATCCGAAACATTGTTCGGGTATCNCCCAAAGACTAATTGCGGAAAGATCATTGCCCCCAATCGTCCTCGTAAGGCCGAGGGTGGGGAAAGTCCGCTCTCCCTCTA]
[+] EMBL CD064672 [TCACCTCAGGCAATTTTATATTCTGCTACAGTAATTTGCATGTATGGAAAGTAGTAAAATACCGGAAAAGAAAACTCGCAAACTTTCGAAAGCAACTGATTTTAGTATTCTTCCCGCTAACCAATTTTACAGAAAGTGGTGAGATTTCTAGATAGGTTCTGGTTGTCCATTAAACCCTATTTTTATTCGATTTTGTCACACAAAATTATAGATAATATTGTGAAAAACGCTATCCAACATTTCATGGATTAAT CCCTTACCAGGAGGTTAGGTTTACAGCTTGGAATACGCAGACAGCAAACTCCCATTAAATGAAAACATTGGTAGTGCGGTCTCCTGATCACTGTGAATTACAATACATGTCTGAAATGTTTTTCTTTCTCGGACGTAATATGTAGCTTTAGAACTGGTCTGTACCACCGCCTAAACTGATCACAGAGAGTACGGCAGTTAAATGCGCTGGACTTATTTCGGTATCATTAGCCCTGGCAGATTTATTCTGCTGAAATATTAGTAAGGATTCAAAAAGCTCTTTTGGTTTTGGTCAACACGTATATCCGCTAACGGTGGGTGAGCATGCTGCTATGAAGTTTGCTTTGTATTACTCTATGGNTGT AAACAT ]
[+] EMBL CD064875 [TCACCTCAGGCAATTTTATATTCTGCTACAGTAATTTGCATGTATGGAAAGTAGTAAAATACCGGAGAAGAAAACTCGCAAACTTTCGAAAGCAACTGATTTTAGTATCCTTCCCGCTAACCAATTTTACAGAAAGTGGTGAGATTTCTAGATAGGTTCTGGTTGTCCATTAAACCCTATTTTTATTCGATTTTGTCACACAAAATTATAGATAATATTGTGAAAAACGCTATCCAACATTTCATGGATTAAT CCCTTACCAGGAGGTTAGGTTTACAGCTTGGAATACGCAGACAGCAAACTCCCATTAAATGAAAACATTGGTAGTGCGGTCTCCTGATCACTGTGAATTACAATACATGTCTGAAATGTTTTTCTTTCTCGGACGTAATATGTAGCTTTAGAACTGGTCTGTACCGCCGCCTAAACTGATCACAGAGAGTACGGCAGTTAAATGCGCTGGACTTATTTCGGTATCATTAGCCCTGGCAGATTTATTCTGCTGAAATATTAGTAAGGATTCANAAAGCTCTTTTGGTTNTGGTCAACACGTATATCCGCTAACGGTGGGTGAGCATGCTGCTATGAAGTTTGCTTTGTATTACTCTATGGNTGT AAAC ]
[+] EMBL CD163775 [ TTACAGAAAGTGGTGAGATTTCTAGATAGGTTCTGGTTGTCCATTAAACCCTATTTTTATTCGATTTTGTCACACAAAATTATAGATAATATTGTGAAAAACGCTATCCAACATTTCATGGATTAAT CCCTTACCAGGAGGTTAGGTTTACAGCTTGGAATACGCAGACAGCAAACTCCCATTAAATGAAAACATTGGTAGTGCGGTCTCCTGATCACTGTGAATTACAATACATGTCTGAAATGTTTTTCTTTCTCGGACGTAATATGTAGCTTTAGAACTGGTCTGTACCACCGCCTAAACTGATCACAGAGAGTACGGCAGTTAAGTGCGCTGGACTTATTTCGGTATCATTAGCCCTGGCA ]
[-] EMBL CD163665 [ TACAGAAAGTGGTGAGATTTCTAGATAGGTTCTGGTTGTCCATTAAACCCTATCTTTATTCGATTTTGTCACACAAAATTATAGATAATATTGTGAAAAACGCTATCCAACATTTCATGGATTAATCCCCTTACCAGGAGGTTAGGTTTACAGCTTGGAATACGCAGACAGCAAACTCCCATTAAATGAAAACATTGGTAGTGCGGTCTCCTGATCACTGTGAATTACAATACATGTCTGAAATGTTTTTCTTTCTCGGACGTAATATGTAGCTTTAGAACTGGTCTGTACCACCGCCTAAACTGATCACAGAGAGTACGGCAGTTAAATGCGCTGGACTTATTTCGGTATCATTAGCCCTGGCAGATTTATTCTGCTGAAATATTAGTAAGGATTCAAAAAGCTCTTTTGGTTTTGGTCAAC ]
[-] EMBL CD064694 [ AGTTAAATGCGCTGGACTTATTTCGGTATCATTAGCCCTGGCAGATTTATTCTGCTGAAATATTAGTAAGGATTCAAAAAGCTCTTTTGGTTTTGGTCAACACGTATATCCGCTAACGGTGGGTGAGCATGCTGCTATGAAGTTTGCTTTGTATTACTCTATGGTTGTAAAACATGCTTAAGAGAAGTATAAGACGTGCGCAGGTTGCAGAATTTTGATCATAAGTGAATCCGAAACATTGTTCGGGTATCNCCCAAAGACTAATTGCGGAAAGATCATTGCCCCCAATCGTCCTCGTAAGGCCGAGGGTGGGGAAAGTCCGCTCTCCCTCTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||