These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7738#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1220 fasta sequence [ACAGTCAGAGAGAGAATCGAAAGAAAACAAGTTTGGAAGCAAAACGGGTAGGAACTAGTTCTAACCTAAGAAAGGATATCTCATGAATGAACAAATAAACGAACAAAACGACGGTAGAACCAGGAGACAAAGTAATAACAGTAATTAATAATCATAGTAATAATAATAATGTTAAAGATGCCATCTTCAGTTTGTTTCTTTTTTTCATATGAATTAAGAGCATTTACCCATGTATCATCATCGGTTTAATGAAAAGACATATGAAGGACGGATTATAAAGAATGAATTAAAAAAAAGAATGGCATTGTGTATATATATATGCGTGTGTAAGAGGAATCTGGGACCAGAAAAATTAAAAAAAAAAACGATGAGCGAGAGTGCGAAGGAAAAACGTAATGAGAAGAGGAAATGAAAACTAGTTTAAACAGGTTAACCTACTATTCTGTTTTTTTTTCTGTAATCAACAATTTCATTTTTGAAAGAAAAAATGAAGGGAATTAATTAGTACAGACGATGAGAAATTGGTCTATTTTTGCTAAATGCTCTACTGTAAGAATTGAGTAATGCACCTTCAGTCGTACATATGTACGTAGGCATAGATACAAGAAAATATAACTAATTGACAGAAAAAAAAAACAAAACTTGCTTGTAGTATGTGAAAGTATTTACTAGATTAGAGGAGGGTAGAGTAGGGGAAGTCAGGGATTATTTATGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAAAGAGAAAGTAAGCTTCATCAGTACACTTTTTTTCAGTAGTAGTAAACATAGTGTTGCTGCAGAGACACAAACAAAAAGAAGGAAATTTAATATGGAAGATATTCAGTAATGGATCTTTGGGGTGGGGGCGGGAAGAGGGTGCGAGATAGGGATAATGACAATTTTCTCTCTCTTATC-GATCTAATAAAAATGATGAGATTAATATGACTATTGTAACTATCATTACTACCATTATTATTATTACCACCATCACTACTACTACTACTATTACTACTACCGTTTCTTATGGTACCCGATGGACTAGGAGTTAGTTATGTATACAAACTAATCATGATAATAATAAACAACGGTTTATTTAACCTTACAGTTACATATATCAAATTACATCCATTTTATTATCTGCTTTTTATCATCCATTATCTCACACGCATACACATATTCACCCTTATTATCCCTTCTCGGTACCTTGCTATCGCTATGGCGCTT] [-] EMBL CD201013 [ACAGTCAGAGAGAGAATCGAAAGAAAACAAGTTTGGAAGCAAAACGGGTAGGAACTAGTTCTAACCTAAGAAAGGATATCTCATGAATGAACAAATAAACGAACAAAACGACGGTAGAACCAGGAGACAAAGTAATAACAGTAATTAATAATCATAGTAATAATAATAATGTTAAAGATGCCATCTTCAGTTTGTTTCTTTTTTTCATATGAATTAAGAGCATTTACCCATGTATCATCATCGGTTTAATGAAAAGACATATGAAGGACGGATTATAAAGAATGAATTAAAAAAAAGAATGGCATTGTGTATATATATATGCGTGTGTAAGAGGAATCTATGACCAGAAAAATTAAAAA ] [-] EMBL AI976845 [ GGATATCTCATGAATGAACAAATAAACGAACAAAACGACGGTAGAACCAGGAGACAAAGTAATAACAGTAATTAATAATCATAGTAATAATAATAATGTTAAAGATGCCATCTTCAGTTTGTTTCTTTTTTTCATATGAATTAAGAGCATTTACCCATGTATCATCATCGGTTTAATGAAAAGACATATGAAGGACGGATTATAAAGAATGAATTAAAAAAAAGAATGGCATTGTGTATATATATATGCGTGTGTGAGAGGAATCAGGGACCAGAAAAATTAAAAAAAAAAACGATGAGCGAGAGTGCGAAGGAAAAACGTAATGAGAAGAGGAAATGAAAACTAGTTTAAACAGGTTAACCTACTATTCTGTTTTTTTTTCTGTAATCAACAATTTCATTTTTGAAAGAAAAAATGAAGGGAATTAATTAGTACAGACGATGAGAA ] [+] EMBL CD064692 [ GGGACCAGAAAAATT AAAAAAAAACGATGAGCGAGAGTGCGAAGGAAAAACGTAATGAGAAGAGGAAATGAAAACTAGTTTAAACAGGTTAACCTACTATTCTGTTTTTTTTTCTGTAATCAACAATTTCATTTTTGAAAGAAAAAATGAAGGGAATTAATTAGTACAGACGATGAGAAATTGGTCTATTTTTGCTAAATGCTCTACTGTAAGAATTGAGTAATGCACCTTCAGTCGTACATATGTACGTAGGCATAGATACAAGAAAATATAACTAATTGACAGAAAAAAAAAACAAAACTTGCTTGTAGTATGTGAAAGTATTTACTAGATTAGAGGAGGGTAGAGTAGGGGAAGTCAGGGATTATTTATGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAAAGAGAAAGTAAGCTTCATCAGTACACTTTTTTTCAGTAGTAGTAAACATAGTGTTGCTGCAGAGACACAAACAAAAAGAAGGAAATTTAATATGGAAGATATTCAGTAATGGATCTTTGGGGTGGGGGCGGGAAGAGGGTGCGAGATAGGGATAATGACAATTTTCTCTCTCTTATCNGA CTAATANAAATGATGAGATTAATATGACTATTGNAACTATCATTACTACCATTATTATTATTACCACCATCACTACTACTACTA ] [-] EMBL BF936162 [ AAAGTATTTACTAGATTAGAGGAGGGTAGAGTAGGGGAAGTCAGGGATTATTTATGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAAAGAGAAAGTAAGCTTCATCAGTACACTTTTTTTCAGTAGTAGTAAACATAGTGTTGCTGCAGAGACACAAACAAAAAGAAGGAAATTTAATATGGAAGATATTCAGTAATGGATCTTTGGGGTGGGGGCGGGAAGAGGGTGCGAGATAGGGATAATGACAATTTTCTCTCTCTTATC GATCTAATAAAAATGATGAGATTAATATGACTATTGTAACTATCATTACTACCATTATTATTATTACCACCATCACTACTACTACTACTATTACTACTACCGTTTCTTATGGTACCCGATGGACTAGGAGTTAGTTATGTATACAAACTAATCATGATAATAATAAACAACGGTTTATTTAACCTTACAGTTACATATATCAAATTACATCCATTTTATTATCTGCTTTTTATCATCCATTATCTCACACGCATACACATATTCACCCTTATTATCCCTTCTCGGTACCTTGCTATCGCTATGGCGCTT] [-] EMBL CD149268 [ TCAGTACACTTTTTTTCAGTAGTAGTAAACATAGTGTTGCTGCAGAGACACAAACAAAAAGAAGGAAATTTAATATGGAAGATATTCAGTAATGGATCTTTGGGGTGGGGGCGGGAAGAGGGTGCGAGATAGGGATAATGACAATTTTCTCTCTCTTATC GATCTAATAAAAATGATGAGATTAATATGACTATTGTAACTATCATTACTACCATTATTATTATTACCACCATCACTACTACTACTACTATTACTACTACCGTTTCTTATGGTACCCGATGGACTAGGAGTTAGTTATGTATACAAACTAATCATGATAATAATAAACAACGGTTTATTTAACCTTACAGTTACATATATCAAATTACATCCATTTTATTATCTGCTTTTTAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||