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Schistosoma mansoni
cluster # 7746 cluster # 7746       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7746#0 length = 718 sequences # 5  

consensusID : consensus_7746#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 718
fasta sequence
                              [ACGAAGTTTGTAATTGTCTATTCAATAAATTAGAATTATTTCTAGTAGATTCATATTTTGGATTTGAATCCAATGTTATATTAGGTGACAATCTAATGGTTACGCCTTCATTTTTTTCATTTGTAATATTTTCACTTAGTGAATCTAGAGCGTGAGTATTCAAAAGAACTTGATTATTGAATAGTTCGGTAGGAATTAGTCCTTTTGATGTTTCATCATCGAGGATCGAAGGTGATATTTGATTATTTGAAGGTACTAATTTATCAGATTGATGAGAAGCTTCTAACCTATTCGGTACATCATATTTAGACTTTGAATTTATAGTTAAAGTAGATGTACATGAGTTTGTATGAGTACCATCAAATGTGGAGTTTGTTAGTCCATTATGAGAATGGATTTCAAGAGGGTGAGATTTAATTTCAAAATCTTTTTCGATATTGCTTGATAATAATGGTACTTCGATGGAAATTTTACTAAAATGTAAAGCCGAATCTCTATGATTGAAATTAGGAGAAATAACTTTCGGTAATTGATTACTACTCTCTGAATTATGGTTTGGTAAATATTTTATTTCATGATTATGTATCTTCGGAGGGGTTTTGTTGTCTACAGATAAGGTATTCTTTTCTTCAATAGATAAAATTTCTGAACTATTTCCATTCATATTCGATGAAATCTTTTGAAATGATGAAGTAGTTGAAGATAATTCACTAATCAC]

[+] EMBL CD090619             [ACGAAGTTTGTAATTGTCTATTCAATAAATTAGAATTATTTCTAGTAGATTCATATTTTGGATTTGAATCCAATGTTATATTAGGTGACAATCTAATGGTTACGCCTTCATTTTTTTCATTTGTAATATTTTCACTTAGTGAATCTAGAGCGTGAGTATTCAAAAGAACTTGATTATTGAATAGTTCGGTAGGAATTAGTCCTTTTGATGTTTCATCATCGAGGATCGAAGGTGATATTTGATTATTTGAAGGTACTAATTTATCAGATTGATGAGAAGCTTCTAACCTATTCGGTACATCATATTTAGACTTTGAATTTATAGTTAAAGTAGATGTACATGAGTTTGTATGAGTACCATCAAATGTGGAGTTTGTTAGTCCATTATGAGAATGGATTTCAAGAGGGTGAGATTTAATTTCAAAATCTTTTTCGATATTGCTTGATAATAATGGTACTTCGATGGAAATTTTACTAAAATGTAAAGCCGAATCTCTATGATTGAAATTAGGAGAAATAACTTTCGGTAATTGATTACTACTCTCTGAATTATGGCTTGGTAAATATTTTATTTTATG                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD122309             [                                                                                                                                                                                                                                                 ATTATTTGAAGGTACTAATTTATCAGATTGATGAGAAGCTTCTAACCTATTCGGTACATCATATTTAGACTTTGAATTTATAGTTAAAGTAGATGTACATGAGTTTGTATGAGTACCATCAAATGTGGAGTTTGTTAGTCCATTATGAGAATGGATTTCAAGAGGGTGAGATTTAATTTCAAAATCTTTTTCGATATTGCTTGATAATAATGGTACTTCGATGGAAATTTTACCAAAATGTAAAGCCGAATCTCTATGATTGAAATTAGGAGAAATAACTTTCGGTAATTGATTACTACTCTCTGAATTATGGTTTGGTAAATATTTTATTTCATGATTATGTATCTTCGGAGGGGTTTTGTTGTCTACAGATAAGGTATTCTTTTCTTCAATAGATAAAATTTCTGAACTATTTCCATTCATATTCGATGAAATCTTTTGAAATGATGAAGTAGTTGAAGATAATTCACTAATCA ]
[-] EMBL CD122341             [                                                                                                                                                                                                                                                  TTATTTGAAGGTACTAATTTATCAGATTGATGAGAAGCTTCTAACCTATTCGGTACATCATATTTAGACTTTGAATTTATAGTTAAAGTAGATGTACATGAGTTTGTATGAGTACCATCAAATGTGGAGTTTGTTAGTCCATTATGAGAATGGATTTCAAGAGGGTGAGATTTAATTTCAAAATCTTTTTCGATATTGCTTGATAATAATGGTACTTCGATGGAAATTTTACTAAAATGTAAAGCCGAATCTCTATGATTGAAATTAGGAGAAATAACTTTCGGTAATTGATTACTACTCTCTGAATTATGGTTTGGTAAATATTTTATTTCATGATTATGTATCTTCGGAGGGGTTTTGTTGTCTACAGATAAGGTATTCTTTTCTTCAATAGATAAAATTTCTGAACTATTTCCATTCATATTCGATGAAATCTTTTGAAATGATGAAGTAGTTGAAGATAATTCACTAATCAC]
[-] EMBL CD122411             [                                                                                                                                                                                                                                                  TTATTTGGAGGTACTAATTTATCAGATTGATGAGAAGCTTCTAACCTATTCGGTACATCATATTTAGACTTTGAATTTATAGTTAAAGTAGATGTACATGAGTTTGTATGAGTACCATCAAATGTGGAGTTTGTTAGTCCATTATGAGAATGGATTTCAAGAGGGTGAGATTTAATTTCAAAATCTTTTTCGATATTGCTTGATAATAATGGTACTTCGATGGAAATTTTACTAAAATGTAAAGCCGAATCTCTATGATTGAAATTAGGAGAAATAACTTTCGGTAATTGATTACTACTCTCTGAATTATGGTTTGGTAAATATTTTATTTCATGATTATGTATCTTCGGAGGGGTTTTGTTGTCTACAGATAAGGTATTCTTTTCTTCAATAGATAAAATTTCTGAACTATTTCCATTCATATTCGATGAAATCTTTTGAAATGATGAAGTAGTTGAAGATAATTCACTAATCAC]
[-] EMBL CD059816             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGTACTTCGATGGAAATTTTACTAAAATGTAAAGCCGAATCTCTATGATTGAAATTAGGAGAAATAACTTTCGGTAATTGATTACTACTCTCTGAATTATGGTTTGGTAAATATTTTATTTCATGATTATGTATCTTCGGAGGGG                                                                                                                         ]


>consensus_7746#0 ACGAAGTTTGTAATTGTCTATTCAATAAATTAGAATTATTTCTAGTAGATTCATATTTTG GATTTGAATCCAATGTTATATTAGGTGACAATCTAATGGTTACGCCTTCATTTTTTTCAT TTGTAATATTTTCACTTAGTGAATCTAGAGCGTGAGTATTCAAAAGAACTTGATTATTGA ATAGTTCGGTAGGAATTAGTCCTTTTGATGTTTCATCATCGAGGATCGAAGGTGATATTT GATTATTTGAAGGTACTAATTTATCAGATTGATGAGAAGCTTCTAACCTATTCGGTACAT CATATTTAGACTTTGAATTTATAGTTAAAGTAGATGTACATGAGTTTGTATGAGTACCAT CAAATGTGGAGTTTGTTAGTCCATTATGAGAATGGATTTCAAGAGGGTGAGATTTAATTT CAAAATCTTTTTCGATATTGCTTGATAATAATGGTACTTCGATGGAAATTTTACTAAAAT GTAAAGCCGAATCTCTATGATTGAAATTAGGAGAAATAACTTTCGGTAATTGATTACTAC TCTCTGAATTATGGTTTGGTAAATATTTTATTTCATGATTATGTATCTTCGGAGGGGTTT TGTTGTCTACAGATAAGGTATTCTTTTCTTCAATAGATAAAATTTCTGAACTATTTCCAT TCATATTCGATGAAATCTTTTGAAATGATGAAGTAGTTGAAGATAATTCACTAATCAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)