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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7776#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 739 fasta sequence
[CGCGCCACATTAAAATCTTCGCTACTCAATCACATTGTTATCAGTTACCAATATTTAATAACTATGTTGCCTACACAAGAGGTGAATACACTGACAGAGATGTTAATATCTGGATATCGTCTAGATGGCCGGTCAATAAATGAATATCGTGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA-AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGCTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATTTGCTGTACGAGTTGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACATTAGCAGCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCGTCGACCAGATGTTTACGTTGATGATATGG-GTAAAGTACTAGTCGATTTTGAGGCTAAATTTCGACCTA-GAGTACCTTTAGGTATTCGTCGTACTC-C-AGTACTTGTTACACTTGGTTTAACTGCAGATGCANAAGTAGTTCTAGTTGATCCTACTGCTCGTGAAGAACTTATCCTGACTGGTGGACGTGTAT]
[+] EMBL CD155034 [CGCGCCACATTAAAATCTTCGCTACTCAATCACATTGTTATCAGTTACCAATATTTAATAACTATGTTGCCTACACAAGAGGTGAATACACTGACAGAGATGTTAATATCTGGATATCGTCTAGATGGCCGGTCAATAAATGAATATCGTGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGCTCTG ]
[+] EMBL CD181255 [ CAGAGATGTTAATATCTGGATATCGTCTAGATGGCCGGTCAATAAATGAATATCGTGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTANACA AAAACGTGATGATGAAGG ]
[+] EMBL CD078276 [ TGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGCTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATTTGCTGTACGAGTTGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACATTAGCAGCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCGTCGACCAGATGTTTACGTTGATGATATGG GTAAAGTACTAGTCGATTTTGAGGCTAAATTTCGACCTA GAGTACCTTTAGGTATTCGTCGTACTC C AGTACTTGTTACACTTGGTTTAACTGCAGATGCANAAGTAGTTCTAGTTGATCCTACTGCTCGTGAAGAACTTATCCTGACTGGTGGACGTGTAT]
[+] EMBL CD078360 [ TGAAATCAGCTTTCGTTTCCCTCAGGGGAAAGATCCTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCGATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACA AAAACGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTCGGATGCTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATTTGCTGTACGAGTTGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACACCACCACCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCCTCCACCAGATGTTTACGTTGATGATATGG GTAAAGTACTAGTCGATTTTGAGGCTAAATTTCGACCTA GAGTACCTTTAGGTATCCGACTCACTC C AGTACTTGNTACACTTGGTTTAACTGCAGATGCAAAAGTAGTTCTAGNTGATCCTACTGCTCGTGAAGAACTTATNCTGACTGGTGGACG ]
[-] EMBL CD155080 [ AAGATCGTAATGTTTCCGGTTGTTGTGTTGTTAAAATAGGCGCTACGACTGTAATGGCACAAGTTTCAGTTGAAGTAATTGAGCCTAAACATTTTCGCCCTTCTCAAGGAATGTTGTTTGTACACTTCCATGCTAGTATTTTAAAGTTATCTAAAACTCTATATCGTAAACAGAGAGCGTGATGATGAAGGTCGTCGTCTATCAGCTGTTCTCCAAACATTACTTCGAGATAGTATTGACTTGGATGTTCTGTGTATAGTTGCTTGGGAACGTGTATATGCTGTACGAGATGAATTACGTGCTTTATCTTATGATGGAAATTTAGGAGATTGTGGTACATTAGCAGCTGTTGCCGCTCTGGCAGCTTTTCGTCGACCAGATGTTTCCGTTGATGATATGGCGTAAAGTACTAGTCGATTTAGAGGGTAAATTTGGACGTATGAGTACCTTTAGGTATTAGTAGTACTCACGAGTA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||