These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7793#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1320 fasta sequence [CATGCTACTGCAAAAAATAAGATCAATTCGGTTGATGATCTACTGAATTCTCCTATTGTTCTAGCAACTGTAGCAATTGCTGTCACCAATTATTTCAATGTTATGGAATCAGATGAAAAAACAGTTGAACATTGTGGTGTTCTGATTAAATTCCTACAGAAAAAGTTGTCTGATCGAATATCATCATCATCATCATTGTCTGTTGATTCGTCTATTGTTCATCATTTTACTTCAATTCACACTGTATATAACTATTTACGATCGTTGACATATTTAATTGATGAATTGTTACCATCTGATCGAAAATCCAATTGTTTAAGCTTTCTTCCGTCATGGATATTCTTTCCATCTGGACATTTATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCAATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACGTTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACTATTCCTGTCATTGATTTGCTTAAAAATGAAATGCCTTCAAATCCCCCAAGTTCAGTTAGAACAACAAACACTGAAAAGAGCTTACAAGATAAATCAGAAGTCATCAAGAGATCACACTCTTCTATCAATATAAAGTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTCTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATGCCGCTCG-TTTACGTGCCAGGCTTGAAGAAACAGAATGAGATATCACCTATCTTTTTGTTGTTGTTGATT-ACTCTATCTTAGATTTGTCCATTTCCATCAACTACCGATTTTATTATGCCTTTCAAGTTAGAAATTATTCCGGTTATTTTCCATTTTCTGATTATATATTCCAAAATATCAGCATTTTTTA-TTGGAGAATATTAAGTTTTTGTTGCTGTGCTCATACTCCTATACCTTTCAACCAGCTTTTTTATTTAAAGTAAGTGTATCTCAGTTGAGCTGGAAACCCCTTGCTGTGAAAACATATCACTTAGTCTTTAAGGTTCCTAGTATTCTCTTGAAAACACAGATGAACTCGATGATGTGGGTAAAAATACCATTGAACACTTTACCGTTTATTTGAGTTCTGATCAACGTTATCTCAAGTATAATACTCCTATTTTCACACCTAAGTTTAATAA] [+] EMBL CD113121 [CATGCTACTGCAAAAAATAAGATCAATTCGGTTGATGATCTACTGAATTCTCCTATTGTTCTAGCAACTGTAGCAATTGCTGTCACCAATTATTTCAATGTTATGGAATCAGATGAAAAAACAGTTGAACATTGTGGTGTTCTGATTAAATTCCTACAGAAAAAGTTGTCTGATCGAATATCATCATCATCATCATTGTCTGTTGATTCGTCTATTGTTCATCATTTTACTTCAATTCACACTGTATATAACTATTTACGATCGTTGACATATTTAATTGATGAATTGTTACCATCTGATCGAAAATCCAATTGTTTAAGCTTTCTTCCGTCATGGATATTCTTTCCATCTGGACATTAATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCGATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACATTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACT ] [-] EMBL CD191739 [ ATCCAATTG TTAAGCTTTCTTCCGTCATGGATATTCTTTCCATCTGGACATTTATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCAATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACGTTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACTATTCCTGTCATTGATTTGCTTAAAAATGAAATGCCTTCAAATCCCCCAAGTTCAGTTAGAACAACAAACACTGAAAAGAGCTTACAAGATAAATCAGAAGTCATCAAGAGATCACACTCTTCTATCAATATAAAGTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTTTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATG ] [-] EMBL CD191840 [ CATGGATA TCTTCCCATCTGGACATTTATTTCATAGTCTTGCGATTGATATAGAATCACTTAAACCAGATGATAGATATCGTTTAACTTTACGCTATTGGCTCCCTCGCCTTTATCGTATTCCAAAGTTAAACGCTGAATTCGCAATGAAATTGCAAAAATTAGCTGAAATTTATGAACACGTAATAGGTATTGCAAGTGAGATGATACGTTTACCAGTATCTGCTCCAAATATTGTATATCAAAAGGTACCAACAACTATTCCTGTCATTGATTTGCTTAAAAATGAAATGCCTTCAAATCCCCCAAGTTCAGTTAGAACAACAAACACTGAAAAGAGCTTACAAGATAAATCAGAAGTCATCAAGAGATCACACTCTTCTATCAATATAAAGTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTCTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATG ] [+] EMBL CD178900 [ GTCAGATGCCCCACTGTCTAAACCTAAACAATCATTAAATGCATTACCTATTCGTCATTACTCAGAGAAAGCACTTGTAACGTCTAAAAAACAATCTCGAAAATTACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATGCCGCTCG TTTACGTGCCAGGCTTGAAGAAACAGAATGAGATATCACCTATCTTTTTGTTGTTGTTGATT ACTCTATCTTAGATTTGTCCATTTCCATCAACTACCGATTTTATTATGCCTTTCAAGTTAGAAATTATTCCGGTTATTTTCCATTTTCTGATTATATATTCCAAAATATCAGCATTTTTTA TTGGAGAATATTAAGTTTTTGTTGCTGTGCTCA ] [-] EMBL CD111678 [ ACCTTATCACTTACGCTCTACTGGTTATGCCGCTCGTTTTACGTGCCAGGCTTGAAGAAACAGAATGAGATATCACTTATCTTTTTGTTGTTGTTGATTAACTCTATCTTAGATTTGTCCATTTCCATTAACTACCGATTGTATTATGCCTTTCAAGTTAGAAATTATTCCGGTTATTTTCCATTGTCTGATGATATATGCCAAGATATCAGCATTTTTTATTTGGAGAATATTAAGTTTTTGTTGCTGTGCTCATACTCCTATACCTTTCAACCAGCTTTTTTATTTAAAGTAAGTGTATCTCAGTTGAGCTGGAAACCCCTTGCTGTGAAAACATATCACTTAGTCTTTAAGGTTCCTAGTATTCTCTTGAAAACACAGATGAACTCGATGATGTGGGTAAAAATACCATTGAACACTTTACCGTTTATTTGAGTTCTGATCAACGTTATCTCAAGTATAATACTCCTATTTTCACACCTAAGTTTAATAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||