These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7797#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1256 fasta sequence [ACTTTACGCGGACATAGTAAGAGCTACAAATCGAGATGAACGTACCACATACATTATTGTACTACTACTTACTCGTCAAATTGGTCTCATTTTTGGTCCTTCGTTTACACTAATGATGGCTAAAATGGATTATCGTGTAGCAAACTTTGCACTCAACGTCTACAATGGGCCTGGGCTTCTAATGGCAATATTATGGCTTTTACACTCATTTATTATATTTTTCTCATATCCAAATGTTGATAAAAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACGGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTGGATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGTGATTCTACTGATTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCTTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAGCTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAACGAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTATTCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGATTTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAGTATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTTGGAATACCTTTCACATATGCTTATTCAG-AATCGTTGTACACAAAACTTGCTCCAGTTTCTGATATGGATCGAGCACAAACTATTTTCCGTACTGTTATAAATGTAGCCTTCTTGGTTGGACCCTATGTTGGGAGGTTCTTTAATTGGATATCCAACTTTTAG-GTTCCTATCCATGTTTCTATTGTCGAGTTTCCCTACGTTACTCGTTGCTTGTCGATTCAAAGATTTCATTGTCAATGATAGACCTAATTCACCAAGTGAATTGGAGATAGCAAAAGAAAGCTAGTAGCTTATATATGAGCGATCTAATCATATGTCTTTCGTATTCATTGCACAGATTACTGTAAAAAATGATTCTCCTAATCACTTTACTGGACTTAATGTTCATGGTTATGAATCAAGGGGACATTGGTCGTTTTAATAATTCATTCTTAAGGTTTGTTTTACAGACTACTATCTTTGTAAATTAATCATTCTTTATTAATATGAATCATAT] [-] EMBL CD190687 [ACTTTACGCGGACATAGTAAGAGCTACAAATCGAGATGAACGTACCACATACATTATTGTACTACTACTTACTCGTCAAATTGGTCTCATTTTTGGTCCTTCGTTTACACTAATGATGGCTAAAATGGATTATCGTGTAGCAAACTTTGCACTCAACGTCTACAATGGGCCTGGGCTTCTAATGGCAATATTATGGCTTTTACACTCATTTATTATATTTTTCTCATATCCAAATGTTGATAAAAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACGGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTGGATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGTGATTCTACTGATTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCTTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTA ] [+] EMBL BF936570 [ ATGGTCAACGGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTGGATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGTGATTCTACTGATTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCTTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAGCTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAACGAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTATTCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGATTTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAGTATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTTGGAATACCTTTCACATATGCTTATTCAGAAATCGTTGTACACAAAACTTGCTCCAGTTTCTGATATGGATCGAGCACAAACTATTTTCCGTACTGTTATAAATGTAGCCTTCTTGGTTGGACCCTATGTTGGGAGGTTCTTTAATTGGATATCCAACTTTTAG ] [-] EMBL CD160278 [ TTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCTTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAGCTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAACGAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTATTCTTAATCAATGATATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGATTTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAGTATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTTGGAATACCTTTCACATATGCTTATTCAG AATCGTTGTACACAAAACTTGCTCCAGTTTCTGATATGGATCGAGCACAAACTATTTTCCGTACTGT ] [-] EMBL CD075292 [ ACAGGTATAGCAATACATGTACTTGGAATACCTTTCACATATGCTTATTCAG AATCGTTGTACACAAAACTTGCTCCAGTTTCTGATATGGATCGAGCACAAACTATTTTCCGTACTGTTATAAATGTAGCCTTCTTGGTTGGACCCTATGTT GGAGGTTCTTTAATTGGATATCCAAC TTTAGTGTTCCTATCCATGTTTCTATTGTCGAGTTTCCCTACGTTACTCGTTGCTTGTCGATTCAAAGATTTCATTGTCAATGATAGACCTAATTCACCAAGTGAATTGGAGATAGCAAAAGAAAGCTAGTAGCTTATATATGAGCGATCTAATCATATGTCTTTCGTATTCATTGCACAGATTACTGTAAAAAATGATTCTCCTAATCACTTTACTGGACTTAATGTTCATGGTTATGAATCAAGGGGACATTGGTCGTTTTAATAATTCATTCTTAAGGTTTGTTTTACAGACTACTATCTTTGTAAATTAATCATTCTTTATTAATATGAATCATAT] consensusID : consensus_7797#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 533 fasta sequence [AGATTCGGCACGAGGACAATGGTAGAGTTATTTATAATAATGGTCAACTGTCCTGTTGCGACCGCGATAATTGGATACAGTCTAATGAACAAGCGAAGGAGGATTCTCGACCAATGCTTAGCGATTCTACTGATTCGCTAAACTCTGGTCGGTTTAGTACTGCTGTTATAAACAATTCTTTACGACATTACCTATCGTTTAATATAATTGCTCCTTACTGTGTAAATTTCGCAGCATACTTCAGCTTTATGAGCTTAGAAGCAGCATTACCACCGGTAGCTAATCGTGTATTTCAATGGACTGAAGTGGAAACGAGCTATGTATATCTTGCTGCAAGCATTCTGATTATCTTCGTGGTAATATTGCTACGTATTCTTAATCAATTTTATACGGATCGTGTCTTACTATTAGCAGGTCTTGTTACTATGGTGATTTCTTACTTGTGGTTGACAGTAACAGTTTATTTACTTTCTGAAATCCCTTTACGAATGAGTATTCCTTTAACGCTCACAGGTATAGCAATACATGTACTT] [+] EMBL CD081467 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||