These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7823#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1073 fasta sequence [ATAATAACACAACATTAGTCTTTTCCTATTGTTATAACTATGGTATTGGTTCGATTCTTAACCATTAGTGGTACGTGTAGGTGTAACAGACAGACAGACAGAAAGAAAAAGAATGTTTGTTCTATGGGTTATTAGTAAGCTGATAAGCAATTGTTTTAATGAAAAAGAGTTGTATCGTATCGTTAGGAAACAAAAAGGATAAACAAATAAAGGATGGATTAGGGTTGAAATGTATGTTTTTTTTTTAAAAATGTTATACATGTATTCATTATCAATAAATAGACACACAGAGAGAGATGGATACTTAAAGAGCATAGAGGATCAAACAATTTAAATCATTCATTGAATCAATATCATTAATTAGTTATCATGTACAACAGAACATTATAAAGGATTGAATACACTTTTTTTATTAACCATAGTTACTATTGTTATTCAATGATTAAAACACAATCATTTGGCACTGTTATATATATTTCATTTGGACATTGAGATGAATGATTTTGAAAGGAAATAATTAAGGACAAATGAATGAATGGATGAGGTACAAAAACTAGACAAATTAAGATATACATCAGATGATGTAAGTGAGAAGACACAAAAAATTTTTTTAGTACGTTTTTTTCTTGGATTCAAAGTGTTTACAACAAACGGAAAAAAAAAGACCT--TGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGTGTGTTGATGAATTCATGACTAACAAAATATTGCCGATTTAACATAGTGACATTGAATAAATCATGAACGTGTCGATGGGAAATTGCCAATATATCCACCACCGATGTCG-CACCACCAGTGAGAGAACATGAGGAAGAATTATTTCGTCCAAATCCACCTGTTGTCATAGTTGTTGTTGGTGTTGTGGATATTGTTGACAAATTATTCTTAGTGGAATAATTTTCAGTTGATAAGATTTGCATATAAATATTTTTCAAATTAGTATCTGCATTGATAATACGTAATAACTCCACATAATGACGATTTTTATCAATATCATCAATATTTCTTAAACTGACTATCAATCCAAGAGCACACGATTTAATTCTTGCATTTTCTCCTC] [+] EMBL AI068220 [ATAATAACACAACATTAGTCTTTTCCTATTGTTATAACTATGGTATTGGTTCGATTCTTAACCATTAGTGGTACGTGTAGGTGTAACAGACAGACAGACAGAAAGAAAAAGAATGTTTGTTCTATGGGTTATTAGTAAGCTGATAAGCAATTGTTTTAATGAAAAAGAGTTGTATCGTATCGTTAGGAAACAAAAAGGATAAACAAATAAAGGATGGATTAGGGTTGAAATGTATGTTTTTTTTTTAAAAATGTTATACATGTATTCATTATCAATAAATAGACACACAGAGAGAGATGGATACTTAAAGAGCATAGAGGATCAAACAATTTAAATCATTCATTGAATCAATATCATTAATTAGTTATCATGTACAACAGAACATTATAAAGGATTGAATACACTTTTTTTATTAACCATAGTTACTATTGTTATTCAATGATTAAAACACAATCATTTGGCACTGTTATATATATTTCATTTGGACATTGAGATGAATGATTTTGAAAGGAAATAATTAAGGACAAATGAATGAATGGATGAGGTACAAAAACTAGACAAATTAAGATATACATCAGA ] [+] EMBL AI068344 [ATAATAACACAACATTAGTCTTTTCCTATTGTTATAACTATGGTATTGGTTCGATTCTTAACCATTAGTGGTACGTGTAGGTGTAACAGACAGACAGACAGAAAGAAAAAGAATGTTTGTTCTATGGGTTATTAGTAAGCTGATAAGCAATTGTTTTAATGAAAAAGAGTTGTATCGTATCGTTAGGAAACAAAAAGGATAAACAAATAAAGGATGGATTAGGGTTGAAATGTATGTTTTTTTTTTAAAAATGTTATACATGTATTCATTATCAATAAATAGACACACAGAGAGAGATGGATACTTAAAGAGCATAGAGGATCAAACAATTTAAA ] [-] EMBL CD114878 [ ATATATATTTCATTTGGACATTGAGATGAATGATTTTGAAAGGAAATAATTAAGGACAAATGAATGAATGGATGAGGTACAAAAACTAGACAAATTAAGATATACATCAGATGATGTAAGTGAGAAGACACAAAAAATTTTTTTAGTACGTTTTTTTCTTGGATTCAAAGTGTTTACAACAAACGGAAAAAAAAAGACCT TGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGTGTGTTGATGAATTCATGACTAACAAAATATTGCCGATTTAACATAGTGACATTGAATAAATCATGAACGTGTCGATGGGAAATTGCCTATATATCCACCACCGATGTCG CACCACCAGTGAGAGAACATGAGGAAGAATTATTTCGTCCAAATCCACCTGTTGTCATAGTTGTTGTTGGTGTTGTGTATATTGTTGACAAATTATTCTTAGTGGAATAATTTTCAGTTGATAAAATTTGCATATAAATATTTTTCAAATTAGTATCTGCATTGATAATACGTAATAACTCCA ] [-] EMBL CD114971 [ AATGAATGGATGAGGTACAAAAACTAGACAAATTAAGATATACATCAGATGATGTAAGTGAGAAGACACAAAAAATTTTTTTAGTACGTTTTTTTCTTGGATTCAAAGTGTTTACAACAAACGGAAAAAAAAAGACCT TGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGTGTGTTGATGAATTCATGACTAACAAAATATTGCCGATTTAACATAGTGACATTGAATAAATCATGAACGTGTCGATGGGAAATTGCCAATATATCCACCACCGATGTCGCCACCACCAGTGAGAGAACATGAGGAAGAATTATTTCGTCCAAATCCACCTGTTGTCATAGTTGTTGTTGGTGTTGTGGATATTGTTGACAAATTATTCTTAGTGGAATAATTTTCAGTTGATAAGATTTGCATATAAATATTTTTCAAATTAGTATCTGCATTGATAATACGTAATAACTCCA ] [-] EMBL CD084137 [ CAAACGG AAAAAAAAGACCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGGGTGTGTTGATGAATTCATGACTAACAAAATATTGCCAATTTAACATAGTGACATTGAATAAATCATGAACGTGTCGATGGGAAATTGCCAATATATCCACCACCGATGTCGCCACCACCAGTGAGAGAACATGAGGAAGAATTATTTCGTCCAAATCCACCTGTTGTCATAGTTGTTGTTGGTGTTGTGGATGTTGTTGACAAATTATTCTTAGTGGAATAATTTTCAGTTGATAAGATTTGCATATAAATATTTTTCAAATTAGTATCTGCATTGATAATACGTAATAACTCCACATAATGACGATTTTTATCAATATCATCAATATTTCTTAAACTGACTATCAATCCAAGAGCACACGATTTAATTCTTGCATTTTCTCCTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||