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Schistosoma mansoni
cluster # 7835 cluster # 7835       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7835#0 length = 754 sequences # 5  

consensusID : consensus_7835#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 754
fasta sequence
                              [GGCATTGGAAATTCATTAGTCATGGCTGGTGTTGTAGTAGTTATTATTGTTTCAAGTGGTGTATATATCGGTGCACAATCATCTTGTTTAATAACAGTATTATTGACGGAATAAGGTGAAGAGATTGATGATGAG-TAGCCAATAATGGAAGATTATCATTGAATAGAATATTTTGTTTATTATTGGTTGCA-TTTTTTGAAGCATTTAAGGCACAAGGTAATGTGATGGTGGATTGTACTTTTGAAGAATATGAAGAATTATTATTATCAAGTGTTGAGTCGAATATGACTGGTTTATTTGAATTACCTGAATTATTTGTCAACTGAGTAGTAAATAGTTTTAAAAGATCTGAAACTGTAATTCCATTTGACATAATTGGCACAGATTGATGCGTAACATGAAGTACAGTATTATTCGAGCACACTGGTAATGATGAAGCTACCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTTCATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAATTGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGCTAACATTTATTCCATGCCTTAATAAATTGTTAGGATATGGTGATAGCTGAGATGAAGAATGATGATATACAGCAATACCATTGCTTTCATCGACCAATGAAGTGACAATAGTCGATTCGAAAGAGTTGATAATACTTCCAGAAGTGGTAACAGTGGTAGT]

[+] EMBL CD169154             [GGCATTGGAAATTCATTAGTCATGGCTGGTGTTGTAGTAGTTATTATTGTTTCAAGTGGTGTATATATCGGTGCACAATCATCTTGTTTAATAACAGTATTATTGACGGAATAAGGTGAAGAGATTGATGATGAG TAGCCAATAATGGAAGATTATCATTGAATAGAATATTTTGTTTATTATTGGTTGCA TTTTTTGAAGCATTTAAGGCACAAGGTAATGTGATGGTGGATTGTACTTTTGAAGAATATGAAGAATTATTATTATCAAGTGTTGAGTCGAATATGACTGGTTTATTTGAATTACCTGAATTATTTGTCAACTGAGTAGTAAATAGTTTTAAAAGATCTGAAACTGTAATTCCATTTGACATAATTGGCACAGATTGATGCGTAACATGAAGTACAGTATTATTCGAGCACACTGGTAATGATGAAGCTACCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTTCATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAATTGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGC                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD169103             [GGCATTGGAAATTCATTAGTCATGGCTGGTGTTGTAGTAGTTATTATTGTTTCAAGTGGTGTATATATCGGTGCACAATCATCTTGTTTAATAACAGTATTATTGACGGAATAAGGTGAAGAGATTGATGATGAGTTAGCCAATAATGGAAGATTACCATTGAATAGAATATTTTGTTTATTATTGGTTGCATTTTTTTGAAGCATTTAAGGCACAAGGTAATGTGATGGTGGATTGTACTTTTGAAGAATATGAAGAATTATTATTATCAAGTGTTGAGTCGAATATGACTGGTTTATTTGAATTACCTGAATTATTTGTCAACTGAGTAGTAAATAGTTTTAAAAGATCTGAAACTGTAATTCCATTTGACATAATTGGCACAGATTGATGCGTAACACGAAGTACAGTATTATTCGAGCACACTGGTAATGATGAAGCTTCCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTTCATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAATTGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACT                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD169006             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGCACACTGGTAATGATGAAGCTACCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTTCATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAATTGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGCTAACATTTATTCCATGCCTTAATAAATTGTTAGGATATGGTGATAGCTGAGATGAAGAATGATGATATACAGCAATACCATTGCCTTCATCGACCAATGAAGTGACAATAGTCGATTCGAAAGAGTTGATAATACTTCCAGAAGTGGTAACAGTGGTAGT]
[-] EMBL CD169763             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTACCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTTCATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAATTGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGCTAACATTTATTCCATGCCTTAATAAATTGTTAGGATATGGTGATAGCTGAGATGAAGAATGATGATATACAGCAATACCATTGCTTTCATCGACCAATGAAGTGACAATAGTCGATTCGAAAGAGTTGATAATACTTCCAGAAGTGGTAACAGTGGTAGT]
[-] EMBL CD169800             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGCTAACATTTATTCCATGCCTTAATAAATTGTTAGGATATGGTGATAGCTGAGATGAAGAATGATGATATACAGCAATACCATTGCTTTCATCGACCAATGAAGTGACAATAGTCGATTCGAAAGAGTTGATAATACTTCCAGAAGTGGTAACAGTGGTAGT]


>consensus_7835#0 GGCATTGGAAATTCATTAGTCATGGCTGGTGTTGTAGTAGTTATTATTGTTTCAAGTGGT GTATATATCGGTGCACAATCATCTTGTTTAATAACAGTATTATTGACGGAATAAGGTGAA GAGATTGATGATGAGTAGCCAATAATGGAAGATTATCATTGAATAGAATATTTTGTTTAT TATTGGTTGCATTTTTTGAAGCATTTAAGGCACAAGGTAATGTGATGGTGGATTGTACTT TTGAAGAATATGAAGAATTATTATTATCAAGTGTTGAGTCGAATATGACTGGTTTATTTG AATTACCTGAATTATTTGTCAACTGAGTAGTAAATAGTTTTAAAAGATCTGAAACTGTAA TTCCATTTGACATAATTGGCACAGATTGATGCGTAACATGAAGTACAGTATTATTCGAGC ACACTGGTAATGATGAAGCTACCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTT CATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAAT TGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGCTAACAT TTATTCCATGCCTTAATAAATTGTTAGGATATGGTGATAGCTGAGATGAAGAATGATGAT ATACAGCAATACCATTGCTTTCATCGACCAATGAAGTGACAATAGTCGATTCGAAAGAGT TGATAATACTTCCAGAAGTGGTAACAGTGGTAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)