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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7835#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 754 fasta sequence
[GGCATTGGAAATTCATTAGTCATGGCTGGTGTTGTAGTAGTTATTATTGTTTCAAGTGGTGTATATATCGGTGCACAATCATCTTGTTTAATAACAGTATTATTGACGGAATAAGGTGAAGAGATTGATGATGAG-TAGCCAATAATGGAAGATTATCATTGAATAGAATATTTTGTTTATTATTGGTTGCA-TTTTTTGAAGCATTTAAGGCACAAGGTAATGTGATGGTGGATTGTACTTTTGAAGAATATGAAGAATTATTATTATCAAGTGTTGAGTCGAATATGACTGGTTTATTTGAATTACCTGAATTATTTGTCAACTGAGTAGTAAATAGTTTTAAAAGATCTGAAACTGTAATTCCATTTGACATAATTGGCACAGATTGATGCGTAACATGAAGTACAGTATTATTCGAGCACACTGGTAATGATGAAGCTACCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTTCATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAATTGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGCTAACATTTATTCCATGCCTTAATAAATTGTTAGGATATGGTGATAGCTGAGATGAAGAATGATGATATACAGCAATACCATTGCTTTCATCGACCAATGAAGTGACAATAGTCGATTCGAAAGAGTTGATAATACTTCCAGAAGTGGTAACAGTGGTAGT]
[+] EMBL CD169154 [GGCATTGGAAATTCATTAGTCATGGCTGGTGTTGTAGTAGTTATTATTGTTTCAAGTGGTGTATATATCGGTGCACAATCATCTTGTTTAATAACAGTATTATTGACGGAATAAGGTGAAGAGATTGATGATGAG TAGCCAATAATGGAAGATTATCATTGAATAGAATATTTTGTTTATTATTGGTTGCA TTTTTTGAAGCATTTAAGGCACAAGGTAATGTGATGGTGGATTGTACTTTTGAAGAATATGAAGAATTATTATTATCAAGTGTTGAGTCGAATATGACTGGTTTATTTGAATTACCTGAATTATTTGTCAACTGAGTAGTAAATAGTTTTAAAAGATCTGAAACTGTAATTCCATTTGACATAATTGGCACAGATTGATGCGTAACATGAAGTACAGTATTATTCGAGCACACTGGTAATGATGAAGCTACCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTTCATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAATTGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGC ]
[+] EMBL CD169103 [GGCATTGGAAATTCATTAGTCATGGCTGGTGTTGTAGTAGTTATTATTGTTTCAAGTGGTGTATATATCGGTGCACAATCATCTTGTTTAATAACAGTATTATTGACGGAATAAGGTGAAGAGATTGATGATGAGTTAGCCAATAATGGAAGATTACCATTGAATAGAATATTTTGTTTATTATTGGTTGCATTTTTTTGAAGCATTTAAGGCACAAGGTAATGTGATGGTGGATTGTACTTTTGAAGAATATGAAGAATTATTATTATCAAGTGTTGAGTCGAATATGACTGGTTTATTTGAATTACCTGAATTATTTGTCAACTGAGTAGTAAATAGTTTTAAAAGATCTGAAACTGTAATTCCATTTGACATAATTGGCACAGATTGATGCGTAACACGAAGTACAGTATTATTCGAGCACACTGGTAATGATGAAGCTTCCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTTCATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAATTGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACT ]
[-] EMBL CD169006 [ AGCACACTGGTAATGATGAAGCTACCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTTCATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAATTGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGCTAACATTTATTCCATGCCTTAATAAATTGTTAGGATATGGTGATAGCTGAGATGAAGAATGATGATATACAGCAATACCATTGCCTTCATCGACCAATGAAGTGACAATAGTCGATTCGAAAGAGTTGATAATACTTCCAGAAGTGGTAACAGTGGTAGT]
[-] EMBL CD169763 [ CTACCAATTGACTAGATGGCAATTTTGAACAGATTGTAATTTCATTTACAGATGGACAAGTTTGAACGCTACTATAACATACAGTAGGAGTACATGATAAATTGTTGATATTATCAAAAGAATTATTGTGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGCTAACATTTATTCCATGCCTTAATAAATTGTTAGGATATGGTGATAGCTGAGATGAAGAATGATGATATACAGCAATACCATTGCTTTCATCGACCAATGAAGTGACAATAGTCGATTCGAAAGAGTTGATAATACTTCCAGAAGTGGTAACAGTGGTAGT]
[-] EMBL CD169800 [ TGATTTGACACTGTAGAAGAATTTGAGCTAACATTTATTCCATGCCTTAATAAATTGTTAGGATATGGTGATAGCTGAGATGAAGAATGATGATATACAGCAATACCATTGCTTTCATCGACCAATGAAGTGACAATAGTCGATTCGAAAGAGTTGATAATACTTCCAGAAGTGGTAACAGTGGTAGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||