These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7836#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 796 fasta sequence [GATATGATCAGTCTACATATATTGGCAGAGCCAAACACTTTTTTATTACNACTAATCCTTTGAATGCTTTCAAAACACCTGCTGAATTAGAAGAAGCAAGGACCATTGTNCATAATTATAGGATAGGGATTATTCAGCCTGGTTTAACTGTANAAAAGCTTTGGCAGGCAAAAAATGTGTACGACTCAGCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATACTCATTGGACGCATGTCATTTCAGGTGCCTGGGAATATGTTTATAACGGGTTGTTTGCTACAGTTTTACAAGTCTACACCGGCTGTCATATTTTGGCAATGGTTTAACCAAACATTCAATGCCGTTGTAAATTATACTAATCGGAGTGGTGACGCACCTATTTCACTAACACGTCTTGGTATATCATATGTTTTGGCTACTGGTGGAGCATTAGGTACTGCATTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTCCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCAGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGAAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTA-GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAATGGCTTCTCCTGGAATGACAATTTTACCTTTTGTGATGCAATCATTAGAAAGACAAAAATTACTTATTCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTGATGTTATCACTTGTAAC] [+] EMBL AA559369 [GATATGATCAGTCTACATATATTGGCAGAGCCAAACACTTTTTTATTACNACTAATCCTTTGAATGCTTTCAAAACACCTGCTGAATTAGAAGAAGCAAGGACCATTGTNCATAATTATAGGATAGGGATTATTCAGCCTGGTTTAACTGTANAAAAGCTTTGGCAGGCAANAAATGTGTACNACTCACCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATNCTCATNGGACGCATGTCTTTTCAGGTGCCTGGGAATATGTTTATNACNGGTTGTTTGCTACA ] [+] EMBL CD201901 [ TCAGTCTACATACATTGGCAGAGCCAAACACTTTTTTATTACAACTAATCCTTTGAATGCTTTCAAAACACCTGCTGAATTAGAAGAAGCAAGGGCCATTGTTCATAATTATAGGATAGGGATTATTCAGCCTGGTTTAACTGTAGAAAGGCTTTGGCAGGCAAAAAATGTGTACGACTCAGCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATACTCATTGGACGCATGTCATTTCAGGTGCCTGGGAATATGTTTATAACGGGTTGTTTGCTACAGTTTTACAAGTCTACACCGGCTGTCATATTTTGGCAATGGTTTAACCAAACATTCAATGCCGTTGTAAATTATACTAATCGGAGTGGTGACGCACCTATTTCACTAACACGTCTTGGTATATCATATGTTTTGGCTACTGGTGGAGCATTAGGTACTGCATTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTCCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCAGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGAAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTANAAGCTG TANTCAAGTGGTTTTATCAC ] [-] EMBL CD151702 [ TTTGGCAGGCAAAAAATGTGTACGACTCAGCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATACTCATTGGACGCATGTCATTTCAGGTGCATGGGAATATGTTTATAACGGGTTGTTTGCTACAGTTTTACAAGTCTACACCGGCTGTCATATTTTGGCAATGGTTTAACCAAACATTCAATGCCGTTGTAAATTATACTAATCGGAGTGGTGACGCACCTATTTCACTAACACGTCTTGGTATATCATATGTTTTGGCTACTGGTGGAGCATTAGGCACTGCACTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTTCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCTGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGTAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTA GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAATGGCTTCTCCTGGAATGACAATTTTACCTTTTGTGATGCAATCATTAGAAAGACAAAAATTGCTTATTCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTAATGTTATCACTTGTAAC] [-] EMBL CD186506 [ ACTGCATTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTCCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCAGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGAAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTA GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAACGGCTTCTCCTGGAATGACAATTTTACCTTTTGTGATGCAATCATTAGAAAGACAAAAATTACTTATTCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTGATGTTAT ] [+] EMBL SMAA69224 [ TAGGACGTA GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAATGGCTTCTCCTGGAATGACAA TTACCTTTTATGATCGAATCATTAGAAAGACAAAAATTACTTATNCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTGATGTTATCACTTGTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||