Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7836 cluster # 7836       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7836#0 length = 796 sequences # 5  

consensusID : consensus_7836#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 796
fasta sequence
                              [GATATGATCAGTCTACATATATTGGCAGAGCCAAACACTTTTTTATTACNACTAATCCTTTGAATGCTTTCAAAACACCTGCTGAATTAGAAGAAGCAAGGACCATTGTNCATAATTATAGGATAGGGATTATTCAGCCTGGTTTAACTGTANAAAAGCTTTGGCAGGCAAAAAATGTGTACGACTCAGCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATACTCATTGGACGCATGTCATTTCAGGTGCCTGGGAATATGTTTATAACGGGTTGTTTGCTACAGTTTTACAAGTCTACACCGGCTGTCATATTTTGGCAATGGTTTAACCAAACATTCAATGCCGTTGTAAATTATACTAATCGGAGTGGTGACGCACCTATTTCACTAACACGTCTTGGTATATCATATGTTTTGGCTACTGGTGGAGCATTAGGTACTGCATTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTCCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCAGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGAAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTA-GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAATGGCTTCTCCTGGAATGACAATTTTACCTTTTGTGATGCAATCATTAGAAAGACAAAAATTACTTATTCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTGATGTTATCACTTGTAAC]

[+] EMBL AA559369             [GATATGATCAGTCTACATATATTGGCAGAGCCAAACACTTTTTTATTACNACTAATCCTTTGAATGCTTTCAAAACACCTGCTGAATTAGAAGAAGCAAGGACCATTGTNCATAATTATAGGATAGGGATTATTCAGCCTGGTTTAACTGTANAAAAGCTTTGGCAGGCAANAAATGTGTACNACTCACCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATNCTCATNGGACGCATGTCTTTTCAGGTGCCTGGGAATATGTTTATNACNGGTTGTTTGCTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD201901             [       TCAGTCTACATACATTGGCAGAGCCAAACACTTTTTTATTACAACTAATCCTTTGAATGCTTTCAAAACACCTGCTGAATTAGAAGAAGCAAGGGCCATTGTTCATAATTATAGGATAGGGATTATTCAGCCTGGTTTAACTGTAGAAAGGCTTTGGCAGGCAAAAAATGTGTACGACTCAGCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATACTCATTGGACGCATGTCATTTCAGGTGCCTGGGAATATGTTTATAACGGGTTGTTTGCTACAGTTTTACAAGTCTACACCGGCTGTCATATTTTGGCAATGGTTTAACCAAACATTCAATGCCGTTGTAAATTATACTAATCGGAGTGGTGACGCACCTATTTCACTAACACGTCTTGGTATATCATATGTTTTGGCTACTGGTGGAGCATTAGGTACTGCATTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTCCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCAGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGAAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTANAAGCTG TANTCAAGTGGTTTTATCAC                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD151702             [                                                                                                                                                               TTTGGCAGGCAAAAAATGTGTACGACTCAGCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATACTCATTGGACGCATGTCATTTCAGGTGCATGGGAATATGTTTATAACGGGTTGTTTGCTACAGTTTTACAAGTCTACACCGGCTGTCATATTTTGGCAATGGTTTAACCAAACATTCAATGCCGTTGTAAATTATACTAATCGGAGTGGTGACGCACCTATTTCACTAACACGTCTTGGTATATCATATGTTTTGGCTACTGGTGGAGCATTAGGCACTGCACTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTTCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCTGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGTAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTA GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAATGGCTTCTCCTGGAATGACAATTTTACCTTTTGTGATGCAATCATTAGAAAGACAAAAATTGCTTATTCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTAATGTTATCACTTGTAAC]
[-] EMBL CD186506             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTGCATTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTCCCTCCTATAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCATGTATGAGAAGTGCAGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGAAAAATTGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTA GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAACGGCTTCTCCTGGAATGACAATTTTACCTTTTGTGATGCAATCATTAGAAAGACAAAAATTACTTATTCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTGATGTTAT          ]
[+] EMBL SMAA69224            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAGGACGTA GAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATATTAATGGCTTCTCCTGGAATGACAA  TTACCTTTTATGATCGAATCATTAGAAAGACAAAAATTACTTATNCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTGATGTTATCACTTGTA  ]


>consensus_7836#0 GATATGATCAGTCTACATATATTGGCAGAGCCAAACACTTTTTTATTACNACTAATCCTT TGAATGCTTTCAAAACACCTGCTGAATTAGAAGAAGCAAGGACCATTGTNCATAATTATA GGATAGGGATTATTCAGCCTGGTTTAACTGTANAAAAGCTTTGGCAGGCAAAAAATGTGT ACGACTCAGCGTTTCATCCAGATACAGGAGAAAAAATGATACTCATTGGACGCATGTCAT TTCAGGTGCCTGGGAATATGTTTATAACGGGTTGTTTGCTACAGTTTTACAAGTCTACAC CGGCTGTCATATTTTGGCAATGGTTTAACCAAACATTCAATGCCGTTGTAAATTATACTA ATCGGAGTGGTGACGCACCTATTTCACTAACACGTCTTGGTATATCATATGTTTTGGCTA CTGGTGGAGCATTAGGTACTGCATTAACTATCAATAAACAAGTTCAAAAATTCCCTCCTA TAATTGGTCGATTTGTACCATTTATTGCAGTCAGTGCAGCTAATTGTATTAATATTCCAT GTATGAGAAGTGCAGAATTAACAGAAGGTACACCTATATTAGATGAAAATGGTGAAAAAT TGGGTAAATCAACTGTTGTAGGACGTAGAGCTGTTAGTCAAGTGGTTTTATCACGAATAT TAATGGCTTCTCCTGGAATGACAATTTTACCTTTTGTGATGCAATCATTAGAAAGACAAA AATTACTTATTCGTTATCCTTGGTTAGGAGCTCCAATACAAATTAGTTTAGTCGGTTTGA TGTTATCACTTGTAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)