These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7850#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 956 fasta sequence [GTGTGGCAGAAACAAGTATCTTTTGTAAAGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGGTCTACTAAACGTCCAGGTGTAGCTATTACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA-ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAGAAATGAGTGATGCCGATTTCACTTAGTCGCAGCCGTAAAAATTCGCCAATCTTAGCTACTTCATTGACAGATAGAGATTGTTTAAGGTCAGATGAAAAAAGTTCAGGCTTTGTAATCCAAAAGGGGAGAACTTCTTGGACATTATGTGCTTTGGATTTTGTTTTCTCATTTATAACTGTGAACCCTCCATAACACGATCTTTCGTTGCAGTATCACAATTCATAATCAGGAAACTGTGANACTATTGNATGCATCCCGTGTTGACATAGACAATTCAGCAGAGTCCTGCGTGTTACCGCATAACCT] [+] EMBL CD124892 [GTGTGGCAGAAACAAGTATCTTTTGTAAAGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGG ] [-] EMBL CD197627 [ CAAGTATCTTTTGTAAAGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGGTCTACTAAACGTCCAGGTGTAGCTATTACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTG ] [-] EMBL CD115383 [ AGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGGTCTACTAAACGTCCAGGTGTAGCTATTACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAG ] [+] EMBL CD133420 [ TACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAGAAATGAGTGATGCCGATTTCACTTAGTCGCAGCCGTAAAAATTCGCCAATCTTAGCTACTTCATTGACAGATAGAGATTGTTTAAGGTCAGATGAAAAAAGTTCAGGCTTTGTAATCCAAAAGGGGAGAACTTCTTGGACATTATGTGCTTTGGATTTTGTTTTCTCATTTATAACTGTGAACCCTCCATAACACGATCTTTCGTTGCAGTATCACAATTCATAATCAGGAAACTGTGANACTATTGNATGCATCCCGTGTTGACATAGACAATTCAGCAGAGTCCTGCGTGTTACCGCATAACCT] [-] EMBL CD165184 [ AAG ACTCCANNCCTGAATATCTGTCCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAGAAATGAGTGATGC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||