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Schistosoma mansoni
cluster # 7850 cluster # 7850       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7850#0 length = 956 sequences # 5  

consensusID : consensus_7850#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 956
fasta sequence
                              [GTGTGGCAGAAACAAGTATCTTTTGTAAAGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGGTCTACTAAACGTCCAGGTGTAGCTATTACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA-ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAGAAATGAGTGATGCCGATTTCACTTAGTCGCAGCCGTAAAAATTCGCCAATCTTAGCTACTTCATTGACAGATAGAGATTGTTTAAGGTCAGATGAAAAAAGTTCAGGCTTTGTAATCCAAAAGGGGAGAACTTCTTGGACATTATGTGCTTTGGATTTTGTTTTCTCATTTATAACTGTGAACCCTCCATAACACGATCTTTCGTTGCAGTATCACAATTCATAATCAGGAAACTGTGANACTATTGNATGCATCCCGTGTTGACATAGACAATTCAGCAGAGTCCTGCGTGTTACCGCATAACCT]

[+] EMBL CD124892             [GTGTGGCAGAAACAAGTATCTTTTGTAAAGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD197627             [            CAAGTATCTTTTGTAAAGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGGTCTACTAAACGTCCAGGTGTAGCTATTACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD115383             [                            AGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAACCAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGATTAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTTCTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAAAACCAGGAGTATTGTACAAATGGTCTACTAAACGTCCAGGTGTAGCTATTACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD133420             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TACAATGTCAACTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAACTTTTGATGCCAGCAAGAACTCCA ACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAGAAATGAGTGATGCCGATTTCACTTAGTCGCAGCCGTAAAAATTCGCCAATCTTAGCTACTTCATTGACAGATAGAGATTGTTTAAGGTCAGATGAAAAAAGTTCAGGCTTTGTAATCCAAAAGGGGAGAACTTCTTGGACATTATGTGCTTTGGATTTTGTTTTCTCATTTATAACTGTGAACCCTCCATAACACGATCTTTCGTTGCAGTATCACAATTCATAATCAGGAAACTGTGANACTATTGNATGCATCCCGTGTTGACATAGACAATTCAGCAGAGTCCTGCGTGTTACCGCATAACCT]
[-] EMBL CD165184             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAG ACTCCANNCCTGAATATCTGTCCCATTAACCAGCTGACTGAAGGTTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATCTATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGCTTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATGTGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAGAAATGAGTGATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_7850#0 GTGTGGCAGAAACAAGTATCTTTTGTAAAGTAATATCAACACTCCTATCGTAATGATAAC CAACAGTTGGTATAGGTCTTGAACGTTTGCGTACAGAGACATTGGACCAACTATTTTGAT TAGTTGAAGATGTGTAATAGTACAATACATCCTCTAAAGTATGGTACCAGTTTTGTTTTT CTTCAACTATCACTCGATCGGCTTCATCGATTACCAGGATTCTTAAACGTTCCATACTAA AACCAGGAGTATTGTACAAATGGTCTACTAAACGTCCAGGTGTAGCTATTACAATGTCAA CTTTGACAGAGTAACTTTCATTTGTAAGGTTTATAATATCTTCTTGTTCTTTACTAAAAC TTTTGATGCCAGCAAGAACTCCAACCTGAATATCTGTTCCATTAACCAGCTGACTGAAGG TTTTGTACACTTGAACAGCCAAATCTCTGACCGGGACAATGATTAAAGCTCGAATAAATC TATGGACCCTATTAAGAAATAGTTGGATGATTGGCACAGCATAAGCTAGTGTTTTCCCGC TTCCTGTCGGTGCGCAAATACATATGTCTCTTGGTCGACATAATGGCCTATGTTTAGATG TGAAGTAACAATCTAACATGTAAGGGATTACAGCAGACTGAACAGGAAAGAAATGAGTGA TGCCGATTTCACTTAGTCGCAGCCGTAAAAATTCGCCAATCTTAGCTACTTCATTGACAG ATAGAGATTGTTTAAGGTCAGATGAAAAAAGTTCAGGCTTTGTAATCCAAAAGGGGAGAA CTTCTTGGACATTATGTGCTTTGGATTTTGTTTTCTCATTTATAACTGTGAACCCTCCAT AACACGATCTTTCGTTGCAGTATCACAATTCATAATCAGGAAACTGTGANACTATTGNAT GCATCCCGTGTTGACATAGACAATTCAGCAGAGTCCTGCGTGTTACCGCATAACCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)