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Schistosoma mansoni
cluster # 7854 cluster # 7854       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7854#0 length = 1092 sequences # 5  

consensusID : consensus_7854#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1092
fasta sequence
                              [TTATACTGTTTGGTATCATCGTTCTTGGGTTATGAATAATCACACTTCTCCAAATTGGGAATCTGAATTAAAGCTTTGTAACCAAGCGTTAACACAAGATGAAAGAAATTTCCACTGTTGGGATTATCGTCGCTTTGTTGTTTCCAGGGGTAGAATTTCAACAGAGTTAGAGCTTGAGTTTACAGACTCTGCTATAGAAAAAAACATGAGCAATTATTCAGCTTGGCACTATCGTGGTGAACTTTTAGCTTCCACATCTAATGTTTCCTCTGTATCATCATCTGAAAGCCCTAATCTTCAAATCCAGTTGGATAAAAAACAAAGCCAATCTCGATTTGACTTTTCAGTACCAAATGGCGAACTGGATCTTGTTCACAATGCAATATTTACAGATCCTGCCGATCAGAGTCCTTGGTTCTATTATTGGTGGTTATTAGGTCGCGGAG-AAAAAAAGGTTTATTTAAGGGAACTGTATATTTCACGGAAGCTGGGAAGATTTGTTCTTGTTTTCAGCTCCGTGAAGTTGATTCAAACTTTAAAAG-AGTTGCA-GGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTAATTCTATAACTTTGACACCTGAGCTTCTTGGGGGATGGAACTCTGTCCTAGATGAGCAGTTATCAGCCGTTTGGTGGTTGCCGCTTAACCAAG-ATTTAGTATCTCGTTACGCTCCTGATAATGATAGGCACTTGTATCAGTGTCGACCTTGGAATGTCGTAGCGCAAGTCTGGATTAGGAAAGCTAATAGCAATGTAAACCAGGAAATCTGTGAAAACATGCCTGAAAATTCTGCAAATTACTTGTTCCTTCAGTGTTGTATGAATTCTCATCANAATGAATCATTGACACGTGTCACTCTAGACCCTCTAAGATTGTTAAATCCTATGATTTTGCCCTCACATAATCCAAAAGATTTGGTTGGGGAACTGAACATTGTTCGTGACCTGCTGTCATTTGAACCGAAAAACATATGGGCTTTGTTGACGCTTGTCAGTCTCCTTCCGTTTATTCGACCGCATAGTTTTCATGAAGACGTCAACGAAGCGTCAATTGTGTTATG]

[+] EMBL CD116897             [TTATACTGTTTGGTATCATCGTTCTTGGGTTATGAATAATCACACTTCTCCAAATTGGGAATCTGAATTAAAGCTTTGTAACCAAGCGTTAACACAAGATGAAAGAAATTTCCACTGTTGGGATTATCGTCGCTTTGTTGTTTCCAGGGGTAGAATTTCAACAGAGTTAGAGCTTGAGTTTACAGACTCTGCTATAGAAAAAAACATGAGCAATTATTCAGCTTGGCACTATCGTGGTGAACTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD160653             [                                                                                                              TCCACTGTTGGGATTATCGTCGCTTTGTTGTTTCCAGGGGTAGAATTTCAACAGAGTTAGAGCTTGAGTTTACAGACTCTGCTATAGAAAAAAACATGAGCAATTATTCAGCTTGGCACTATCGTGGTGAACTTTTAGCTTCCACATCTAATGTTTCCTCTGTATCATCATCTGAAAGCCCTAATCTTCAAATCCAGTTGGATAAAAAACAAAGCCAATCTCGATTTGACTTTTCAGTACCAAATGGCGAACTGGATCTTGTTCACAATGCAATATTTACAGATCCTGCCGATCAGAGTCCTTGGTTCTATTATTGGTGGTTATTAGGTCGCGGAG AAAAAAAGGTTTATTTAAGGGAACTGTATATTTCACGGAAGCTGGGAAGATTTGTTCTTGTTTTCAGCTCCGTGAAGTTGATTCAAACTTTAAAAG AGTTGCA GGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD082963             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGATCCTGCCGATCAGAGTCCTTGGTTCTATTATTGGTGGTTATTAGGTCGCGGAG AAAAAAAGGTTTATTTAAGGGAACTGTATATTTCACGGAAGCTGGGAAGATTTGTTCTTGTTTTCAGCTCCGTGAAGTTGATTCAAACTTTAAAAG AGTTGCA GGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTAATTCTATAACTTTGACACCTGAGCTTCTTGGGGGATGGAACTCTGTCCTAGATGAGCAGTTATCAGCCGTTTGGTGGTTGCCGCTTAACCAAG ATTTAGTATCTCGTTACGCTCCTGATAATGATAGGCACTTGTATCAGTGTCGACCTTGGAATGTCGTAGCGCAAGTCTGGATTAGGAAAGCTAATAGCAATGTAAACCAGGAAATCTGTGAAAACATGCCTGAAAATTCTGCAAATTACTTGTTCCTTCAGTGTTGTATGAATTCTCATCANAATGAATCATTGACACGTGTCACTCT                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD152945             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTATTATTGGTGGTTATTAGGTCGCGGAGAAAAAAAAGGTTTATTTAAGGGAACTGTATATTTCACGGAAGCTGGGAAGATTTGTTCTTGTTTTCAGCTCCGTGAAGTTGATTCAAACTTTAAAAG AGTTGCA GGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTAATTCTATAACTTTGACACCTGAGCTTCTTGGGGGATGGAACTCTGTCCTAGATGAGCAGTTATCAGCCGTTTGGTGGTTGCCGCTTAACCAAGAATTTAGTATCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD185735             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTTAAAAGAAGTTGCAGGGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTAATTCTATAACTTCGACACCTGAGCTTCTTGGGGGATGGAACTCTGTCCTAGATGAGCAGTTATCAGCCGTTTGGTGGTTGCCGCTTAACCAAG ATTTAGTATCTCGTTACGCTCCTGATAATGATAGGCACTTGTATCAGTGTCGACCTTGGAATGTCGTAGCGCAAGTCTGGATTAGGAAAGCTAATAGCAATGTAAACCAGGAAATCTGTGAAAACATGCCTGAAAATTCTGCAAATTACTTGTTCCTTCAGTGTTGTATGAATTCTCATCAAAATGAATCATTGACACGTGTCACTCTAGACCCTCTAAGATTGTTAAATCCTATGATTTTGCCCTCACATAATCCAAAAGATTTGGTTGGGGAACTGAACATTGTTCGTGACCTGCTGTCATTTGAACCGAAAAACATATGGGCTTTGTTGACGCTTGTCAGTCTCCTTCCGTTTATTCGACCGCATAGTTTTCATGAAGACGTCAACGAAGCGTCAATTGTGTTATG]


>consensus_7854#0 TTATACTGTTTGGTATCATCGTTCTTGGGTTATGAATAATCACACTTCTCCAAATTGGGA ATCTGAATTAAAGCTTTGTAACCAAGCGTTAACACAAGATGAAAGAAATTTCCACTGTTG GGATTATCGTCGCTTTGTTGTTTCCAGGGGTAGAATTTCAACAGAGTTAGAGCTTGAGTT TACAGACTCTGCTATAGAAAAAAACATGAGCAATTATTCAGCTTGGCACTATCGTGGTGA ACTTTTAGCTTCCACATCTAATGTTTCCTCTGTATCATCATCTGAAAGCCCTAATCTTCA AATCCAGTTGGATAAAAAACAAAGCCAATCTCGATTTGACTTTTCAGTACCAAATGGCGA ACTGGATCTTGTTCACAATGCAATATTTACAGATCCTGCCGATCAGAGTCCTTGGTTCTA TTATTGGTGGTTATTAGGTCGCGGAGAAAAAAAGGTTTATTTAAGGGAACTGTATATTTC ACGGAAGCTGGGAAGATTTGTTCTTGTTTTCAGCTCCGTGAAGTTGATTCAAACTTTAAA AGAGTTGCAGGTTTCCATAAAAGTGTTTCCCTGTGACGGTACAATTTCTAATTCTATAAC TTTGACACCTGAGCTTCTTGGGGGATGGAACTCTGTCCTAGATGAGCAGTTATCAGCCGT TTGGTGGTTGCCGCTTAACCAAGATTTAGTATCTCGTTACGCTCCTGATAATGATAGGCA CTTGTATCAGTGTCGACCTTGGAATGTCGTAGCGCAAGTCTGGATTAGGAAAGCTAATAG CAATGTAAACCAGGAAATCTGTGAAAACATGCCTGAAAATTCTGCAAATTACTTGTTCCT TCAGTGTTGTATGAATTCTCATCANAATGAATCATTGACACGTGTCACTCTAGACCCTCT AAGATTGTTAAATCCTATGATTTTGCCCTCACATAATCCAAAAGATTTGGTTGGGGAACT GAACATTGTTCGTGACCTGCTGTCATTTGAACCGAAAAACATATGGGCTTTGTTGACGCT TGTCAGTCTCCTTCCGTTTATTCGACCGCATAGTTTTCATGAAGACGTCAACGAAGCGTC AATTGTGTTATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)