Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 786 cluster # 786       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_786#0 length = 429 sequences # 2  

consensusID : consensus_786#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 429
fasta sequence
                              [CTGAAATGAATCAATCTAAACAAAATCTGAACAACACTGACATCGAAAATAATAATAATGAACAAGACCTATACAATGAATACAACCAAATTGAGCTAGATGCTAAAACTTTAAATGAATCGTTCAATACAATGAAACATTTAATATTTTCCGATTTCAATGCTGAACACAATGTAAACTCCCTTGAATTATTCTGTAATTGGTTAAATTCAGAACCTTATACAACATCTACAGATCATCTTTTTAAGGATCTTAATAAGTTAGATATATTGGATATACGTTCACAGACGTTACATAAAGAATGTATAAATCATTTTAAACATTCCATTGTACATAATCATCGATTAAATACAAATGAACTTCATGTTCAGCTAGATTCATTAAAGAATCATTGTAATGAATTAAATAGTCAATTGATTCAAGCACAAT]

[+] EMBL CD185569             [CTGAAATGAATCAATCTAAACAAAATCTGAACAACACTGACATCGAAAATAATAATAATGAACAAGACCTATACAATGAATACAACCAAATTGAGCTAGATGCTAAAACTTTAAATGAATCGTTCAATACAATGAAACATTTAATATTTTCCGATTTCAATGCTGAACACAATGTAAACTCCCTTGAATTATTCTGTAATTGGTTAAATTCAGAACCTTATACAACATCTACAGATCATCTTTTTAAGGATCTTAATAAGTTAGATATATTGGATATACGTTCACAGACGTTACATAAAGAATGTATAAATCATTTTAAACATTCCATTGTACATAATCATCGATTAAATACAAATGAACTTCATGTTCAGCTAGATTCATTAAAGAATCATTGTAATGAATTAAATAGTCAATTGATTCAAGCACAAT]
[+] EMBL CD185603             [                                                                                         ATTGAGCTAGATGCTAAAACTTTAAATGAATCGTTCAATACAATGAAACATTTAATATTTTCCGATTTCAATGCTGAACACAATGTAAACTCCCTTGAATTATTCTGTAATTGGTTAAATTCAGAATCTTATACAACATCTACAGATCATCTTTTTAAGGATCTTAATAAGTTAGATATATTGGATATACGTTCACAGACGTTACATAAAGAATGTATAAATCATTTTAAACATTCCATTGTACATAATCATCGATTAAATATAAATGAACTTCATGTTCAGCTAGATTCATTAAAGAATCATTGTAATGAATTAAATAGTCAATTGATTCAAGCACAAT]


>consensus_786#0 CTGAAATGAATCAATCTAAACAAAATCTGAACAACACTGACATCGAAAATAATAATAATG AACAAGACCTATACAATGAATACAACCAAATTGAGCTAGATGCTAAAACTTTAAATGAAT CGTTCAATACAATGAAACATTTAATATTTTCCGATTTCAATGCTGAACACAATGTAAACT CCCTTGAATTATTCTGTAATTGGTTAAATTCAGAACCTTATACAACATCTACAGATCATC TTTTTAAGGATCTTAATAAGTTAGATATATTGGATATACGTTCACAGACGTTACATAAAG AATGTATAAATCATTTTAAACATTCCATTGTACATAATCATCGATTAAATACAAATGAAC TTCATGTTCAGCTAGATTCATTAAAGAATCATTGTAATGAATTAAATAGTCAATTGATTC AAGCACAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)