Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7877 cluster # 7877       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7877#0 length = 838 sequences # 5  

consensusID : consensus_7877#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 838
fasta sequence
                              [ACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATAGTTAATAGTATATATGTATGTATTGTATATATGATAAAATACATAATTTAAGATAGATATGAAAATATTACAGCGGTAAATAATCGAACGAATATGAAACAAATATACATATATAGAGAGAGAGACGATGAATAATAAATAAGGAATCATAGAAGTATAAAAATGTTTTTTTTGGGGGGGGATAATGGTTAACCCGAAAATTTCCAAATGCATACTAAATTATTATCGGTTACTGCAACTAAATATTGTCCATCATGACTAATATCAGTTGTATTGACAACAGGATTTTTAAAACCAGAAGTAATACTTTCTTTCATTTGATTATCTTCATCTTTTGCACCACCTATACTACATTCTGGCCATTCAAGGATCTTTACAGGTTTTGATTTAAATTTTCGATTTTCTGATTCATCAATTACTTGTTTTTGTAGATCATATAACCATATAGTTCCTTCATTATCACCACATATGACAGCATTTAAACCAGGTCTAGCAGTAACATTAATATAAATTTCTTCTGTAGTATGCCAACGTAATTGACCACGAATTTCAACATTGATTATCTTCTTATTAGATACACTACTACGTCTACGACGATTAATAACCTGTCCATAATTAATCACATAAATTTCACCTTCTTCAACACATTTTGTTACAATTAAATCATCGGATAATTGAGCCAGACCATCAAAACATGGTTCACGACGAGTTGGAACTTTCAATTCAAGTTCAGCTTCTTTTTCATCACTTAGTTNTTCTTTACGAAAATCTTTCAA]

[+] EMBL AW017074             [ACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATAGTTAATAGTATATATGTATGTATTGTATATATGATAAAATACATAATTTAAGATAGATATGAAAATATTACAGCGGTAAATAATCGAACGAATATGAAACAAATATACATATATAGAGAGAGAGACGATGAATAATAAATAAGGAATCATAGAAGTATAAAAATGTTTTTTTTGGGGGGGGATAATGGTTAACCCGAAAATTTCCAAATGCATACTAAATTATTATCGGTTACTGCAACTAAATATTGTCCATCATGACTAATATCAGTTGTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BF936093             [                                                                  ATAGTATATATGTATGTATTGTATATATGATAAAATACATAATTTAAGATAGATATGAAAATATTACAGCGGTAAATAATCGAACGAATATGAAACAAATATACATATATAGAGAGAGAGACGATGAATAATAAATAAGGAATCATAGAAGTATAAAAATGTTTTTTTTGGGGGGGGATAATGGTTAACCCGAAAATTTCCAAATGCATACTAAATTATTATCGGTTACTGCAACTAAATATTGTCCATCATGACTAATATCAGTTGTATTGACAACAGGATTTTTAAAACCAGAAGTAATACTTTCTTTCATTTGATTATCTTCATCTTTTGCACCACCTATACTACATTCTGGCCATTCAAGGATCTTTACAGGTTTTGATTTAAATTTTCGATTTTCTGATTCATCAATTACTTGTTTTTGTAGATCATATAACCATATAGTTCCTTCATTATCACCACATATGACAGCATTTAAACCAGGTCTAGCAGTAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD125352             [                                                                                                                                                                                                     TAAATAAGGAATCATAGAAGTATAAAAATGTTTTTTTT GGGGGGGATAATGGTTAACCCGAAAATTTCCAAATGCATACTAAATTATTATCGGTTACTGCAACTAAATATTGTCGATCATGACTAATATCAGTTGTATTGACAACAGGATTTTTAAAACCAGAAGTAATACTTTCTTTCATTTGATTATCTTCATCATTTGCACCACCTATACTACATTCTGGCCATTCAAGGATCTTTACAGGTTTTGATTTAAATTTTCGATTTTCTGATTCATCAATTACTTGTTTTTGTAGATCATATAACCATATAGTTCCTTCATTATCACCACATATGACAGCATTTAAACCAGGTCTAGCAGTAACATTAATATAAATTTCTTCTGTAGTATGCCAACGTAATTGACCACGAATTTCAACATTGATTATCTTCTTATTAGATACACTACTACGTCTACGACGATTAATAACCTGTCCATAATTAATCACATAAATTTCACCTTCTTCAACACATTTTGTTACAATTAAATCATCGGATAATTGAGCCAGACCATCAAAACATGGTTCACGACGAGTTGGAACTTTCAATTCAAGTTCAGCTTCTTTTTCATCACTTAGTTNTTCTTTACGAAAATCTTTCAA]
[+] EMBL CD125225             [                                                                                                                                                                                                     TAAATAAGGAATCATAGAAGTATAAAAATGTTTTTTTT GGGGGGGATAATGGTTAACCCGAAAATTTCCAAATGCATACTAAATTATTATCGGTTACTGCAACTAAATATTGTCCATCATGACTAATATCAGTTGTATTGACAACAGGATTTTTAAAACCAGAAGTAATACTTTCTTTCATTTGATTATCTTCATCTTTTGCACCACCTATACTACATTCTGGCCATTCAAGGATCTTTACAGGCTTTGATTTAAATTTTCGATTTTCTGATTCATCAATTACTTGTTTTTGTAGATCATATAACCATATAGTTCCTTCATTATCACCACATATGACAGCATTTAAACCAGGTCTAGCAGTAACATTAATATAAATTTCTTCTGTAGTATGCCAACGTAATTGACCACGAATTTCAACATTGATTATCTTCTTATTAGATACACTACTACGTCTACGACGATTAATAACCTGTCCATAATTAATCACATAAATTTCACCTTCTTCAACACATTTTGTTACAATTAAATCATCGGATAATTGAGCTAGACCATCANAACATG                                                                               ]
[-] EMBL CD133928             [                                                                                                                                                                                                                                                      ATGGTTAACCCGAAAATTTCCAAATGCATACTAAATTATTATCGGTTACTGCAACTAAATATTGTCCATCATGACTAATATCAGTTGTATTGACAACAGGATTTTTAAAACCAGAAGTAATACTTTCTTTCATTTGATTATCTTCATCTTTTGCACCACCTATACTACATTCTGGCCATTCAAGGATCTTTACAGGTTTTGATTTAAATTTTCGATTTTCTGATTCATCAATTACTTGTTTTTGTAGATCATATAACCATATAGTTCCTTCATTATCACCACATATGACAGCATTTAAACCAGGTCTAGCAGTAACATTAATATAAATTCCTTCTGTAGTAT                                                                                                                                                                                                                                                          ]


>consensus_7877#0 ACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCA TAGTTAATAGTATATATGTATGTATTGTATATATGATAAAATACATAATTTAAGATAGAT ATGAAAATATTACAGCGGTAAATAATCGAACGAATATGAAACAAATATACATATATAGAG AGAGAGACGATGAATAATAAATAAGGAATCATAGAAGTATAAAAATGTTTTTTTTGGGGG GGGATAATGGTTAACCCGAAAATTTCCAAATGCATACTAAATTATTATCGGTTACTGCAA CTAAATATTGTCCATCATGACTAATATCAGTTGTATTGACAACAGGATTTTTAAAACCAG AAGTAATACTTTCTTTCATTTGATTATCTTCATCTTTTGCACCACCTATACTACATTCTG GCCATTCAAGGATCTTTACAGGTTTTGATTTAAATTTTCGATTTTCTGATTCATCAATTA CTTGTTTTTGTAGATCATATAACCATATAGTTCCTTCATTATCACCACATATGACAGCAT TTAAACCAGGTCTAGCAGTAACATTAATATAAATTTCTTCTGTAGTATGCCAACGTAATT GACCACGAATTTCAACATTGATTATCTTCTTATTAGATACACTACTACGTCTACGACGAT TAATAACCTGTCCATAATTAATCACATAAATTTCACCTTCTTCAACACATTTTGTTACAA TTAAATCATCGGATAATTGAGCCAGACCATCAAAACATGGTTCACGACGAGTTGGAACTT TCAATTCAAGTTCAGCTTCTTTTTCATCACTTAGTTNTTCTTTACGAAAATCTTTCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)