These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7905#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 592 fasta sequence [TAGTTTTAGATGGTAAAAGCTATGAACCTGAGGAATTACTCAACTTAATTGAACGATTACGACAAGATATTCGAGGATACACTGATCACATAAGATGGCTTGAACAAGAATTGAGTCAAACAAGAATCACTTTAAACGCTCGAGACAGAGATATAGACAAATTGAAATCAGTTTTAGACCAAAAACTTCATAATAATAATGTGGCACAACTACCTATCTATCCCGTTACACCAATATCCGATACATCACGTCAAACAATTAAACAAAATACGTTAAATGTAACCGGAATAACACCTACATTAAATGCAACTGGTATGCCTGAAAGCATTGGACAACAAATGTCTGCAGACAAATTACGCACTAAGAAACAAGGTGTTTCAGGTGAAAGTTTCACTGGAGATCAATTATCAGGTCTTGTACATCATGATAAAGATACTTGGTCTTCTAGTTTAATTCGAGATGCTATTAGTAATAATACATTTTTGAAGCATTTGGAACCATCACAAATTGAAGAAATAGTAGCTTGTATGTATAAAAAACAAATACCTCATGGATGTTTTATTATACGTGAAGGTGAACCAGGCGATGCATT] [+] EMBL CD114901 [TAGTTTTAGATGGTAAAAGCTATGAACCTGAGGAATTACTCAACTTAATTGAACGATTACGACAAGATATTCGAGGATACACTGATCACATAAGATGGCTTGAACAAGAATTGAGTCAAACAAGAATCACTTTAAACGCTCGAGACAGAGATATAGACAAATTGAAATCAGTTTTAGACCAAAAACTTCATAATAATAATGTGGCACAACTACCTATCTATCCCGTTACACCAATATCCGATACATCACGTCAAACAATTAAACAAAATACGTTAAATGTAACCGGAATAACACCTACATTAAATGCAACTGGTATGCCTGAAAGCATTGGACAACAAATGTCTGCAGACAAATTACGCACTAAGAAACAAGGTGTTTCAGGTGAAAGTTTCACTGGAGATCAATTATCAGGTCTTGTACATCATGATAAAGATACTTGGTCTTCTAGTTTAATTCGAGATGCTATTAGTAATAATACATTTTTGAAGCATTTGGAACCATCACAAATTGAAGAAATAGTAGCTTGTATGTATAAAAAACAAATACCTCATGGATGTTTTATTATACGTGAAGGTGAACCAGGCGATGCATT] [+] EMBL CD114902 [TAGTTTTAGATGGTAAAAGCTATGAACCTGAGGAATTACTCAACTTAATTGAACGATTACGACAAGATATTCGAGGATACACTGATCACATAAGATGGCTTGAACAAGAATTGAGTCAAACAAGAATCACTTTAAACGCTCGAGACAGAGATATAGACAAATTGAAATCAGTTTTAGACCAAAAACTTCATAATAATAATGTGGCACAACTACCTATCTATCCCGTTACACCAATATCCGATACATCACGTCAAACAATTAAACAAAATACGTTAAATGTAACCGGAATAACACCTACATTAAATGCAACTGGTATGCCTGAAAGCATTGGACAACAAATGTCTGCAGACAAATTACGCACTAAGAAACAAGGTGTTTCAGGTGAAAGTTTCACTGGAGATCAATTATCAGGTCTTGTACATCATGATAAAGATACTTGGTCTTCTAGTTTAATTCGAGATGCTATTAGTAATAATACATTTTTGAAGCATTTGGAACCATCACAAATTGAAGAAATAGTAGCTTGTATGTATAAAAAACAAATACCTCATGGATGTTTTATTATACGTGAAGGTGAACCAGGCGATGCATT] [+] EMBL CD114888 [TAGTTTTAGATGGTAAAAGCTATGAACCTGAGGAATTACTCAACTTAATTGAACGATTACGACAAGATATTCGAGGATACACTGATCACATAAGATGGCTTGAACAAGAATTGAGTCAAACAAGAATCACTTTAAACGCTCGAGACAGAGATATAGACAAATTGAAATCAGTTTTAGACCAAAAACTTCATAATAATAATGTGGCACAACTACCTATCTATCCCGTTACACCAATATCCGATACATCACGTCAAACAATTAAACAAAATACGTTAAATGTAACCGGAATAACACCTACATTAAATGCAACTGGTATGCCTGAAAGCATTGGACAACAAATGTCTGCAGACAAATTACGCACTAAGAAACAAGGTGTTTCAGGTGAAAGTTTCACTGGAGATCAATTATCAGGTCTTGTACATCATGATAAAGATACTTGGTCTTCTAGTTTAATTCGAGATGCTATTAGTAATAATACATTTTTGAAGCATTTGGAACCATCACAAATTGAAGAA ] [-] EMBL CD167108 [ GAGGATACACTGATCACATAAGATGGCTTGAACAAGAATTGAGTCAACCAAGAATCACTTTAAACGCTCGAGACAGAGATATAGCCAAATTGAAATCAGTTTTAGACCAAAAACTTCATAATAATAATGTGGCACAACTACCTATTTATCCCGTTACACCAATATCCGATACATCACGTCAAACAATTAAACAAAATACGTTAAATGTAAC ] [-] EMBL CD167083 [ GAGGATACACTGATCACATAAGATGGCTTGAACAAGAATTGAGTCAAACAAGAATCACTTTAAACGCTCGAGACAGAGATATAGACAAATTGAAATCAGTTTTAGACCAAAAACTTCATAATAATAATGTGGCACAACTACCTATGTATCCCGTTACACCAATATCCGATACATCACGTCAAACAATTAAACAAAATACGTTAAATGTAc ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||