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Schistosoma mansoni
cluster # 791 cluster # 791       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_791#0 length = 860 sequences # 2  

consensusID : consensus_791#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 860
fasta sequence
                              [TACTGATAATGACTTAAAATATCATCCTTATTTAAACAGTCAGAATCAAACGATCTATTGTGATTTAAATCCAAATTTATGTAAATATTTTGAGAAAAAGTTCTCTTTTTCAATGAAATTGGTAAATGAGAAAATTTCACCGGAAGAGATTAATACGTCAATGATAATATTAACAGATCATATTCATGGTCAGTATCTACAATCATTAAAATATCAAAATACCGATTGGAATTACATTAAGTTAGATTGTAGAGTGGAGGATGAAAAAGATGATGGTGAGAATTTTAATGACAATGAAAATTTCCAAGATATGCCTTTAATGGAAATGGGATTTTTAACATTCAGTGAAAAATCACTTTGGGAAATGAACGTATACTTAAAATACTTACAGGATTCTGGAAGACTCTACAATATAAAACATATAAATGAACCGGCATTTGACTTTACAACTAAACTTCAAATGCATGACAATTTATGCGTAACAAANAAANACAAAGATTCAAAAATCCCAATACGTTTAAAACAAATGAATGGACCATTGTTATTTATGATTATTGGAGGTTTATGTGCTGTTATGATGCATATGAGTGAATATATTTATTATATTGTTATGAATAGATAATTTTTCCAAAGATTTATTTCCTCTGGAGAAACTGTTCCTTCGTTTCATCATAGTCAAATATTGAATAATTGAAAATTAATTGATATATAAATACATAAATCATTATCTATTGGTCATCTTGTTCAGATTACGATGACTAAAATTGATTTACCATATAGTGATGACCAGTAAAGGCTTGATTTGCAAACATATTATTAAAACCTATTTATATGATTGAATGTATCGATAGTAATAAATA]

[+] EMBL CD185577             [TACTGATAATGACTTAAAATATCATCCTTATTTAAACAGTCAGAATCAAACGATCTATTGTGATTTAAATCCAAATTTATGTAAATATTTTGAGAAAAAGTTCTCTTTTTCAATGAAATTGGTAAATGAGAAAATTTCACCGGAAGAGATTAATACGTCAATGATAATATTAACAGATCATATTCATGGTCAGTATCTACAATCATTAAAATATCAAAATACCGATTGGAATTACATTAAGTTAGATTGTAGAGTGGAGGATGAAAAAGATGATGGTGAGAATTTTAATGACAATGAAAATTTCCAAGATATGCCTTTAATGGAAATGGGATTTTTAACATTCAGTGAAAAATCACTTTGGGAAATGAACGTATACTTAAAATACTTACAGGATTCTGGAAGACTCTACAATATAAAACATATAAATGAACCGGCATTTGACTTTACAACTAAACTTCAAATGCATGACAATTTATGCGTAACAAANAAAN                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL AI976397             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTCTACAATATAAAACATATAAATGANCCGGCATTTGACTTTACAACTAAACTTCAAATGCATGACAATTTATGCGTAACAAAAGAAGACAAAGATTCAAAAATCCCAATACGTTTAAAACAAATGAATGGACCATTGTTATTTATGATTATTGGAGGTTTATGTGCTGTTATGATGCATATGAGTGAATATATTTATTATATTGTTATGAATAGATAATTTTTCCAAAGATTTATTTCCTCTGGAGAAACTGTTCCTTCGTTTCATCATAGTCAAATATTGAATAATTGAAAATTAATTGATATATAAATACATAAATCATTATCTATTGGTCATCTTGTTCAGATTACGATGACTAAAATTGATTTACCATATAGTGATGACCAGTAAAGGCTTGATTTGCAAACATATTATTAAAACCTATTTATATGATTGAATGTATCGATAGTAATAAATA]


>consensus_791#0 TACTGATAATGACTTAAAATATCATCCTTATTTAAACAGTCAGAATCAAACGATCTATTG TGATTTAAATCCAAATTTATGTAAATATTTTGAGAAAAAGTTCTCTTTTTCAATGAAATT GGTAAATGAGAAAATTTCACCGGAAGAGATTAATACGTCAATGATAATATTAACAGATCA TATTCATGGTCAGTATCTACAATCATTAAAATATCAAAATACCGATTGGAATTACATTAA GTTAGATTGTAGAGTGGAGGATGAAAAAGATGATGGTGAGAATTTTAATGACAATGAAAA TTTCCAAGATATGCCTTTAATGGAAATGGGATTTTTAACATTCAGTGAAAAATCACTTTG GGAAATGAACGTATACTTAAAATACTTACAGGATTCTGGAAGACTCTACAATATAAAACA TATAAATGAACCGGCATTTGACTTTACAACTAAACTTCAAATGCATGACAATTTATGCGT AACAAANAAANACAAAGATTCAAAAATCCCAATACGTTTAAAACAAATGAATGGACCATT GTTATTTATGATTATTGGAGGTTTATGTGCTGTTATGATGCATATGAGTGAATATATTTA TTATATTGTTATGAATAGATAATTTTTCCAAAGATTTATTTCCTCTGGAGAAACTGTTCC TTCGTTTCATCATAGTCAAATATTGAATAATTGAAAATTAATTGATATATAAATACATAA ATCATTATCTATTGGTCATCTTGTTCAGATTACGATGACTAAAATTGATTTACCATATAG TGATGACCAGTAAAGGCTTGATTTGCAAACATATTATTAAAACCTATTTATATGATTGAA TGTATCGATAGTAATAAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)