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Schistosoma mansoni
cluster # 7935 cluster # 7935       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7935#0 length = 655 sequences # 6  

consensusID : consensus_7935#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 655
fasta sequence
                              [GCCGTTGTTCAAGATGCTAGCATACAGCTACCAATGCAGACTACGTTCCATACAACTGCTTGCTAGGAGTGTTGTACCAATTTGTCGCCCTATCACGCAGGACCATGCTTTGAAATCTAATAAACTTGGAACGGCACCAGCTGTTCAGAGAACCGGACTGTTACCATCATATCACTGGACATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG-ATGAATCTTATAGTAGTG-ACTGCTG-TTTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGACTACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTAATTTCTAATAAATGTGTCTAATTGTATGAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD083630             [GCCGTTGTTCAAGATGCTAGCATACAGCTACCAATGCAGACTACGTTCCATACAACTGCTTGCTAGGAGTGTTGTACCAATTTGTCGCCCTATCACGCAGGACCATGCTTTGAAATCTAATAAACTTGGAACGGCACCAGCTGTTCAGAGAACCGGACTGTTACCATCATATCACTGGACATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG TTTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTAT                                                                                                                        ]
[-] EMBL AI395163             [                                                                                                                                        CCAGCTGTTCAGAGAACCGGACTGTTACCATCATATCACTGGACATCTGAACGTATTGTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTCCACTATATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG TTTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGAATACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTAATTTCTAATAAATGTGTCTAATTGTATGAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AA559380             [                                                                                                                                                             CTGTTNCCANCATATCNCTGGACATTTGAACGTATTCTANCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATGAATGAATCTTATAGTAGTGAACTGCNGTTTTCCATGCATNCGTACTGGGGAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD146023             [                                                                                                                                                                              CTGGACATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG TTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD137073             [                                                                                                                                                                                    ATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGATACCCCTATG ATGAATCTTATAGTAGTG ACTGCTG ATTCCATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGACTACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTAATTTCTAATAAATG                          ]
[+] EMBL CD134552             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGCATTCGTACTGGGGATTTGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTATATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAATTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTTTTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGGTAATAACATAAAATCACCGACTACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAATCTAACATGGGGCTA                                        ]


>consensus_7935#0 GCCGTTGTTCAAGATGCTAGCATACAGCTACCAATGCAGACTACGTTCCATACAACTGCT TGCTAGGAGTGTTGTACCAATTTGTCGCCCTATCACGCAGGACCATGCTTTGAAATCTAA TAAACTTGGAACGGCACCAGCTGTTCAGAGAACCGGACTGTTACCATCATATCACTGGAC ATTTGAACGTATTCTAGCTGCAAGCATGTTGCCATTATATCCGATTGCACTCTATATGGA TACCCCTATGATGAATCTTATAGTAGTGACTGCTGTTTCCATGCATTCGTACTGGGGATT TGACGGTGTCATCAAAGACTATGCATTTGAACGTCGTTATGGTCCTGCACTGATGCCTAT ATTACGTACATTGTGGAAAGTAATGGCTGGTTTCGGTTTTGCTGGCCTTTTATATTTCAA TTTTAATGATATAGGATTTATTTCAGCCGTGAAGAAACTATGGGCCTTGTGAAAATATTT TTGGTTCTTTTACTTTGACTTCTCTTTCTGATATTTTTAAGACTATTTAGATTATTTGGG TAATAACATAAAATCACCGACTACTTTTATGTATTAGCATGTTATACTTTAATACCCAAA TCTAACATGGGGCTAATTTCTAATAAATGTGTCTAATTGTATGAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)