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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7952#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 841 fasta sequence
[TTGAATTTATTATTGAATGAGATTCATTCATATGATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAGTTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCTAAGTGGACTAAATGAAACACATCATTAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATTCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACATCTGAATGTGATTAAATGAAATGTTCGATTAAATGTATTTCTTGCTCCTGTGATACGAATAAAATGGATAACACGTGATGGGAAATATAATGTTTGCCATGAACGACACATATAATTTTGATAATCAACAATACGATGCCAAGTAGACTGATCTAATGATACATCAATAGTATATGAATAAGA]
[+] EMBL CD197686 [TTGAATTTATTATTGAATGAGATTCATTCATATGATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAATTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCTAAGTGGACTAAATGAAACACATCATTAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACG ]
[+] EMBL CD140767 [ TTATTGAATGAGATTCATTCATATAATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAGTTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCT AGTGGACTAAATGAAACACATCATCAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAG ]
[+] EMBL CD140772 [ TTATTGAATGAGATTCATTCATATGATTACTACTATCATTTACACTAGTAGATTGAGTTACGACTACTGTTGTAGGAGTTGAAAGTGTTACAATTTCTGGATTATTATTAAGATCTATTGTTGTATTTATGGGTGGATTTGATATTGTTACAAAATTTGCCTCAATAGTATCCTTTGTTGTTTGTGCTGGAGGATAAGGACATTCTAAGTGGACTAAATGAAACACATCATCAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCATGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTA ]
[-] EMBL CD119114 [ TAAATGAGACACATCATTAGCTGTATTGTATGAGCCAACAACACGAATGAATGTTACTAACTGCAATGGGAATTTAATTATCTGCCAAGAACGACATGGTTCTGTAGAAGCATCACGTACAAGTTTCCAATCGACACGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATCCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACA ]
[+] EMBL CD069023 [ aggGTTTCCA G CAGGGTCATTTGATACATACACAGAATAAGAATATGTACGTGAATCTAAATCCCATAGCAAAAATCTCATTGAACGTGATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATTCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACATCTGAATGTGATTAAATGAAATGTTCGATTAAATGTATTTCTTGCTCCTGTGATACGAATAAAATGGATAACACGTGATGGGAAA ]
[-] EMBL CD140751 [ CATTGAACGTAATAAGAATGGTTGAGCTAATTGAACTACTATAGCACCATTGCCTAATTGATGACATGTATAACCAGAGTTCCAATCGTACATTCGAATATTACCATCAATTAGTGCATTTCTGTTTCGGCTAACACCTTCTAAAACAGTAGCGCCATGATCGACATTTGCAACATTAAATGTCGGAACCATAAATCCATCTACTTGTTGAAATACTTTCTCACTATAAAAACATCTGAATGTGATTAAATGAAATGTTCGATTAAATGTATTTCTTGTTCCTGTAATACGAATAAAATGGATAACACGTGATGGGAAATATAATGTTTGCCATGAACGACACATATAATTTTGATAATCAACAATACGATGCCAAGTAGACTGATCTAATGATACATCAATAGTATATGAATAAGA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||