These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7964#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1307 fasta sequence [TAATGAATCCAAGGAAAACAAATCATCTCTAAGTTTTGAAGATAAACGGAGAGAAAATTTTCGACAAGGTCAAGCAGAACTTGATAGACGAAAGCAGGAGTTGGCTGAAAAAATGCGTCTAGACGAAGAAATTCGTCTGGAGAATGAACGATTAGAAAGGGAGAAGCAACAGAAATTACGTATGGAGAAAGAGCGTCAACAAGCTGCAGAAGCTGAAAAACAGGCAGAACTTTCAAGACAACTGGAAGCTCAGCGAGAACAACGTCGTCGTCAAGCCGTTGAACAGAGGATGAAGGCAGCACGTGATTTAGAAAAACAACGTCAAATAGAATCAGAACGGATTCGAACTGATGCTCTTTTGAAGGAGCGTAATCATATGCAAACTTTGCTCGAGCAGGCTGTTGCCCATCGTGCAAGTTTACTTGAATCAGCATCATCTCAACAACAACGGTTATTGGAATTGGACTCCCGTCTTAATGTCGCACAAACTGAAGTTGATTCCCACAAAACAAGTATTAATGAAATGCGTAGTAAACGTGATGCTTATGAGCGTGATATTCGAGATATGACTGAACAAGTGGAAGCTGCAAAAGCTGAACTTACTCATTGGCAGAGAGAAAAAGAACAATTAAGCTTACGAATGGCTGCTGGAGTAGATATGAATCCCGTTATGGAACAGTATAAGACATTACAGTCAATGCGTGAAGCACGTATTAAAACAATTGAACAATTAAGAAATAAGTTAAATGAATTAGATCAAAATATGACCCAGCAAGGTCATGAACTGGCTACTAGACGTAATAAAATCGACGATTCTCAAGATCGCGTCACACGGACAATGCTTGATTTAGTTGATTTACGACATTCTGTTGAACAGAAAATGCAAGCATATAAATTGAAAAGAAAATCTACTGATTTATCCACATCCACTTCAACCACCATTGAAAGTACACAAAAAGAGTTATATGAAGCAATGTTCGACTTCACTGCTAGACATCCGGATGAATTATCATTTACAACTGGAACATTAATTGATGTTTTTGTAAATGCTCCGATTAATGTTGGTCCAGGTTGGTTGTATGGTCAAATTAATGATAAAGTTGGCTTATTTCCTGAAACGTATGTACGAAAAAAAGTTGATGGGAAAATTGATCCATTTGATCCTTTTGGTGTTCACAAAATAACGAATACTTGTGTATCATCGATAATGATGACAACAACAACAATACCTACTACNATTAATACACCTAATACATTTAGTGCAATAAATACTAATAACAGTTTGACTGAACCAGCAANTGATAATT] [+] EMBL CD065178 [TAATGAATCCAAGGAAAACAAATCATCTCTAAGTTTTGAAGATAAACGGAGAGAAAATTTTCGACAAGGTCAAGCAGAACTTGATAGACGAAAGCAGGAGTTGGCTGAAAAAATGCGTCTAGACGAAGAAATTCGTCTGGAGAATGAACGATTAGAAAGGGAGAAGCAACAGAAATTACGTATGGAGAAAGAGCGTCAACAAGCTGCAGAAGCTGAAAAACAGGCAGAACTTTCAAGACAACTGGAAGCTCAGCGAGAACAACGTCGTCGTCAAGCCGTTGAACAGAGGATGAAGGCAGCACGTGATTTAGAAAAACAACGTCAAATAGAATCAGAACGGATTCGAACTGATGCTCTTTTGAAGGAGCGTAATCATATGCAAACTTTGCTCGAGCAGGCTGTTGCCCATCGTGCAAGTTTACTTGAATCAGCATCATCTCAACAACAACGGTTATTGGAATTGGACTCCCGTCTTAATGTCGCACAAACTGAAGTTGATTCCCACAAAACAAGTATTAATGAAATGCGTAGTAAACGTGATGCTTATGAGCGTGATATTCGAGATATGACTGAACAAGTGGAAGCTGCAAAAGCTGAACTTACTCATTGGCAGAGAGAAAAAGAACAATTAAGCTTACGAATGGCTGCTGGAGTAGATATGAATCCCGGTATGGAACAGTATTAGACATTACCGTCAATGCGTGAACCAC ] [+] EMBL CD131254 [ CGAATGGCTGCTGGAGTAGATATGAATCCCGTTATGGAACAGTATAAGACATTACAGTCAATGCGTGAAGCACGTATTAAAACAATTGAACAATTAAGAAATAAGTTAAATGAATTAGATCAAAATATGACCCAGCAAGGTCATGAACTGGCTACTAGACGTAATAAAATCGACGATTCTCAAGATCGCGTCACACGGACAATGCTTGATTTAGTTGATTTACGACATTCTGTTGAACAGAAAATGCAAGCATATAAATTGAAAAGAAAATCTACTGATTTATCCACATCCACTTCAACCACCATTGAAAGTACACAAAAAGAGTTATATGAAGCAATGTTCGACTTCACTGCTAGACATCCGGATGAATTATCATTTACAACTGGAACATTAATTGATGTTTTTATAAATGCTCCGATTAATGTTGGTCCAGGTTGGTTGTATGGTCAAATTAATGATAAAGTTGGCTTATTTCCTGAAA ] [+] EMBL CD185387 [ cAATGGCTGCTGGAGTAGATATGAATCCCGTTATGGAACAGTATAAGACATTACAGTCAATGCGTGAAGCACGTATTAAAACAATTGAACAATTAAGAAATAAGTTAAATGAATTAGATCAAAATATGACCCAGCAAGGTCATGAACTGGCTACTAGACGTAATAAAATCGACGATTCTCAAGATCGCGTCACACGGACAATGCTTGATTTAGTTGATTTACGACATTCTGTTGAACAGAAAATGCAAGCATATAAATTGAAAAGAAAATCTACTGATTTATCCACATCCACTTCAACCACCATTGAAAGTACACAAAAAGAGTTATATGAAGCAATGTTCGACTTCACTGCTAGACATCCGGATGAATTATCATTTACAACTGGAACATTAATTGATGTTTTTGTAAATGCTCCGATTAATGTTGGTCCAGGTTGGTTGTATGGTCAAATTAACGATAAAGTTGGCTTATTTCCTGAAAC ] [+] EMBL CD185518 [ AATGGCTGCTGGAGTAGATATGAATCCCGTTATGGAACAGTATAAGACATTACAGTCAATGCGTGAAGCACGTATTAAAACAATTGAACAATTAAGAAATAAGTTAAATGAATTAGATCAAAATATGACCCAGCAAGGTCATGAACTGGCTACTAGACGTAATAAAATCGACGATTCTCAAGATCGCGTCACACGGACAATGCTTGATTTAGTTGATTTACGACATTCTGTTGAACAGAAAATGCAAGCATATAAATTGAAAAGAAAATCTACTGATTTATCCACATCCACTTCAACCACCATTGAAAGTACACAAAAAGAGTTATATGAAGCAATGTTCGACTTCACTGCTAGACATCCGGATGAATTATCATTTACAACTGGAACATTAATTGATGTTTTTGTAAATGCTCCGATTAATGTTGGTCCAGGTTGGTTGTATGGTCAAATTAATGATAAAGTTGGCTTATTTCCTGAAAC ] [-] EMBL CD128064 [ AAAATATGACCCAGCAAGGTCATGAACTGGCTACTAGACGTAATAAAATCGACGATTCTCAAGATCGCGTCACACGGACAATGCTTGATTTAGTTGATTTACGACATTCTGTTGAACAGAAAATGCAAGCATATAAATTGAAAAGAAAATCTACTGATTTATCCACATCCACTTCAACCACCATTGAAAGTACACAAAAAGAGTTATATGAAGCAATGTTCGACTTCACTGCTAGACATCCGGATGAATTATCATTTACAACTGGAACATTAATTGATGTTTTTGTAAATGCTCCGATTAATGTTGGTCCAGGTTGGTTGTATGGTCAAATTAATGATAAAGTTGGCTTATTTCCTGAAACGTATGTACGAAAAAAAGTTGATGGGAAAATTGATCCATTTGATCCTTTTGGTGTTCACAAAATAACGAATACTTGTGTATCATCGATAATGATGACAAC ] [+] EMBL CD195942 [ TATATGAAGCAATGTTCGACTTCACTGCTAGACATCCGGATGAATTATCATTTACAACTGGAACATTAATTGATGTTTTTGTAAATGCTCCGATTAATGTTGGTCCAGGTTGGTTGTATGGTCAAATTAATGATAAAGTTGGCTTATTTCCTGAAACGTATGTACGAAAAAAAGTTGATGGGAAAATTGATCCATTTGATCCTTTTGGTGTTCACAAAATAACGAATACTTGTGTATCATCGATAATGATGACAACAACAACAATACCTACTACNATTAATACACCTAATACATTTAGTGCAATAAATACTAATAACAGTTTGACTGAACCAGCAANTGATAATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||