These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7970#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 578 fasta sequence [AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGA--GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTATGATAATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAACCACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAATATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGGT] [+] EMBL CD123770 [AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTCGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGAGGGGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTATGATAATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAACCACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAATATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGG ] [+] EMBL CD123777 [AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGTATCGAAAATAAGATTCGA GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTGTGATAATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAACCACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAATATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGG ] [+] EMBL CD123793 [AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGA GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTACGATAATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAACCACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAATATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGG ] [+] EMBL CD123838 [AAGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGA GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTATGATTATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGC ] [-] EMBL CD123762 [ AGAACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATTCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGA GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATAAAACAAAAGCTGGGGAATTCAGAATTTAAGGGAAAGTAAAGAATTGATGCACTTGAGTCATTGCAGACGATTTTGAGACTTGTCACACAAAGTCTCTAACCATTGGTTATGATAATTAACCGGGTCATAACAAAGTAGTCTACACCTGTTAACATGGTTCAGTCCAACTGTCATTGACTTTATGGACTGTTACCACGTTTTGATTTGGCCACCCCTAGCTGTCTTCCAGCCTACTCCTACACCAGAAAGCATCGGTTGTCGAGTAAGACTGTGGTTGGGTATACGTAGCACATGTGTCCAAACCACCTCAGTTGATGAAGATTTATCATAACTTAATGAATCCATCTTGATAAGGTCATAAATATCCAAAATAAAGCAAATATCACTTAAATATTTGTGGT] [+] EMBL CD123861 [ ACCTGGTACGTATGTAAATTGGCTCAAGTTGTCAATCCCAATTAACACAGGGAGATGAAATTGTCAGGCTAAATCCCAGAACTTTAGAGGTAGTAACAATATCACTAATAACAGGGAAGATTAGGTAGGCATCGAAAATAAGATTCGA GGAGAAAATATAGAGTGGCGAAATA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||