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Schistosoma mansoni
cluster # 7972 cluster # 7972       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7972#0 length = 342 sequences # 6  

consensusID : consensus_7972#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 342
fasta sequence
                              [GGACCTGGAAGTCCAGCCATTCCGTCTGAACCGGCAGGTCCTTCAAGTCCTGGATCCCCAGCCTCACCTTTCGGCCCAGTTTGTCCAGCAGGTCCTGGGGGACCTGGCCGACCATTTTCTCCTGGTGGTCCTTGGGGTCCAGGTTCTCCAATTAAACCTTCCGACCCCTGATCTCCCTGTACACCTGGTTGGCCTCTATCACCCTGTTGACCTGATAATCCAGGGTGACCTTTAGGTCCAGGTGGTCCTTGAACTCCTTTTATTCCCATGTTACCAGCTTCACCACGAGGTCCACGTGGACCCATTTCCCCTTTAACTCCTTTCATCCCGACAGAACCAGGT]

[+] EMBL CD146432             [GGACCTGGAAGTCCAGCCATTCCGTCTGAACCGGCAGGTCCTTCAAGTCCTGGATCCCCAGCCTCACCTTTCGGCCCAGTTTGTCCAGCAGGTCCTGGGGGACCTGGCCGACCATTTTCTCCTGGTGGTCCTTGGGGTCCAGGTTCTCCAATTAAACCTTCCGACCCCTGATCTCCCTGTACACCTGGTTGGCCTCTATCACCCTGTTGACCTGATAATCCAGGGTGACCTTTAGGTCCAGGTGGTCCTTGAACTCCTTTTATTCCCATGTTACCAGCTTCGCCACGAGGTCCACGTGGACCCATTTCCCCTTTAACTCCTTTCATCCCGACAGAACCAGG ]
[+] EMBL CD146434             [GGACCTGGAAGTCCAGCCATTCCGTCTGAACCGGCAGGTCCTTCAAGTCCTGGATCCCCAGCCTCACCTTTCGGCCCAGTTTGTCCAGCAGGTCCTGGGGGACCTGGCCGACCATTTTCTCCTGGTGGTCCTTGGGGTCCAGGTTCTCCAATTAAACCTTCCGACCCCTGATCTCCCTGTACACCTGGTTGGCCTCTATCACCCTGTTGACCTGATAATCCAGGGTGACCTTTAGGTCCAGGTGGTCCTTGAACTCCTTTTATTCCCATGTTACCAGCTTCGCCACGAGGTCCACGTGGACCCATTTCCCCTTTAACTCCTTTCATCCCGACAGAACCAGG ]
[-] EMBL CD146517             [ GACCTGGAAGTCCAGCCATTCCGTCTGAACCGGCAGGTCCTTCAAGTCCTGGATCCCCAGCCTCACCTTTCGGCCCAGTTTGTCCAGCAGGTCCTGGGGGACCTGGCCGACCATTTTCTCCTGGTGGTCCTTGGGGTCCAGGTTCTCCAATTAAACCTTCCGACCCCTGATCTCCCTGTACACCTGGTTGGCCTCTATCACCCTGTTGACCTGATAATCCAGGGTGACCTTTAGGTCCAGGTGGTCCTTGAACTCCTTTTATTCCCATGTTACCAGCTTCACCACGAGGTCCACGTGGACCCATTTCCCCTTTAACTCCTTTCACCCCGACAGAACCAGGT]
[-] EMBL CD146439             [ GACCTGGAAGTCCAGCCATTCCGTCTGAACCGGCAGGTCCTTCAAGTCCTGGATCCCCAGCCTCACCTTTCGGCCCAGTTTGTCCAGCAGGTCCTGGGGGACCTGGCCGACCATTTTCTCCTGGTGGTCCTTGGGGTCCAGGTTCTCCAATTAAACCTTCCGACCCCTGATCTCCCTGTACACCTGGTTGGCCTCTATCACCCTGTTGACCTGATAATCCAGGGTGACCTTTAGGTCCAGGTGGTCCTTGAACTCCTTTTATTCCCATGTTACCAGCTTCACCACGAGGTCCACGTGGACCCATTTCCCCTTTAACTCCTTTCATCCCGACAGAACCAGGT]
[-] EMBL CD161635             [ GACCTGGAAGTCCAGCCATTCCGTCTGAACCGGCAGGTCCTTCAAGTCCTGGATCCCCAGCCTCACCTTTCGGCCCAGTTTGTCCAGCAGGTCCTGGGGGACCTGGCCGACCATTCTCTCGTGGTGGTCCTTGGGGTCCAGGTTCTCCAATCAATCCTTCCGACCCCTGATC                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD072552             [  gCCTGGAAGTCCAGTCATTCCGTCTGAACCGGCAGGTCCTTCAAGTCCTGGATCCCGAGCCTCACCTTTCGGCCCAGTTTGTCCAGCAGGTCCTGGGGGACCTGGCCGACCATTTTCTCCTGGTGGTCCTTGGGGTCCAGGTTCTCCAATTAAACCTTCCGACCCCTGATCTCCCTGTACACCTGGTTGGCCTCTATCACCCTGTTGACCTGATAATCCAGGGTGACCTTTGGGTCCAGGTGGTCCTTGAACTCCTTTTATTCCCATGTTACCAGCTTCACCACGAGGTCCACGTGGACCCATTTCCCCTTTAACTCCTTTCATCCCGACAGAACCAGGT]


>consensus_7972#0 GGACCTGGAAGTCCAGCCATTCCGTCTGAACCGGCAGGTCCTTCAAGTCCTGGATCCCCA GCCTCACCTTTCGGCCCAGTTTGTCCAGCAGGTCCTGGGGGACCTGGCCGACCATTTTCT CCTGGTGGTCCTTGGGGTCCAGGTTCTCCAATTAAACCTTCCGACCCCTGATCTCCCTGT ACACCTGGTTGGCCTCTATCACCCTGTTGACCTGATAATCCAGGGTGACCTTTAGGTCCA GGTGGTCCTTGAACTCCTTTTATTCCCATGTTACCAGCTTCACCACGAGGTCCACGTGGA CCCATTTCCCCTTTAACTCCTTTCATCCCGACAGAACCAGGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)