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Schistosoma mansoni
cluster # 7981 cluster # 7981       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7981#0 length = 800 sequences # 6  

consensusID : consensus_7981#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 800
fasta sequence
                              [ATCACAACCAGCTGTTGGAAAATTAGCGTTTATGCGTCATCCTCGAGCTGTACTACAATCTGCTGGGTCACCTGTAAAACCGGCAACAGTTCTGGAAGCTAAATTACCAGATGAACTTACTGATTACAGGANCTGGTGGTATATTAAAAACAACTGATATTGATGATATGCCATCTTATATTCCAGAATATAATCAAAATGGTGATCAATACACCACATACAATGAATCGTTACCGCAAACATGGTCAAAACTAGTCGATCATTACGATGAGCCATTAGCTAAATCTGAGCTTGATTTACGACAAGTTGCTTATCATTTAAAATCGGATTGGAGAATATTAGCTCAATGTTTAGGCTTGTCTGATGAGGATCAGTATAATATTACTNCTCTTTGCCTAATCGTCCTGAAGAAGAATATGCATATACTAGTTTATTGTTGTGGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA-CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC-GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGATTACCAAAACAATGTCGTCACAATTTATACACTACCCACTTTAAGCATGTAGATAATTCTAACCAT]

[+] EMBL CD130559             [ATCACAACCAGCTGTTGGAAAATTAGCGTTTATGCGTCATCCTCGAGCTGTACTACAATCTGCTGGGTCACCTGTAAAACCGGCAACAGTTCTGGAAGCTAAATTACCAGATGAACTTACTGATTACAGGANCTGGTGGTATATTAAAAACAACTGATATTGATGATATGCCATCTTATATTCCAGAATATAATCAAAATGGTGATCAATACACCACATACAATGAATCGTTACCGCAAACATGGTCAAAACTAGTCGATCATTACGATGAGCCATTAGCTAAATCTGAGCTTGATTTACGACAAGTTGCTTATCATTTAAAATCGGATTGGAGAATATTAGCTCAATGTTTAGGCTTGTCTGATGAGGATCAGTATAATATTACTNCTCTTTGCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD117878             [                                                                                                                                                                                                                                                         AACCAGTCGATCATTACGATGAGCCATTAGCTAAATCTGAGCTTGATTTACGACAAGTTGCTTATCATTTAAAATCGGATTGGAGAATATTAGCTCAATGTTTAGGCTTGTCTGATGAGGATCAGTATAATATTACT  TCTTTGCCTAATCGTCCTGAAGAAGAATATGCATATACTAGTTTATTGTTGTGGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAAACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGGTTACCAAAACAATGTCGTCACAATTTATACACTACCCACTTTAAGCATGTAGATAATTCTAACCAT]
[+] EMBL CD191943             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGA                                                                  ]
[+] EMBL CD192086             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGA                                                                  ]
[+] EMBL CD192154             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGA                                                                  ]
[+] EMBL CD192143             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCATGTACACAATCTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATCGGAATATTGTATGACTAACATTTCTACCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCTCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAA                                                                                                                                                          ]


>consensus_7981#0 ATCACAACCAGCTGTTGGAAAATTAGCGTTTATGCGTCATCCTCGAGCTGTACTACAATC TGCTGGGTCACCTGTAAAACCGGCAACAGTTCTGGAAGCTAAATTACCAGATGAACTTAC TGATTACAGGANCTGGTGGTATATTAAAAACAACTGATATTGATGATATGCCATCTTATA TTCCAGAATATAATCAAAATGGTGATCAATACACCACATACAATGAATCGTTACCGCAAA CATGGTCAAAACTAGTCGATCATTACGATGAGCCATTAGCTAAATCTGAGCTTGATTTAC GACAAGTTGCTTATCATTTAAAATCGGATTGGAGAATATTAGCTCAATGTTTAGGCTTGT CTGATGAGGATCAGTATAATATTACTNCTCTTTGCCTAATCGTCCTGAAGAAGAATATGC ATATACTAGTTTATTGTTGTGGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACA ACTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAA CATTTCGCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGT TTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGG TTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACC AACAACACCAGTGATTACCAAAACAATGTCGTCACAATTTATACACTACCCACTTTAAGC ATGTAGATAATTCTAACCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)