These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7981#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 800 fasta sequence [ATCACAACCAGCTGTTGGAAAATTAGCGTTTATGCGTCATCCTCGAGCTGTACTACAATCTGCTGGGTCACCTGTAAAACCGGCAACAGTTCTGGAAGCTAAATTACCAGATGAACTTACTGATTACAGGANCTGGTGGTATATTAAAAACAACTGATATTGATGATATGCCATCTTATATTCCAGAATATAATCAAAATGGTGATCAATACACCACATACAATGAATCGTTACCGCAAACATGGTCAAAACTAGTCGATCATTACGATGAGCCATTAGCTAAATCTGAGCTTGATTTACGACAAGTTGCTTATCATTTAAAATCGGATTGGAGAATATTAGCTCAATGTTTAGGCTTGTCTGATGAGGATCAGTATAATATTACTNCTCTTTGCCTAATCGTCCTGAAGAAGAATATGCATATACTAGTTTATTGTTGTGGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA-CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC-GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGATTACCAAAACAATGTCGTCACAATTTATACACTACCCACTTTAAGCATGTAGATAATTCTAACCAT] [+] EMBL CD130559 [ATCACAACCAGCTGTTGGAAAATTAGCGTTTATGCGTCATCCTCGAGCTGTACTACAATCTGCTGGGTCACCTGTAAAACCGGCAACAGTTCTGGAAGCTAAATTACCAGATGAACTTACTGATTACAGGANCTGGTGGTATATTAAAAACAACTGATATTGATGATATGCCATCTTATATTCCAGAATATAATCAAAATGGTGATCAATACACCACATACAATGAATCGTTACCGCAAACATGGTCAAAACTAGTCGATCATTACGATGAGCCATTAGCTAAATCTGAGCTTGATTTACGACAAGTTGCTTATCATTTAAAATCGGATTGGAGAATATTAGCTCAATGTTTAGGCTTGTCTGATGAGGATCAGTATAATATTACTNCTCTTTGCCT ] [+] EMBL CD117878 [ AACCAGTCGATCATTACGATGAGCCATTAGCTAAATCTGAGCTTGATTTACGACAAGTTGCTTATCATTTAAAATCGGATTGGAGAATATTAGCTCAATGTTTAGGCTTGTCTGATGAGGATCAGTATAATATTACT TCTTTGCCTAATCGTCCTGAAGAAGAATATGCATATACTAGTTTATTGTTGTGGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAAACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGGTTACCAAAACAATGTCGTCACAATTTATACACTACCCACTTTAAGCATGTAGATAATTCTAACCAT] [+] EMBL CD191943 [ GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGA ] [+] EMBL CD192086 [ GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGA ] [+] EMBL CD192154 [ GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCAGGTACACAA CTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATTGGAATATTGTATGACTAACATTTC GCCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCGCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAAGATGGCGGTGGTGGTTTAAGTGAATCAGTTGATACAGGTTATGGCACACAGACCGGATCTACTACACTAATACCAACAACACCAGTGA ] [+] EMBL CD192143 [ GGCAAGAACGTAATGGGAATGAGTTAACTTCATGTACACAATCTTGCTGAAGCATTACAAGCTATCGGTCGTAAAGATATATCGGAATATTGTATGACTAACATTTCTACCTGTAATAACAGCTGATGAACGGGTTACTGCTTTACGTTCATTGAATGCCGTTTCTCCCAATTTAAATGTTAATCGTGAAAGTCGATCCCATTCAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||