Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7993 cluster # 7993       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7993#0 length = 601 sequences # 6  

consensusID : consensus_7993#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 601
fasta sequence
                              [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA-TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC-AGGAATCAGTATGATCA-CCAGACAAATCA]

[+] EMBL CD088800             [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAACTTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACG AAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGACAAGGAATCAGTATGATCA CCAGACAAATCA]
[+] EMBL CD088836             [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGGATCAGTATGATCACCCAGAC AATCA]
[+] EMBL CD088821             [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACACATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCANACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAANACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGAATCAGTATGATCA CCAGACAAAT  ]
[+] EMBL CD088784             [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTCATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGAATCAGTATGATCA CCAGACAA    ]
[+] EMBL CD088775             [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAATACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACTTATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAA TCAAGATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATCTTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCANACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAAACTGGTGNTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGAC AGGAA                         ]
[+] EMBL CD088782             [ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATGAAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTGAAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTTCCCCTTTCAATAAAAGTGAGAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTAAGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGATTCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACACTGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAATAAGGTTTAGGGAATTCTTAANTC AAATATGAGATGAGTAT                                                                                                                                               ]


>consensus_7993#0 ACTGAAAGTTTCCAGCAGATAAACAACCCATAATATTGGTTAAATAATGGTCTAAGAATG AAAACAGGATTAAGATTTCAGTATCACTCCCTACCACCTTTTGACGGATTATTTCTTTTG AAATTTAAAACAATTTGTTTTGTTTCTACAAATCTGTTTGATTTCTGACCTGAATTCTTT CCCCTTTCAATAAAAGTGAAAAATATGAGTTATTGAGATTGCTGTGTATAAAACAGGTTA AGATTAAATATAAACATTTTGTGTAAGATTTATAACACATTTCGTTAATTGAAGTATGAT TCACTGTCTCAGATGGCAAGATAAAATATTACATACCTTCTGAAATGAAGTAGTACACAC TGAATTTACGATTGTATGCAAAAATATGTAAACATATGTTTGTAAATATTGCAAAACAAT AAGGTTTAGGGAATTCTTAATCAAAATATGAGATGAGTATTAACTGTATTATCATTTATC TTATTCAATGTTGTCTCCATTTACTCAAACTACTATCCATACTTCGGTGATCGGACGAAA ACTGGTGTTTTCAGTTTGATATGGTAGCCGACAGGAATCAGTATGATCACCAGACAAATC A



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)