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Schistosoma mansoni
cluster # 7999 cluster # 7999       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7999#0 length = 925 sequences # 6  

consensusID : consensus_7999#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 925
fasta sequence
                              [CCAGGCACGTTTTGCATTGGATACATTTAGTTTAGTATGTAGAAGAGCAGCACAATTACTTCAAGAGACTCCTCCTATGGATTCTAATCCAGGTTGGATATCACCAGATGCACGAATTCTTCTTTCTGCATTATGCCTATGGACTGAATGGATGATTTTACATCCTGAACATTGGTTACCACCACCAAATCATCGTGATCCTACACTTCGACCACATCTAGATGATTGGTTACTTGTTGCTAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATG-AAGAAATTACACCGACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGAAAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCATATCTTTGAAGATGGTAACTTGTATAAAGCTACTTTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGA-TTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTTTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC-AAGATAAACGTGTAGATGTTAATGCAAATATCT-AACAGAATAGTTCAGATATCAATTTGGAAAATGAAGAGAAACGTCAGTTGGAGTTAATGTCTGTATTGAATGATAACAAAAATCTTTCATCAGATGATGGTACAATAGAATCTAATTCTGTCCTAACAGATATTGCAGCTTTACAACGGCAAAGAGCTTTCCTTCAAAAGCAACTAGATGAAGAAGCCCGTCTAGATGCATGGCGTCGTAATGCTATAAGA]

[+] EMBL CD115912             [CCAGGCACGTTTTGCATTGGATACATTTAGTTTAGTATGTAGAAGAGCAGCACAATTACTTCAAGAGACTCCTCCTATGGATTCTAATCCAGGTTGGATATCACCAGATGCACGAATTCTTCTTTCTGCATTATGCCTATGGACTGAATGGATGATTTTACATCCTGAACATTGGTTACCACCACCAAATCATCGTGATCCTACACTTCGACCACATCTAGATGATTGGTTACTTGTTGCTAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATG AAGAAATTACACCAACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGAAAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCGTATCTTTGAAGATGGTAACTTGTATAAAGCTACTCTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGA TTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGATACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTCTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGANACCCCTGTATTAAACTATTATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC AAGATAAACGTGTAGATGCTAATGGCAATATCT AACAGGATAGTTCAGATATCAATTTGGga                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD187879             [                                                                                                                                                                                                                          TAGATGATTGGTTACTTGTTGCTAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATGTAAGAAATTACACCGACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGAAAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCATATCTTTGAAGATGGTAACTTGTATAAAGCTACTTTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGA TTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTTTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC AAGATAAACGTGTAGATGTTAATGCAAATATTA AACAGAATAGTTCAGATATCAATTTGGA                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD187878             [                                                                                                                                                                                                                          TAGATGATTGGTTACTTGTTGCTAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATG AAGAAATTACACCGACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGAAAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCATATCTTTGAAGATGGTAACTTGTATAAAGCTACTTTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGA TTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTNTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC AAGATAAACGTGTAGATGTTAATGCA                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD187868             [                                                                                                                                                                                                                          TAGATGATTGGTTACTTGTTGCTAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATG AAGAAATTACACCGACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGAAAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCATATCTTTGAAGATGGTAACTTGTATAAAGCTACTTTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGA TTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTNTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCCAAAGAT AACGTGTAGAT                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD196044             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGAAGCATTCGTTG CGGATTTCAAACCTATGCTTGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGATTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTTTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC AAGATAAACGTGTAGATGTTAATGCAAATA CTAAACAGAATAGTTCA                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD163070             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTATGTGGAATTGAAACCCCTGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCGGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTCTGAACGTCTCC AAGATAAACGTGTAGACGTTAATGCAAATATTA AACAGAATATTTCAGATATCAATTTGGAAAATGAAGAGAAACGTCAGTTGGAGTTAATGTCTGTATTGAATGATAACAAAAATCTTTCATCAGATGATGGTACAATAGAATCTAATTCTGTCCTAACAGATATTGCAGCTTTACAACGGCAAAGAGCTTTCCTTCAAAAGCAACTAGATGAAGAAGCCCGTCTAGATGCATGGCGTCGTAATGCTATAAGA]


>consensus_7999#0 CCAGGCACGTTTTGCATTGGATACATTTAGTTTAGTATGTAGAAGAGCAGCACAATTACT TCAAGAGACTCCTCCTATGGATTCTAATCCAGGTTGGATATCACCAGATGCACGAATTCT TCTTTCTGCATTATGCCTATGGACTGAATGGATGATTTTACATCCTGAACATTGGTTACC ACCACCAAATCATCGTGATCCTACACTTCGACCACATCTAGATGATTGGTTACTTGTTGC TAAATTATGCACTGAAGCAGCTAGTTGGCTTACACGTTTATCTGTTAAACCAAACTATGA AGAAATTACACCGACAACATCTCTTGTACTTCGATTAAAAGGTGAACTTAACTGTGATGA AAAGTTGGATGATGATTCAGATAAATCTTCTACTTTATATCATATCTTTGAAGATGGTAA CTTGTATAAAGCTACTTTTCTTTCTGAAGAAGCATTCGTTGCCGGATTCAAACCTATGCT TGATTTAACACCTAAAATATATTATTACACAGGTGATTGGGATCCAGAAACTGTGGCAGA TTTTGTTCGAATAGAGAAATTAGTTTTATTTGGTGATTATTTATGTGGAATTGAAACCCC TGTATTAAACTATAATATTGATCAAGCAGTTTATGAATCTGTTATACAACGTGAATCCTC TGAACGTCTCCAAGATAAACGTGTAGATGTTAATGCAAATATCTAACAGAATAGTTCAGA TATCAATTTGGAAAATGAAGAGAAACGTCAGTTGGAGTTAATGTCTGTATTGAATGATAA CAAAAATCTTTCATCAGATGATGGTACAATAGAATCTAATTCTGTCCTAACAGATATTGC AGCTTTACAACGGCAAAGAGCTTTCCTTCAAAAGCAACTAGATGAAGAAGCCCGTCTAGA TGCATGGCGTCGTAATGCTATAAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)