These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8022#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 508 fasta sequence [AATTTAGATGAAAAACAAAGAACAGCAGCTGCTGCGGCAATGGCTGCAGCGATGGCCGCTGCTGCCGCCGCCTCACAAGGTGGCCCACCAGGAGCTTTTGGTCTACCGTTAAACTTCGGGTCTAATAGTCTGTCAGGGTCTTCACCAATGGATGCGCATAATTTAATGGCTACAATGGCTAGTTTTGCTGCTGCTCAATCTGCTGCAGCAGTAGGCATGAATCCAGATATACATGATGGACTTAATTCAAGCCTTCCTTTATCGTCTGGACTTTTCGGTGGTTTAAATCCAGATATATCTGGTTTTGGTCCAAATAATCTATTACCTCCATCATCATCTATATCATCAACATTTCCTAACCCAGGTTCTGTTTTACCACCATCAAAAAGTTCAACACCTGTACCCAGTGTTAATTCTTGTCCAAGTCGTCAACGTGCAAATTCTCGATCTCCAGCTTTGCTTGATGTACATTCAAATGCACCTCCAGATGAGAAACGTCGTNAAAACT] [+] EMBL CD154053 [AATTTAGATGAAAAACAAAGAACAGCAGCTGCTGCGGCAATGGCTGCAGCGATGGCCGCTGCTGCCGCCGCCTCACAAGGTGGCCCACCAGGAGCTTTTGGTCTACCGTTAAACTTCGGGTCTAATAGTCTGTTAGGGTCTTCACCAATGGATGCGCATAATTTAATGGCTACAATGGCTAGTTTTGCTGCTGCTCAATCTGCTGCAGCAGTAGGCATGAATCCAGATATACATGATGGACTTAATTCAAGCCTTCCTTTATCGTCTGGACTTTTCGGTGGTTTAAATCCAGATATATCTGGTTTTGGTCCAAATAATCTATTACCTCCATCATCATCTATATCATCAACATTTCCTAACCCAGGTTCTGTTTTACCACCATCAAAAAGTTCAACACCTGTACCCAGTGTTAATTCTTGT ] [+] EMBL CD154216 [AATTTAGATGAAAAACAAAGAACAGCAGCTGCTGCGGCAATGGCTGCAGCGATGGCCGCTGCTGCCGCCGCCTCACAAGGTGGCCCACCAGGAGCTTTTGGTCTACCGTTAAACTTCGGGTCTAATAGTCTGTCAGGGTCTTCACCAATGGATGCGCATAATTTAATGGCTACAATGGCTAGTTTTGCTGCTGCTCAATCTGCTGCAGCAGTAGGCATGAATCCAGATATACATGATGGACTTAATTCAAGCCTTCCTTTATCGTCTGGACTTTTCGGTGGTTTAAATCCAGATATATCTGGTTTTGGTCCAAATAATCTATTACCTCCATCATCATCTATATCATCAACATTTCCTAACCCAGGTTCTGTTTTACCACCATCAAAAAGTTCAACACCTGTACCCAGTGTTAATTCTTGT ] [+] EMBL CD144607 [ TACCGTTAAACTTCGGGTCTAATAGTCTGTCAGGGTCTTCACCAATGGATGCGCATAATTTAATGGCTACAATGGCTAGTTTTGCTGCTGCTCAATCTGCTGCAGCAGTAGGCATGAATCCAGATATACATGATGGACTTAAGTCAAGCCTTCCTTTATCGTCTGGACTTTTCGGTGGTTTAAATCCAGATATATCTGGTTTTGGTCCAAATAATCTATTACCTCCATCATCATCTATATCATCAACATTTCCTAACCCAGGTTCTGTTTTACCACCATCAAAAAGTTCAACACCTGTACCCAGTGTTAATTCTTGTCCAAGTCGTCAACGTGCAAATTCTCGATCTCCAGCTTTGCTTGATGTACAT ] [+] EMBL CD113210 [ TACCGTTAAACTTCGGGTCTAATAGTCTGTCAGGGTCTTCACCAATGGATGCGCATAATTTAATGGCTACAATGGCTAGTTTTGCTGCTGCTCAATCTGCTGCAGCAGTAGGCATGAATCCAGATATACATGATGGACTTAATTCAAGCCTTCCTTTATCGTCTGGACTTTTCGGTGGTTTAAATCCAGATATATCTGGTTTTGGTCCAAAT ] [+] EMBL CD182078 [ TTAATGGCTACAATGGCTAGTTTTGCTGCTGCTCAATCTGCTGCAGCAGTAGGCATGAATCCAGATATACATGATGGACTTAATTCAAGCCTTCCTTTATCGTCTGGACTTCTCGGTGGTTTAAATCCAGATATATCTGGTTTTGGTCCAAATAATCTATTACCTCCATCATCATCTATATCATCAACATTTCCTAACCCAGGTTCTGTTTTACCACCATCAAAAAGTTCAACACCTGTACCCAGTGTTAATTCTTGTCCAAGTCGTCAACGTGCAAATTCTCGATCTCCAGCTTTGCTTGATGTACATTCAAATGCACCTCCAGATGAGAAACGTCGTNAAAACT] [+] EMBL BG931084 [ ATCATCATCTATATCATCAACATTTCCTAACCCAGGTTCTGTTTTACCACCATCAAAAAGTTCAACACCTGTACCCAGTGTTAATTCTTGTCCAAGTCGTCAACGTGCAAATTCTCGATCTCCAGCTTTGCTTGATGTACATTCAAATGCACCTCCAGATGAGAAACGTCGTAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||