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Schistosoma mansoni
cluster # 8029 cluster # 8029       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8029#0 length = 800 sequences # 6  
consensusID : consensus_8029#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 800
fasta sequence 
                              [ATACATCAAATTTAGAACCACGACCAAAAAGTTTAGTTGTTAAACGATCAATGCGTTGTCGGGTCTGTGAACATAATCTATGCAAAGCAGATTTCAGTCCAAGTTCTATTAAATTTCGAATTAATTTAAATGCATTATATCATGTTCCAGAATTACGATTTATTATTCCACCATCAACAATTATTAAAGGATCAACATTTGATTTAAAACAAACTATGGATAAAACTAATTCAACATTGGAACGTCGTACTTCATCGACATTATTTTCTATGAAATATGAACCCGTTATACATTCTAATGCTACACTTGGTCAAAAAATGAACATAATTTTAACCAT-AAGTAATCCAATGCATCGGATTACAATTTTTTCATTACGTCAGTTAACTTTACAAGAAGAAATAGAACATCTTGGACATTTAATTAACAACAATAAGTATAAACTGAATTCATCTTCATCTACAGTCGAAATTCAATCTATCAATAATGCCAATGAATCAAAAAAGGATTCTAATGCTATCAGCAGTGACACAGCATCATCATTGTCTGACGATGGTCAATTAACATGTTTTTCGACTGTAAATCTCATTTTGCCAACTGAAGAGTTGAAACTTGCACCTCGTAATGATATTATGGATTGTGATGTAACTCCAGGTCAGAGTTCTGGCGATTACAAAGATGATCCTAAGATAGTGGCCTTCCGTCGTGGTAACAAACTAGGTATTAATGTTACTTTAATACCAAAAACCAACAAGTTACTGACACTACAAAGTTCAAGTTTAGTTCCAGTTAGCGAAGATCAN]

[+] EMBL CD163856             [ATACATCAAATTTAGAACCACGACCAAAAAGTTTAGTTGTTAAACGATCAATGCGTTGTCGGGTCTGTGAACATAATCTATGCAAAGCAGATTTCAGTCCAAGTTCTATTAAATTTCGAATTAATTTAAATGCATTATATCATGTTCCAGAATTACGATTTATTATTCCACCATCAACAATTATTAAAGGATCAACATTTGATTTAGAACAAACTATGGATAAAACTAATTCAACATTGGAACGTCGTACTTCATCGACATTATTTTCTATGAAATATGAACCCGTTATACATTCTAATGCTACACTTGGTCAAAAAATGAACATGATTTTAACCAT AAGTAATCCAATGCATCGGATTACAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD163883             [ TACATCAAATTTAGAACCACGACCAGAAAGTTTAGTTGTTAAACGATCAATGCGTTGTCGGGTCTGTGAACATAATCTATGCAAAGCAGATTTCAGTCCAAGTTCTATTAAATTTCGAATTAATTTAAATGCATTATATCATGTTCCAGAATTACGATTTATTATTCCACCATCAACAATTATTAAAGGATCAACATTTGATTTAAAACAAACTATGGATAAAACTAATTCAACATTGGAACGTCGTACTTCATCGACATTATTTTCTATGAAATATGAACCCGTTATACATTCTAGTGCTACACTTGGTCAAAAAATGAACATAATTTTAACCAT AAGTAATCCAATGCATCGGATTACAATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD165985             [                                 TAGTTGTTAAACGATCAATGCGTTGTCGGGTCTGTGAACATAATCTATGCAAAGCAGATTTCAGTCCAAGTTCTATTAAATTTCGAATTAATTTAAATGCATTATATCATGTTCCAGAATTACGATTTATTATTCCACCATCAACAATTATTAAAGGATCAACATTTGATTTAAAACAAACTATGGATAAAACTAATTCAACATTGGAACGTCGTACTTCATCGACATTATTTTCTATGAAATATGAACCCGTTATACATTCTAATGCTACACTTGGTCAAAAAATGAACATAATTTTAACCATAAAGT ATCCCATGCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD178712             [                                                                                                                                                                                                                                                               CGACATTATTTTCTATGAAATATGAACCCGTTATACATTCTAATGCTACACTTGGTCAAAAAATGAACATAATTTTAACCAT AAGTAATCCAATGCATCGGATTACAATTTTTTCATTACGTCAGTTAACTTTACAAGAAGAAATAGAACATCTTGGACATTTAATTAACAACAATAAGTATAAACTGAATTCATCTTCATCTACAGTCGAAATTCAATCTATCAATAATGCCAATGAATCAAAAAAGGATTCTAATGCTATCAGCAGTGACACAGCATCATCATTGTCTGACGATGGTCAATTAACATGTTTTTCGACTGTAAATCTCATTTTGCCAACTGAAGAGTTGAAACTTGCACCTCGTAATGATATTATGGATTGTGATGTAACTCCAGGTCAGAGTTCTGGCGATTACAAAGATGATCCT                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD083927             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTTCATTACGTCAGTTAACTTTACAAGAAGAAATAGAACATCTTGGACATTTAATTAACAACAATAAGTAT AACTGAATTCATCTTCATCTACAGTCGAAATTCAATCTATCAATAATGCCAATGAATCAAAAAAGGATTCTAATGCTATCAGCAGTGACACAGCATCATCATTGTCTGACGATGGTCAATTAACATGTTTTTCGACTGTAAATCTCATTTTGCCAACTGAAGAGTTGAAACTTGCACCTCGTAATGATATTATGGATTGTGATGTAACTCCAGGTCAGAGTTCTGGCGATTACAAAGATGATCCTAAGATAGTGGCCTTCCGTCGTGGTAACAAACTAGGTATTAATGTTACTTTAATACCAAAAACCAACAAGTTACTGACACTACAAAGTTC                            ]
[+] EMBL BG931684             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TACAGTCGAAATTCAATCTATCAATAATGCCAATGAATCAAAAAAGGATTCTAATGCTATCAGCAGTGACACAGCATCATCATTGTCTGACGATGGTCAATTAACATGTTTTTCGACTGTAAATCTCATTTTGCCAACTGAAGAGTTGAAACTTGCACCTCGTAATGATATTATGGATTGTGATGTAACTCCAGGTCAGAGTTCTGGCGATTACAAAGATGATCCTAAGATAGTGGCCTTCCGTCGTGGTAACAAACTAGGTATTAATGTNACTTTAATACCCAAAACCAACAAGTTACTGACACTACAAAGTTCAAGTTTAGTTCCAGTTAGCGAAGATCAN]




>consensus_8029#0
ATACATCAAATTTAGAACCACGACCAAAAAGTTTAGTTGTTAAACGATCAATGCGTTGTC
GGGTCTGTGAACATAATCTATGCAAAGCAGATTTCAGTCCAAGTTCTATTAAATTTCGAA
TTAATTTAAATGCATTATATCATGTTCCAGAATTACGATTTATTATTCCACCATCAACAA
TTATTAAAGGATCAACATTTGATTTAAAACAAACTATGGATAAAACTAATTCAACATTGG
AACGTCGTACTTCATCGACATTATTTTCTATGAAATATGAACCCGTTATACATTCTAATG
CTACACTTGGTCAAAAAATGAACATAATTTTAACCATAAGTAATCCAATGCATCGGATTA
CAATTTTTTCATTACGTCAGTTAACTTTACAAGAAGAAATAGAACATCTTGGACATTTAA
TTAACAACAATAAGTATAAACTGAATTCATCTTCATCTACAGTCGAAATTCAATCTATCA
ATAATGCCAATGAATCAAAAAAGGATTCTAATGCTATCAGCAGTGACACAGCATCATCAT
TGTCTGACGATGGTCAATTAACATGTTTTTCGACTGTAAATCTCATTTTGCCAACTGAAG
AGTTGAAACTTGCACCTCGTAATGATATTATGGATTGTGATGTAACTCCAGGTCAGAGTT
CTGGCGATTACAAAGATGATCCTAAGATAGTGGCCTTCCGTCGTGGTAACAAACTAGGTA
TTAATGTTACTTTAATACCAAAAACCAACAAGTTACTGACACTACAAAGTTCAAGTTTAG
TTCCAGTTAGCGAAGATCAN

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)