These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8047#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 373 fasta sequence [TAAAATATGAATTAAATTT-AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAAATGCTTGACGTGCCATTGGG] [+] EMBL CD113112 [TAAAATATGAATTAAATTT AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAATGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCANTANATGCTTGACGTGCCATTGGG] [+] EMBL CD113049 [TAAAATATGAATTAAATTT AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAA ] [+] EMBL CD113101 [TAAAATATGAATTAAATTT AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAA ] [+] EMBL CD201112 [TAAAATATGAATTAAATTT AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAA ] [+] EMBL CD113039 [TAAAATATGAATTAAATTT AATACTCTCCATAAATTTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTAAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTATATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAA ] [-] EMBL CD113084 [ AAAATATGAATTAAATTTNNNTTATCTTCATAA TTGGAAATATAGTTCTATTCTCTACACGTATCTTCCATTCACGACATCGATACCATTTAAGAAATCTTGGAAAACGTAACATTGGTTGAATACCAACTTTAAATTGTAATAAATCCAATGGAAGTAATGATGTAATATCTAAAAGGAATTTATAGGATTTCATATAACGTTTAGCTAATTTCTGATGATTACGTACTTTTAATCCACGTTTTAAATAACTTGTATTACATTGTACAAATATATCAATTAAATAAGTTAAATCAGTGAATATATCTAAACTAAACCATAACATTTGATAAGTTATTTGTAATTCAGTAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||