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Schistosoma mansoni
cluster # 8057 cluster # 8057       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8057#0 length = 1133 sequences # 6  

consensusID : consensus_8057#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1133
fasta sequence
                              [GTGGCACCAAGCAAAAGCCATGATAATGTGCGAACTCTTTCAACCATGATAAGAAAATCTTTTGGTCCTAATTGAGATGAAGGTGGAGTGGATTTTAACCAAGGTAAATACTGTAATATAATTGCTTCTGAATGAGCCGTATGTGAAAATGTTGAAGCGAGCATCACATGTGCATAGTTTGGGTGTCGAGAATTAGCTGAACTAGGACTAGAGATTGTTTGTGGCGTGGTAGATGTAGATGAGACAAAATTTGGCGAAGTCAAATTTGAAACAGATGTAGTCGTAGTGGAAGTTGTAACATTAGTAGAAGAAATCTGATCATGTGAAATTGCTGGAGATGGGATAGGAATCGCGGAAGAAATTAGTTTTGTGTTAGTAGCTTCTTGCTTTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGGGCTGGTAATCCAGGTGCTAAATTTTTACCGTTCCTCGTCGTTTTTACATCGGCTAGTAGTCCGGGTGCAAGTAAAGGTAAGACATCGTGGTCACTTCCACTGTTAGATCTAGATAGCTCCAATGAAACATACTGAGATAAACCTGATTTTAAATGTGCACCTAAAACATCTTCATGCAAGCTTGGAATATTTGTACCTAACCCAACGTTAGAATTAACACCCGTAGCTCCTGTTGCAGAGTTTGATACTCCTGATGAATTAAAACCTCCACCAAATAAACTACTACCTATATTTCCAGATGTTGCTCCTCCACCGCCTGTCAGTGTGTTTGAATCAAGATTACCAGTACCACATGGATTTGATCCGGACATCATAGATGAAGAACCAAGTCCATATCCGACGCTGTTCAACTGAACTGCTGATTTTTGAGACTGTTTAATCTTATTCAC]

[-] EMBL CD180527             [GTGGCACCAAGCAAAAGCCATGATAATGTGCGAACTCTTTCAACCATGATAAGAAAATCTTTTGGTCCTAATTGAGATGAAGGTGGAGTGGATTTTAACCAAGGTAAATACTGTAATATAATTGCTTCTGAATGAGCCGTATGTGAAAATGTTGAAGCGAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD178231             [                                                                                            TTTTAACCAAGGTAAATACTGTAATATAATTGCTTCTGAATGAGCCGTATGTGAAAATGTTGAAGCGAGCATCACATGTGCATAGTTTGGGTGTCGAGAATTAGCTGAACTAGGACTAGAGATTGTTTGTGGCGTGGTAGATGTAGATGAGACAAAATTTGGCGAAGTCAAATTTGAAACAGATGTAGTCGTAGTGGAAGTTGTAACATTAGTAGAAGAAATCTGATCATGTGAAATTGCTGGAGATGGGATAGGAATCGCGGAAGAAATTAGTTTTGTGTTAGTAGCTTCTTGCTTTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD195521             [                                                                                                                                                                                                              ACTAGAGATTGTTTGTGGCGTGGTAGATGTAGATGAGACAAAATTTGGCGAAGTCAAATTTGAAACAGATGTAGTCATAGTGGAAGTTGTAACATTAGTAGAAGAAATCTGATCATGTGAAATTGCTGGAGATGGGATAGGAATCGCGGAAGAAATTAGTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD127817             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCGCGGAAGAAATTAGTTTTGTGTTAGTAGCTTCTTGCTTTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGGGCTGGTAATCCAGGTGCTAAATTTTTACCGTTCCTCGTCGTTTTTACATCGGCTAGTAGTCCGGGTGCAAGTAAAGGTAAGACATCGTGGTCACTTCCACTGTTAGATCTAGATAGCTCCAATGAAACATACTGAGATAAACCTGATTTTAAATGTGCACCTAAAACATCTTCATGCAAGCTTGGAATATTTGTACCTAACCCAACGTTAGAATTAACACCCGTAGCTCCTGTTGCAGAGTTTGATACT                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD094395             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATCGTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGTTGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCACTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTCTCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGGGCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGGGCTGGTAATCCAGGTGCTAAATTTTTACCGTTCCTCGTCGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD192758             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCACTGTTAGATCTAGATAGCTCCAATGAAACATACTGAGATAAACCTGATTTTAAATGTGCACCTAAAACATCTTCATGCAAGCTTGGAATATTTGTACCTAACCCAACGTTAGAATTAACACCCGTAGCTCCTGTTGCAGAGTTTGATACTCCTGATGAATTAAAACCTCCACCAAATAAACTACTACCTATATTTCCAGATGTTGCTCCTCCACCGCCTGTCAGTGTGTTTGAATCAAGATTACCAGTACCACATGGATTTGATCCGGACATCATAGATGAAGAACCAAGTCCATATCCGACGCTGTTCAACTGAACTGCTGATTTTTGAGACTGTTTAATCTTATTCAC]


>consensus_8057#0 GTGGCACCAAGCAAAAGCCATGATAATGTGCGAACTCTTTCAACCATGATAAGAAAATCT TTTGGTCCTAATTGAGATGAAGGTGGAGTGGATTTTAACCAAGGTAAATACTGTAATATA ATTGCTTCTGAATGAGCCGTATGTGAAAATGTTGAAGCGAGCATCACATGTGCATAGTTT GGGTGTCGAGAATTAGCTGAACTAGGACTAGAGATTGTTTGTGGCGTGGTAGATGTAGAT GAGACAAAATTTGGCGAAGTCAAATTTGAAACAGATGTAGTCGTAGTGGAAGTTGTAACA TTAGTAGAAGAAATCTGATCATGTGAAATTGCTGGAGATGGGATAGGAATCGCGGAAGAA ATTAGTTTTGTGTTAGTAGCTTCTTGCTTTTTAGTTGAGGATGTTTGGGTTATTGGTATC GTTGAACGTGTATAGTTAGTTTCGCTAGATTTACAACTAGGTGAAGGATTGACACTAGGT TGTGTAATAGCAGTATTGGCTGTATCTGAATGGGGCTCATTTCGTCTCACAACTGATCCA CTATTTTTACTAAGTTTAATTTGTGCATTTGATTGTTCCACATTTGCAGTATGTCCACTC TCAGATAGTAAGTTTAAACTTTTTCCCGTTAAACCCATTGAAGTGACATTCGAACTAGGG GCAGTGGTGACTGCCTTTGATCGGGCTGGTAATCCAGGTGCTAAATTTTTACCGTTCCTC GTCGTTTTTACATCGGCTAGTAGTCCGGGTGCAAGTAAAGGTAAGACATCGTGGTCACTT CCACTGTTAGATCTAGATAGCTCCAATGAAACATACTGAGATAAACCTGATTTTAAATGT GCACCTAAAACATCTTCATGCAAGCTTGGAATATTTGTACCTAACCCAACGTTAGAATTA ACACCCGTAGCTCCTGTTGCAGAGTTTGATACTCCTGATGAATTAAAACCTCCACCAAAT AAACTACTACCTATATTTCCAGATGTTGCTCCTCCACCGCCTGTCAGTGTGTTTGAATCA AGATTACCAGTACCACATGGATTTGATCCGGACATCATAGATGAAGAACCAAGTCCATAT CCGACGCTGTTCAACTGAACTGCTGATTTTTGAGACTGTTTAATCTTATTCAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)