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Schistosoma mansoni
cluster # 8130 cluster # 8130       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8130#0 length = 506 sequences # 6  

consensusID : consensus_8130#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 506
fasta sequence
                              [AGTAACAGGATAAAATAAACCCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTACTTTGAAAACAGTTTACCGTCAGAAATGTTATCATTAGAAAATGCTTAATTTCTTCGATGAGTAATTCATTCGCANAATTACTCAACGATATAAATTTGTCTGGATGTACATTTGACCATAGNAACATCTGACTTAATAAATACTA]

[+] EMBL AI067696             [AGTAACAGGATAAAATAAACCCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTACTTTGAAAACAGTTTACCGTCAGAAATGTTATCATTAGAAAATGCTTAATTTCTTCGATGAGTAATTCATTCGCANAATTACTCAACGATATAAATTTGTCTGGATGTACATTTGACCATAGNAACATCTGACTTAATAAATACTA]
[+] EMBL AI068291             [AGTAACAGGATAAAATAAACCCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTACTTTGAAAACAGTTTACCGTCAGAAATGTTATCATTAGAAAATGCTTAATTTCTTCGATGAGTAATTCATTCGCANAATTACTCAACGATATAAATTTG                                               ]
[+] EMBL AI067330             [                    CCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTACTTTGAAAACAGTTTACCGTCAGAAATGTTATCATTAGAAAATGCCTAATTTC                                                                                             ]
[+] EMBL AI067320             [                    CCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTACTTTGAAAACA                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AI067455             [                                            CTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGTTTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAATCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAA                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AI067037             [                                            CTGAGCAAGTTGGTGGCGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTTGAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAACAGGACAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]


>consensus_8130#0 AGTAACAGGATAAAATAAACCCATATGAATAAACACTGTACTGGCTGAGCAAGTTGGTGG CGCCTTGACTACTCTGTAAAGGATAACTTGCCAATGTTTGAAAAGATTTGGACTAGGTTT GAGTATAAGTGTGAATACCAATATTGAGATGAAGCTGTATTAAGCTGAGAAATGCTAAAC AGGACAGAATGTACATCGTTGATTTAAGAGCTAGCTAGTATCCAAACATACTAGTAACGT TTCAGTTAACTATACGTTATCTTTTTGTAATAATATTCTGGCTATTGACGAAATAAGAAA TCGTTTCTTCATTTCATGTGTATTTCTACCTTAATAAGATATCTAAAAAAAAACGTAGTA CTTTGAAAACAGTTTACCGTCAGAAATGTTATCATTAGAAAATGCTTAATTTCTTCGATG AGTAATTCATTCGCANAATTACTCAACGATATAAATTTGTCTGGATGTACATTTGACCAT AGNAACATCTGACTTAATAAATACTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)