These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8132#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1545 fasta sequence [TTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGGCAGTTTTTTGTCACGTGTTTTAAGTAAATAACATGAAGTTCTGTGAATTCCTCAAATAAAATAGCCGATTTACATTTTGTGAAAAAAATGATATTCTACCAGAAAATTGGCGGTGAAAGTTATTTCATTGATAGTGTTACACACAACAGCTTTATGTTATTCATCATCTTACGTGAATATATTTGTTCACTAACAATGCCAGATAACTCTGAGGACCAAATACCGTGTATTAATTCAAAAGATACAATCACTTTGTATATGCTAATGTATGAAATGTTAAAGGAAAACATTGGTAATCCATTTGACATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACTACGCAATTACTATGAGGCTGTTGCGTACACAAATTTGTCGACATTTAAAAATCTAGTCTTTGCAAAATCATCGAATGTTGGCAATGAAATCGATGACGATGACGATGAAAATAGTGGTGATGGAAGGGGTGATGCTAATCAAAATAGTAATAGAAGATTCTTTTTGACTAAAGACAGCGTTTTCGGTTTATTTTTAAGAAAATTTTCACTTGGAATTTATTCAAAGTTTTGAAAAACTCATACAATTTTTTGACTCATTTTTTGATGCTTATGATAATGAATTATGTTCCAGGTCAAATTCGAATATTGAAGATTTAATTGTACAAAATTTTGCTCATTCATTTATTAGAGATCAGTATTTAATATCAACTCGTAATCAGGCTTTAGATGTCTGTTCCGAAATTATTGATTCTATTGGAAAAATTGGTGGACGTCCTAATCTTAATCTACAAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGG-ATCTTACCATGGCTGAGAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCAAAATCCAGAAATCTCATTAACAACGTCAACATTTTCTGGAGCTGGCACAGGATCGACGACT---ACAACAACAACAGCAGGACCAGGAACAAGCGCATCGTCAGTACTAACTCCACCTATCAATTCTAGTAATACCTGTGCTCATATGGCAGTGACTGGTGCTGCAATGCATTTAAATTTTGGTCATTGGTATAAAAGAAAATGTTTGATTAAGGAAGCGCTTCAAAAATCGCTAGAAAGTGAATCGAAAGATTCACTTGGTCATGTTAAAGTTACGCATACTTTATTGAATTCAAGTGCTGATCCATTTCGTTATGATAATGAAGCACCTATGAAACAATCATTCAAATCAAATGATGTTACATTAACTGAATTTCGTACAACATTTTGCACGTGCATTAGATACAGGATCAGAACCATATTAACTTTTAACTGTTTATTTCAATTCTGTTAATATTATATCACAAGCATATTTTACTGTATGTCAATTGGATTTAGCTACAATGTGGCAATTTTATGGTTATCCAAATATG] [+] EMBL AI975442 [TTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGGCAGTTTTTTGTCACGTGTTTTAAGTAAATAACATGAAGTTCTGTGAATTCCTCAAATAAAATAGCCGATTTACATTTTGTGAAAAAAATGATATTCTACCAGAAAATTGGCGGTGAAAGTTATTTCATTGATAGTGTTACACACAACAGCTTTATGTTATTCATCATCTTACGTGAATATATTTGTTCACTAACAATGCCAGATAACTCTGAGGACCAAATACCGTGTATTAATTCAAAAGATACAATCACTTTGTATATGCTAATGTATGAAATGTTAAAGGAAAACATTGGTAATCCATTTGACATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACTACGCAATTACTATGAGGCTGTTGCGTACACAAATTTGTCGACATTTAAAAATCTAGTCTTTGCAAAATCATCGAATGTTGGCAATGAAATCGATGACGATGACGATGAAAATAGTGGTGATGGAA ] [+] EMBL CD136938 [ TTTGTCACGTGTCTTAAGTAAATAACATGAAGTTCTGTGAATTCCTCAAATAAAATAGCCGATTTACATTTTGTGAAAAAAATGATATTCTACCAGAAAATTGGCGGTGAAAGTTATTTCATTGATAGTGTTACACACAACAGCTTTATGTTATTCATCATCTTACGTGAATATATTTGTTCACTAACAATGCCAGATAACTCTGAGGACCAAATACCGTGTATTAATTCAAAAGATACAGTCACTTTGTATATGCTAATGTATGAAATGTTAAAGGAAAACATTGGTAATCCATTTGACATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACT ] [+] EMBL CD088921 [ ATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACTACGCAATTACTATGAGGCTGTTGCGTACACAAATTTGTCGACATTTAAAAATCTAGTCTTTGCAAAATCATCGAATGTTGGCAATGAAATCGATGACGATGACGATGAAAATAGTGGTGATGGAGGGGGTGATGCTAATCAAAATAGTAATAGAAGATTCTTTTTGACTAAAGACAGCGTTTTCGGTTTATTTTTAAGAAAATTTTCACTTGGAATTTATTCAAAGTTTTGAAAAACTCATACAATTTTTTGACTCATTTTTTGATGCTTATGATAATGAATTATGTTCCAGGTCAAATTCGAATATTGAAGATTTAATTGTACAAAATTTTGCTCATTCATTTATTAGAGATCAGTATTTAATATCAACTCGTAATCAGGCTTTAGATGTCTGTTCCGAAATTATTGATTCTATTGGAAAAATTGGTGGACGTCCTAATCTTAATCTACAAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGG ATCTTACCATGGCTGANAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCAAAATCCAGAAA ] [+] EMBL CD167085 [ GAGATCAGTATTTAATATCAACTCGTAATCAGGCTTTACATGTCTGTTCCGAAGTTATTGATTCTATTGGAAAAATTGGTGGACGTCCTAATCTTAATCTACAAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGGAATCTTACCATGGCTGAGAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCCAAATCCAGAAATCTCATTAACAACGTCAACATTTTCTGGAGCTGGCACAGGATCGACGACTACAACAACAACAACAGCAGGACCAGGAACAAGCGCATCGTCAG ] [-] EMBL CD164370 [ AATCTTAATCTACCAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGGAATCTTACCATGGCTGAGAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCAAAATCCAGAAATCTCATTAACGACGTCAACATTTTCTGGAGCTGGCGCAGCATCGACGACT ACAACAACAACAGCAGGACCAGGAGCAAGCGCATCGTCAGTACTAACTCCACCTATCAATTCTAGTAATACCTGTGCTCATATGGCAGTGACTGGTGCTGCAATGCATTTAAATTTTGGTCATTGGTATAAAAGAAAATGTTTGATTAAGGAAGCGCTTCAAAAATCGCTAGAAAGTGAATCGAAAGATTCACTTGGTCATGTTAAAGTTACGCATACTTTAT ] [+] EMBL CD069200 [ CAGCATGTACAAGAACAAGCGCATCGTCAGTACTAACTCCACCTATCAATTCTAGTAATACCTGTGCTCATATGGCAGTGACTGGTGCTGCAATGCATTTAAATTTTGGTCATTGGTATAAAGGAAAATGTTTGATTAAGGAAGCGCTTCAAAAATCGCTAGAAAGTGAATCGAAAGATTCACTTGGTCATGTTAAAGTTACGCATACTTTATTGAATTCAAGTGCTGATCCATTTCGTTATGATAATGAAGCACCTATGAAACAATCATTCAAATCAAATGATGTTACATTAACTGAATTTCGTACAACATTTTGCACGTGCATTAGATACAGGATCAGAACCATATTAACTTTTAACTGTTTATTTCAATTCTGTTAATATTATATCACAAGCATATTTTACTGTATGTCAATTGGATTTAGCTACAATGTGGCAATTTTATGGTTATCCAAATATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||