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Schistosoma mansoni
cluster # 8132 cluster # 8132       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8132#0 length = 1545 sequences # 6  

consensusID : consensus_8132#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1545
fasta sequence
                              [TTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGGCAGTTTTTTGTCACGTGTTTTAAGTAAATAACATGAAGTTCTGTGAATTCCTCAAATAAAATAGCCGATTTACATTTTGTGAAAAAAATGATATTCTACCAGAAAATTGGCGGTGAAAGTTATTTCATTGATAGTGTTACACACAACAGCTTTATGTTATTCATCATCTTACGTGAATATATTTGTTCACTAACAATGCCAGATAACTCTGAGGACCAAATACCGTGTATTAATTCAAAAGATACAATCACTTTGTATATGCTAATGTATGAAATGTTAAAGGAAAACATTGGTAATCCATTTGACATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACTACGCAATTACTATGAGGCTGTTGCGTACACAAATTTGTCGACATTTAAAAATCTAGTCTTTGCAAAATCATCGAATGTTGGCAATGAAATCGATGACGATGACGATGAAAATAGTGGTGATGGAAGGGGTGATGCTAATCAAAATAGTAATAGAAGATTCTTTTTGACTAAAGACAGCGTTTTCGGTTTATTTTTAAGAAAATTTTCACTTGGAATTTATTCAAAGTTTTGAAAAACTCATACAATTTTTTGACTCATTTTTTGATGCTTATGATAATGAATTATGTTCCAGGTCAAATTCGAATATTGAAGATTTAATTGTACAAAATTTTGCTCATTCATTTATTAGAGATCAGTATTTAATATCAACTCGTAATCAGGCTTTAGATGTCTGTTCCGAAATTATTGATTCTATTGGAAAAATTGGTGGACGTCCTAATCTTAATCTACAAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGG-ATCTTACCATGGCTGAGAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCAAAATCCAGAAATCTCATTAACAACGTCAACATTTTCTGGAGCTGGCACAGGATCGACGACT---ACAACAACAACAGCAGGACCAGGAACAAGCGCATCGTCAGTACTAACTCCACCTATCAATTCTAGTAATACCTGTGCTCATATGGCAGTGACTGGTGCTGCAATGCATTTAAATTTTGGTCATTGGTATAAAAGAAAATGTTTGATTAAGGAAGCGCTTCAAAAATCGCTAGAAAGTGAATCGAAAGATTCACTTGGTCATGTTAAAGTTACGCATACTTTATTGAATTCAAGTGCTGATCCATTTCGTTATGATAATGAAGCACCTATGAAACAATCATTCAAATCAAATGATGTTACATTAACTGAATTTCGTACAACATTTTGCACGTGCATTAGATACAGGATCAGAACCATATTAACTTTTAACTGTTTATTTCAATTCTGTTAATATTATATCACAAGCATATTTTACTGTATGTCAATTGGATTTAGCTACAATGTGGCAATTTTATGGTTATCCAAATATG]

[+] EMBL AI975442             [TTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGGCAGTTTTTTGTCACGTGTTTTAAGTAAATAACATGAAGTTCTGTGAATTCCTCAAATAAAATAGCCGATTTACATTTTGTGAAAAAAATGATATTCTACCAGAAAATTGGCGGTGAAAGTTATTTCATTGATAGTGTTACACACAACAGCTTTATGTTATTCATCATCTTACGTGAATATATTTGTTCACTAACAATGCCAGATAACTCTGAGGACCAAATACCGTGTATTAATTCAAAAGATACAATCACTTTGTATATGCTAATGTATGAAATGTTAAAGGAAAACATTGGTAATCCATTTGACATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACTACGCAATTACTATGAGGCTGTTGCGTACACAAATTTGTCGACATTTAAAAATCTAGTCTTTGCAAAATCATCGAATGTTGGCAATGAAATCGATGACGATGACGATGAAAATAGTGGTGATGGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD136938             [                                TTTGTCACGTGTCTTAAGTAAATAACATGAAGTTCTGTGAATTCCTCAAATAAAATAGCCGATTTACATTTTGTGAAAAAAATGATATTCTACCAGAAAATTGGCGGTGAAAGTTATTTCATTGATAGTGTTACACACAACAGCTTTATGTTATTCATCATCTTACGTGAATATATTTGTTCACTAACAATGCCAGATAACTCTGAGGACCAAATACCGTGTATTAATTCAAAAGATACAGTCACTTTGTATATGCTAATGTATGAAATGTTAAAGGAAAACATTGGTAATCCATTTGACATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD088921             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTACGTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACTACGCAATTACTATGAGGCTGTTGCGTACACAAATTTGTCGACATTTAAAAATCTAGTCTTTGCAAAATCATCGAATGTTGGCAATGAAATCGATGACGATGACGATGAAAATAGTGGTGATGGAGGGGGTGATGCTAATCAAAATAGTAATAGAAGATTCTTTTTGACTAAAGACAGCGTTTTCGGTTTATTTTTAAGAAAATTTTCACTTGGAATTTATTCAAAGTTTTGAAAAACTCATACAATTTTTTGACTCATTTTTTGATGCTTATGATAATGAATTATGTTCCAGGTCAAATTCGAATATTGAAGATTTAATTGTACAAAATTTTGCTCATTCATTTATTAGAGATCAGTATTTAATATCAACTCGTAATCAGGCTTTAGATGTCTGTTCCGAAATTATTGATTCTATTGGAAAAATTGGTGGACGTCCTAATCTTAATCTACAAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGG ATCTTACCATGGCTGANAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCAAAATCCAGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD167085             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAGATCAGTATTTAATATCAACTCGTAATCAGGCTTTACATGTCTGTTCCGAAGTTATTGATTCTATTGGAAAAATTGGTGGACGTCCTAATCTTAATCTACAAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGGAATCTTACCATGGCTGAGAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCCAAATCCAGAAATCTCATTAACAACGTCAACATTTTCTGGAGCTGGCACAGGATCGACGACTACAACAACAACAACAGCAGGACCAGGAACAAGCGCATCGTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD164370             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATCTTAATCTACCAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTATCCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGGAATCTTACCATGGCTGAGAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCAAAATCCAGAAATCTCATTAACGACGTCAACATTTTCTGGAGCTGGCGCAGCATCGACGACT   ACAACAACAACAGCAGGACCAGGAGCAAGCGCATCGTCAGTACTAACTCCACCTATCAATTCTAGTAATACCTGTGCTCATATGGCAGTGACTGGTGCTGCAATGCATTTAAATTTTGGTCATTGGTATAAAAGAAAATGTTTGATTAAGGAAGCGCTTCAAAAATCGCTAGAAAGTGAATCGAAAGATTCACTTGGTCATGTTAAAGTTACGCATACTTTAT                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD069200             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAGCATGTACAAGAACAAGCGCATCGTCAGTACTAACTCCACCTATCAATTCTAGTAATACCTGTGCTCATATGGCAGTGACTGGTGCTGCAATGCATTTAAATTTTGGTCATTGGTATAAAGGAAAATGTTTGATTAAGGAAGCGCTTCAAAAATCGCTAGAAAGTGAATCGAAAGATTCACTTGGTCATGTTAAAGTTACGCATACTTTATTGAATTCAAGTGCTGATCCATTTCGTTATGATAATGAAGCACCTATGAAACAATCATTCAAATCAAATGATGTTACATTAACTGAATTTCGTACAACATTTTGCACGTGCATTAGATACAGGATCAGAACCATATTAACTTTTAACTGTTTATTTCAATTCTGTTAATATTATATCACAAGCATATTTTACTGTATGTCAATTGGATTTAGCTACAATGTGGCAATTTTATGGTTATCCAAATATG]


>consensus_8132#0 TTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGGCAGTTTTTTGTCACGTGTTTTAAGTAAATAACAT GAAGTTCTGTGAATTCCTCAAATAAAATAGCCGATTTACATTTTGTGAAAAAAATGATAT TCTACCAGAAAATTGGCGGTGAAAGTTATTTCATTGATAGTGTTACACACAACAGCTTTA TGTTATTCATCATCTTACGTGAATATATTTGTTCACTAACAATGCCAGATAACTCTGAGG ACCAAATACCGTGTATTAATTCAAAAGATACAATCACTTTGTATATGCTAATGTATGAAA TGTTAAAGGAAAACATTGGTAATCCATTTGACATATTAAAACGCGATTCGCAAGATGTAC GTATTCCTGCGTATTTAAAACCATTGATTCGAGGCCGAATTGAAAGACTACGCAATTACT ATGAGGCTGTTGCGTACACAAATTTGTCGACATTTAAAAATCTAGTCTTTGCAAAATCAT CGAATGTTGGCAATGAAATCGATGACGATGACGATGAAAATAGTGGTGATGGAAGGGGTG ATGCTAATCAAAATAGTAATAGAAGATTCTTTTTGACTAAAGACAGCGTTTTCGGTTTAT TTTTAAGAAAATTTTCACTTGGAATTTATTCAAAGTTTTGAAAAACTCATACAATTTTTT GACTCATTTTTTGATGCTTATGATAATGAATTATGTTCCAGGTCAAATTCGAATATTGAA GATTTAATTGTACAAAATTTTGCTCATTCATTTATTAGAGATCAGTATTTAATATCAACT CGTAATCAGGCTTTAGATGTCTGTTCCGAAATTATTGATTCTATTGGAAAAATTGGTGGA CGTCCTAATCTTAATCTACAAAAATATAATGAACTTTTATTGTTAGCTAAAAAAATGTAT CCTGAAGTATCATATACGCATTATGCTTCACATGCATATGCCTTGCAAAAACGGATCTTA CCATGGCTGAGAACGAATTACATGCATACTTTGAAACATGTATGGCATCGGTGCAAAATC CAGAAATCTCATTAACAACGTCAACATTTTCTGGAGCTGGCACAGGATCGACGACTACAA CAACAACAGCAGGACCAGGAACAAGCGCATCGTCAGTACTAACTCCACCTATCAATTCTA GTAATACCTGTGCTCATATGGCAGTGACTGGTGCTGCAATGCATTTAAATTTTGGTCATT GGTATAAAAGAAAATGTTTGATTAAGGAAGCGCTTCAAAAATCGCTAGAAAGTGAATCGA AAGATTCACTTGGTCATGTTAAAGTTACGCATACTTTATTGAATTCAAGTGCTGATCCAT TTCGTTATGATAATGAAGCACCTATGAAACAATCATTCAAATCAAATGATGTTACATTAA CTGAATTTCGTACAACATTTTGCACGTGCATTAGATACAGGATCAGAACCATATTAACTT TTAACTGTTTATTTCAATTCTGTTAATATTATATCACAAGCATATTTTACTGTATGTCAA TTGGATTTAGCTACAATGTGGCAATTTTATGGTTATCCAAATATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)