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Schistosoma mansoni
cluster # 8145 cluster # 8145       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8145#0 length = 618 sequences # 6  

consensusID : consensus_8145#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 618
fasta sequence
                              [CATCAAGTCGATAACGCGTTGAATGCCAACTATTCGATCATCTGGGTGTGCTTCACTAAGTATTGAATAGATTAGCCAACTGCGAAAACGATTTGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC-AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACAT]

[+] EMBL CD163506             [CATCAAGTCGATAACGCGTTGAATGCCAACTATTCGATCATCTGGGTGTGCTTCACTAAGTATTGAATAGATTAGCCAACTGCGAAAACGATTTGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCATCAGG                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD094946             [                                                                                             TGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAGTATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAATCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACA ]
[+] EMBL CD095213             [                                                                                             TGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGCTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACA ]
[+] EMBL CD094777             [                                                                                             TGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGCACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATGATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTNTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACA ]
[+] EMBL CD095239             [                                                                                             TGAAAATGACTTTGATTTGTTCAAATTAGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCC AAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAGAATTTCTTAATTGATCTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTAGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCCAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACA                                                       ]
[-] EMBL CD095232             [                                                                                                                                      CAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCCAAAAATGGTATACGTCGATATAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAAGGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGGGTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCTTATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATAATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATCTAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATTACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGAGCGAAATCTTTTCAACAT]


>consensus_8145#0 CATCAAGTCGATAACGCGTTGAATGCCAACTATTCGATCATCTGGGTGTGCTTCACTAAG TATTGAATAGATTAGCCAACTGCGAAAACGATTTGAAAATGACTTTGATTTATTCAAATT AGGTACAGCATTACCAGTACGATCACGACTTTCAACTTCCCAAAATGGTATACGTCGATA TAATTCCCATTCATACAATGTAACTTGTTCAGCTAATTTGAAAGGATGAATATTATTTAA GGTTATACGATTAACAAAATTTCTTAATTGATTTGATTCGATTGATGATACAGATGTTGG GTCAGACGATGATAATAGTGACAACAATTCCGCATTATCTTTACTTGTTTCCATAGTCCT TATTGTTGTTGTCGTCATTGCTTCAGGATATTGTGTTGAAATTGGAGGATTTTGTAAATA ATGTTTAATACGTTCAACCGATGAAATTAAATGTCTAGCTTGTATACTCGATAAAAAATC TAACAGTTTCTGACGTAATCGAGGATTAGGAGCAAAATCATTCTGATAATAGCGTGCATT ACGAACCCAACGGGATAGGAACATTATCACTCTGGATTGAATACGCTTTTTATATCCTGA GCGAAATCTTTTCAACAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)