These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8152#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 583 fasta sequence [TTGCTGCTAGAGAAGTTGAGAATGGATCTGACAAATTAGGATTCACAGGGTCTGAACGTTTACCTTCATCTATTTGACGAGTAGCCTTTGCATGTTCATCAGCATCAAGTACATAACGAATATCACGCATACATGATTTAATAACATCTTCACGACCAATTCGACGAAGTGCATAATCTAATTCGTTGCCTGTGGCTGAATCTCCATTTTCCTCACGCCATGCCAATAATACCGCTAATGCTTGATCTTGTATTGTACGTAATTCATTTACACTAATTGGACCACCAAAACTGCCAGCTACATCACCACCGTCATTTTCTCCTGTTATTTTACCCATTTCCATAGCTAATCGATTTCTTTCAATTTGCCACTTTGGTTCACTTTCATTAATCCAATTAACTAATTGATTCACAGTACATGAACTATTTAAATGAGATTGAGGTAAGAGGAATTCGATTAGTTTGGGCCAATCTGAGCCGATTTCACTAGCAACTTGCAGTAAATCAATTTGACTACGAGCCATTACATCTGATGTATAAGTTGAAGCCAAATTACCAGAGGGTTTATTAACTTCATTATTTTG] [-] EMBL CD192764 [TTGCTGCTAGAGAAGTTGAGAATGGATCTGACAAATTAGGATTCACAGGGTCTGAACGTTTACCTTCATCTATTTGACGAGTAGCCTTTGCATGTTCATCAGCATCAAGTACATAACGAATATCACGCATACATGATTTAATAACATCTTCACGACCAATTCGACGAAGTGCATAATCTAATTCGTTGCCTGTGGCTGAATCTCCATTTTCCT ] [+] EMBL CD201743 [ CTGCTAGAGAAGTTGAGAATGGATCTGACAAATTAGGATTCACAGGGTCTGAACGTTTACCTTCATCTATTTGACGAGTAGCCTTTGCATGTTCATCAGCATCAAGTACATAACGAATATCACGCATACATGATTTAATAACATCTTCACGACCAATTCGACGAAGTGCATAATCTAATTCGTTGCCTGTGGCTGAATCTCCATTTTCCTCACGCCATGCCAATAATACCGCT ATGCTTGATCTTGTATTGTACGTAATTCATTTACACTAATTGGACCACCAAAACTGCCAGCTACATCACCACCGTCATTTTCTCCTGTTATTTTACCCATTTCCATAGCTAATCGATTTCTTTCAATTCACCACTTTGGTTCACTTTCATTAATCCAATTAACTAATTGATTCACAGTACATGAACTATTTAAATGAGATTGAGGTAAGAGGAATTCGATTAGTTTGGGCCAATCTGAGCCGATTTCACTAGCAACTTGCAGTAAATCAATTTGACTACGAGCCATTACATCTGATGTATAAGTTGAAGCCAAATTACCAGAGGGTTTATTAACTTCATTATTTTG] [-] EMBL CD115028 [ TGCTAGAGAAGTTGAGAATGGATCTGACAAATTAGGATTCACAGGGTCTGAACGTTTACCTTCATCTATTTGACGAGTAGCCTTTGCATGTTCATCAGCATCAAGTACATAACGAATATCACGCATACATGATTTAATAACATCTTCACGACCAATTCGACGAAGTGCATAATCTAATTCGTTGCCTGTGGCTGAATCTCCATTTTCCTCACGCCATGCCAATAATACCGCTAATGCTTGATCTTGTATTGTACGTAATTCATTTACACTAATTGGACCACCAAAACTGCC ] [-] EMBL CD163250 [ GAATGGATCTGACAAATTAGGATTCACAGGGTCTGAACGTTTACCTTCATCTATTTGACGAGTAGCCTTTGCATGTTCATCAGCATCAAGTACATAACGAATATCACGCATACATGATTTAATAACATCTTCACGACCAATTCGACGAAGTGCATAATCTAATTCGTTGCCTGTGGCTGAATCTCCATTTTCCTCACGCCATGCCAATAATACCGCTAATGCTTGATCTTGTATTGTACGTAATTCATTTACACTAATTGGACCACCAAAACTGCCAGCTACATCACCACCGTCCTTTTCTCCTGTTATTTTACCCATTTCCATAGCTAATCGATTTCTTTCAATTTGCCACTTTGGTTCACTTTCATTAATCCAATTAACTAATTGATTC ] [+] EMBL CD119013 [ AGTAGCCTTTGCATGTTCATCAGCATCAAGTACATAACGAATATCACGCATACATGATTTAATAACATCTTCACGAACAATTCG ] [+] EMBL CD180655 [ CACCGTCATTTTCTCCTGTTATTTTACCCATTTCCATAGCTAATCGATTTCTTTCAATTTGCCACTTTGGTTCACTTTCATTAATCCAATTAACTAATTGATTCACAGTACATGAACTATTTAAATGAGATTGAGGTAAGAGGAATTCGATTAGTTTGGGCCAATCTGAGCCGATTTCACTAGCAACTTGCAGTAAATCAATTTGACTACGAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||