cluster # 816

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Schistosoma mansoni
cluster # 816 cluster # 816 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_816#0 length = 808 sequences # 2

consensusID : consensus_816#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 808
fasta sequence

                              [TTATTCGGCACGACGAAAAAATTAATTAATGAACTTTGATTATGATTTGTAAAAAAAAATGGACATTGAAATTTTTGATTCATCAATAGTTTGTTTATACTAGGTTCTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTCTGTTTTTTTAATTTTACTTAACTGTACAATTTTCTTAAACTTTAGAATGCATCATTTTACATTCATTATTATGAGAAATGCTACTAGTACTACTAATACTACTTATTTACGATTTTAAAAATGGATTATCATTATCATTATTTCCAATTATATTGGTATCTATGTATAAACTATATATGATTAGTAACCGTTTTCATTTTCAACAAGCTTGACTTTTAACTATTTTTACTACTGTTATTACTATTATTATTATTATTATTCTGAATCACTTATGAATGAGAAATATACACACAACCAATAATGTATACAAAAGTTTCCTTTGTACATAATAATAATAATAAAATTGCTTCCATCTAGCTCTTGATTCAGTTTAAACTTGAATTGTTTTATTTCGCCTCCATGCCCCCCCTCGCCAATCGCCCTATTAGTTAATTCTAATTATCTTGATCCTTCTTTTTGTTTCCAAGCGAAAAAACAATATCTATTTTTATTCTATATTTTTTTCTCTAATATTGTACATTGTTATTAATCTCAATATATATATCTATATTGNGTTTTTTTAATACATTTATTATATGTATACTACTTGTAGGTGCACGTTTTTGTGTATAGATTACGACGTAGAAATAATATGCTAGAAATGT-AATTAATTG-AAAGATGACGAATAAATAC-CATA]

[+] EMBL CD081581             [TTATTCGGCACGACGAAAAAATTAATTAATGAACTTTGATTATGATTTGTAAAAAAAAATGGACATTGAAATTTTTGATTCATCAATAGTTTGTTTATACTAGGTTCTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTCTGTTTTTTTAATTTTACTTAACTGTACAATTTTCTTAAACTTTAGAATGCATCATTTTACATTCATTATTATGAGAAATGCTACTAGTACTACTAATACTACTTATTTACGATTTTAAAAATGGATTATCATTATCATTATTTCCAATTATATTGGTATCTATGTATAAACTATATATGATTAGTAACCGTTTTCATTTTCAACAAGCTTGACTTTTAACTATTTTTACTACTGTTATTACTATTATTATTATTATTATTCTGAATCACTTATGAATGAGAAATATACACACAACCAATAATGTATACAAAAGTTTCCTTTGTACATAATAATAATAATAAAATTGCTTCCATCTAGCTCTTGATTCAGTTTAAACTTGAATTGTTTTATTTCGCCTCCATGCCCCCCCTCGCCAATCGCCCTATTAGTTAATTCTAATTATCTTGATCCTTCTTTTTGTTTCCAAGCGAAAAAACAATATCTATTTTTATTCTATATTTTTTTCTCTAATATTGTACATTGTTATTAATCTCAATATATATATCTATATTGNGTTTTTTTAATACATTTATTATATGTATACTACTTGTAGGTGCACGTTTTTGTGTATAGATTACGACGTAGAAATAATATGCTAGAAATGT AATTAATTG AAAGATGACGAATAAATAC CAT ]
[-] EMBL CD075405             [                                                                                                                                                                          ACTTTAGAATGCATCATTTTACATTCATTATTATGAGAAATGCTACTAGTACTACTAATACTACTTATTTACGATTTTAAAAATGGATTATCATTATCATTATTTCCAATTATATTGGTATCTATGTATAAACTATATATGATTAGTAACCGTTTTCATTTTCAACAAGCTTGACTTTTAACTATTTTTACTACTGTTATTACTATTATTATTATTATTATTCTGAATCACTTATGAATGAGAAATATACACACAACCAATAATGTATACAAAAGTTTCCTTTGTACATAATAATAATAATAAAATTGCTTCCATCTAGCTCTTGATTCAGTTTAAACTTGAATTGTTTTATTTCGCCTCCATGCCCCCCCTCGCCAATCGCCCTATTAGTTAATTCTAATTATCTTGATCCTTCTTTTTGTTTCCAAGCGAAAAAACAATATCTATTTTTATTCTATATTTTTTTCTCTAATATTGTACATTGTTATTAATCTCAATATATATATCTATATTGGGTTTTTTTAATACATTTATTATATGTATACTACTTGTAGGTGCACGTTTTTGTGTATAGATTACGACGTAGAAATAATATGCTAG AATGTAAATTAATTGAAAAGATGACGAATAAATACACATA]




>consensus_816#0
TTATTCGGCACGACGAAAAAATTAATTAATGAACTTTGATTATGATTTGTAAAAAAAAAT
GGACATTGAAATTTTTGATTCATCAATAGTTTGTTTATACTAGGTTCTTTTTTTTGTTTT
GTTTTGTTTTTCTGTTTTTTTAATTTTACTTAACTGTACAATTTTCTTAAACTTTAGAAT
GCATCATTTTACATTCATTATTATGAGAAATGCTACTAGTACTACTAATACTACTTATTT
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AACTATATATGATTAGTAACCGTTTTCATTTTCAACAAGCTTGACTTTTAACTATTTTTA
CTACTGTTATTACTATTATTATTATTATTATTCTGAATCACTTATGAATGAGAAATATAC
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GTAGGTGCACGTTTTTGTGTATAGATTACGACGTAGAAATAATATGCTAGAAATGTAATT
AATTGAAAGATGACGAATAAATACCATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case