These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8165#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 748 fasta sequence [TCAAAGAGTACAAGATAATTGGGCTTTCTTGTTCGCTCAACGCTTAGCATTGAAATTTAAAGTCCCACTACACGTTTGTTTCTGTTTGGTTCCGAAATTTCAAGCCGAAACGTTACGACATTATACCTTTATGGTTGAAGGATTGAAAGAAGTAGAGAAAGAATGTCGTGAACTTTGTATACCATTTCATATTACATCAGCTATCACTAACAGCTCATCGAACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTCGTACAATTAGACCTAAATTACATCAAAAAGCAAACAACTTAATGACTGAGTTCCCGCCGTTGATTAGACATCCCTACTGCCATCAATCAAGTTTATCACCAATAGATTGGAATTATTGGATATCAAAATTTTCGGGAGATTTATCAGTTAAACCAGTTGATTGGGCAATTCCAGGAACCAGTGGGGGTCTCACAACGTTACACACATTCATTTATGAAAGACTGCCTAAATACGCTGATTGTCGTAACGACCCC] [+] EMBL CD120736 [TCAAAGAGTACAAGATAATTGGGCTTTCTTGTTCGCTCAACGCTTAGCATTGAAATTTAAAGTCCCACTACACGTTTGTTTCTGTTTGGTTCCGAAATTTCAAGCCGAAACGTTACGACATTATACCTTTATGGTTGAAGGATTGAAAGAAGTAGAGAAAGAATGTCGTGAACTTTGTATACCATTTCATATTACATCAGCTATCACTAACAGCTCATCGAACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTC ] [+] EMBL CD130400 [ GAACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAGTCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTT GCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGC ] [-] EMBL CD130306 [ AACAATCAGCCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATC CCTAGAATATGCGG ] [+] EMBL CD079042 [ CCAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTCGTACAATTAGACCTAAATTACATCAAAAAGCAAACAACTTAATGACTGAGTTCCCGCCGTTGATTAGACATCCCTACTGCCATCAATCAAGTTTATCACCAATAGATTGGAATTATTGGATATCAAAATTTTCGGGAGATTTATCAGTTAAACCAGTTGATTGGGCAATTCCAGGAACCAGTGGGGGTCTCACAACGTTACACACATTCATTTATGAAAGACTGCCTAAATACGCTGATTGTCGTAACGACCC ] [-] EMBL CD073495 [ CAGTCAAAACGGGCGTTAAGCGTAAATTACCGGAATCGGTGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTTTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTCCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAATGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCACTTAGAATATGCGGCTCGTACAATTAGACCTAAATTACATCAAAAAGCAAACAACTTAATGACTGAGTTCCCGCCGTTGATTAGACATCCCTACTGCCATCAATCAAGTTTATCACCAATAGATTGGAATTATTGGATATCAAAATTTTCGGGAGATTTATCAGTTAAACCAGTTGATTGGGCAATTCCAGGAACCAGTGGGGGTCTCACAACGTTACACACATTCATTTATGAAAGACTGCCTAAATACGCTGATTGTCGTAACGACCCC] [-] EMBL CD130379 [ TGAATGATTATTGTCACGCTGATACAGTCGCTCAGTCCGTTTTAAGTTTGATACAAAGTGTTAATATCAGCTGTATCATAACAGATTTTTTTCCTCTACGTGAACCTACAGCTTGGATAAAACAGTTGGCTGAACTGCTACCAGAAAATATTTCGTTTTGTCAGGTGGATGCACATAACGTTGTTCCTGTTTGGCATGCATCAGATCAC TAGAATATGCGG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||