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Schistosoma mansoni
cluster # 8182 cluster # 8182       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8182#0 length = 751 sequences # 6  

consensusID : consensus_8182#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 751
fasta sequence
                              [CTGAGTGTATGCCCATGCATTTCTGATTTTAAAGCATCTTCCATATTACGCTTACCAAGTGATGTATATTCATTGAATACAGCTCTTAAGTGAGCATAGGATCGCGTAACCAAGATGTGAATGAATTTTGATTCGTCTGTTCCTATTTTTTTGCTCCCCTGCTCTATATAGATCTTCCGCGTCTCTCCGTGCAAGATTCGTATCTACAAATGTAGATTCGTCTCTATTTGCTTGCAGCAAAGC-AATACATATACGTTTAAAATGGTGTGTAGTATCATTGTCGACATCTTTTTCTAAGTTACGTCCATTGAGTAATTTTGGATAAACATCCTTGATTCT-T-TTGATTTGCTCGTTTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAAGTGACTATGTAATTCAGACTTAAATTTGGCAAATAAATCTTTTCCATACATTGATTTGTATTTTTGTACGATCATTACACGTTGATCAACAGTTCGATGACCCATTACTTCGATGATCTCTTTTTCATTTGCTCCTAATCCAGCCATAGCCTTTTTTAAACGTTCACAGTCTCGTTCAACACAGAAATTAGGTGTTGCTCTTAAAGTTGGCTCCATATATCTTCGTGTGGAGCTGATTCAGCAAACCCATAAACTCTGCATGAGCCCCTCG]

[+] EMBL CD196770             [CTGAGTGTATGCCCATGCATTTCTGATTTTAAAGCATCTTCCATATTACGCTTACCAAGTGATGTATATTCATTGAATACAGCTCTTAAGTGAGCATAGGATCGCGTAACCAAGATGTGAATGAATTTTGATTCGTCTGTTCCTATTTTTTTGCTCCCCTGCTCTATATAGATCTTCCGCGTCTCTCCGTGCAAGATTCGTATCTACAAATGTAGATTCGTCTCTATTTGCTTGCAGCAAAGC AATACATATACGTTTAAAATGGTGTGTAGTATCATTGTCGACATCTTTTTCTAAGTTACGTCCATTGAGTAATTTTGGATAAACATCCTTGATTCT T TTGATTTGCTCGTTTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD096845             [                                                                                                                                                                                         TCCGTGCAAGATTCGTATCTACAAATGTAGATTCGTCTCTATTTGCTTGCAGCAAAGC AATACATATACGTTTAAAATGGTGTGTAGTATCATTGTCGACATCTTTTTCTAAGTTACGTCCATTGAGTAATTTTGGATAAACATCCTTGATTCT T TTGATTTGCTCGTTTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGCACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAAGTGACTATGTAATTCAGACTTAAATTTGGCAAATAAATCTTTTCCATACATTGATTTGTATTTTTGTACGATCATTACACGTTGATCAACAGTTCGATGACCCATTACTTCGATGATCTCTTTTTCATTTGCTCCTAATCCAGCCATAGCCTTTTTTAAACGT                                                                                                            ]
[-] EMBL CD084393             [                                                                                                                                                                                                  GATTCGTATCTACAAATGTAGATTCGTCTCTATTTGCTTGCAGCAAAGCGAATACATATACGTTTAAAATGGTGTGTAGTATCATTGTCGACATCTTTTTCTAAGTTACGTCCATTGAGTAATTTTGGATAAACATCCTTGATTCTATGTTGATTTGCTCGTTTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTAATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTATACGAAGTTCAATTGCATCAAATTa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD084020             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAACATCCTTGATTCT T TTGATTTGCTCGTTTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAAGTGACTATGTAATTCAGACTTAAATTTGGCAAATAAATCTTTTCCATACATTGATTTGTATTTTTGTACGATCATTACACGTTGATCAACAGTTCGATGACCCATTACTTCGATGATCTCTTTTTCATTTGCTCCTAATCCAGCCATAGCCTTTTTTAAACGTTCACAGTCTCGTTCAACACAGAAATTAGGTGTTGCTCTTAAAGTTGGCTCCATATATCTTCGTGTGGAGCTGATTCAGCAAACCCATAAACTCTGCATGAGCCCCTCG]
[+] EMBL CD161983             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taacTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAAGTGACTATGTAATTCAAAACTAAAATTGGC                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD161461             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAAGTGACTATGTAATTCAGACTTAAATTTGGCAAATAAACCTTTTCCATACATTGATTTGTATTTTTGTACGATCATTACACGTTGATCAACAGTTCGATGACCC                                                                                                                                                                        ]


>consensus_8182#0 CTGAGTGTATGCCCATGCATTTCTGATTTTAAAGCATCTTCCATATTACGCTTACCAAGT GATGTATATTCATTGAATACAGCTCTTAAGTGAGCATAGGATCGCGTAACCAAGATGTGA ATGAATTTTGATTCGTCTGTTCCTATTTTTTTGCTCCCCTGCTCTATATAGATCTTCCGC GTCTCTCCGTGCAAGATTCGTATCTACAAATGTAGATTCGTCTCTATTTGCTTGCAGCAA AGCAATACATATACGTTTAAAATGGTGTGTAGTATCATTGTCGACATCTTTTTCTAAGTT ACGTCCATTGAGTAATTTTGGATAAACATCCTTGATTCTTTTGATTTGCTCGTTTGTCCT TGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACG AAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAA GTGACTATGTAATTCAGACTTAAATTTGGCAAATAAATCTTTTCCATACATTGATTTGTA TTTTTGTACGATCATTACACGTTGATCAACAGTTCGATGACCCATTACTTCGATGATCTC TTTTTCATTTGCTCCTAATCCAGCCATAGCCTTTTTTAAACGTTCACAGTCTCGTTCAAC ACAGAAATTAGGTGTTGCTCTTAAAGTTGGCTCCATATATCTTCGTGTGGAGCTGATTCA GCAAACCCATAAACTCTGCATGAGCCCCTCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)