These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8182#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 751 fasta sequence [CTGAGTGTATGCCCATGCATTTCTGATTTTAAAGCATCTTCCATATTACGCTTACCAAGTGATGTATATTCATTGAATACAGCTCTTAAGTGAGCATAGGATCGCGTAACCAAGATGTGAATGAATTTTGATTCGTCTGTTCCTATTTTTTTGCTCCCCTGCTCTATATAGATCTTCCGCGTCTCTCCGTGCAAGATTCGTATCTACAAATGTAGATTCGTCTCTATTTGCTTGCAGCAAAGC-AATACATATACGTTTAAAATGGTGTGTAGTATCATTGTCGACATCTTTTTCTAAGTTACGTCCATTGAGTAATTTTGGATAAACATCCTTGATTCT-T-TTGATTTGCTCGTTTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAAGTGACTATGTAATTCAGACTTAAATTTGGCAAATAAATCTTTTCCATACATTGATTTGTATTTTTGTACGATCATTACACGTTGATCAACAGTTCGATGACCCATTACTTCGATGATCTCTTTTTCATTTGCTCCTAATCCAGCCATAGCCTTTTTTAAACGTTCACAGTCTCGTTCAACACAGAAATTAGGTGTTGCTCTTAAAGTTGGCTCCATATATCTTCGTGTGGAGCTGATTCAGCAAACCCATAAACTCTGCATGAGCCCCTCG] [+] EMBL CD196770 [CTGAGTGTATGCCCATGCATTTCTGATTTTAAAGCATCTTCCATATTACGCTTACCAAGTGATGTATATTCATTGAATACAGCTCTTAAGTGAGCATAGGATCGCGTAACCAAGATGTGAATGAATTTTGATTCGTCTGTTCCTATTTTTTTGCTCCCCTGCTCTATATAGATCTTCCGCGTCTCTCCGTGCAAGATTCGTATCTACAAATGTAGATTCGTCTCTATTTGCTTGCAGCAAAGC AATACATATACGTTTAAAATGGTGTGTAGTATCATTGTCGACATCTTTTTCTAAGTTACGTCCATTGAGTAATTTTGGATAAACATCCTTGATTCT T TTGATTTGCTCGTTTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATA ] [+] EMBL CD096845 [ TCCGTGCAAGATTCGTATCTACAAATGTAGATTCGTCTCTATTTGCTTGCAGCAAAGC AATACATATACGTTTAAAATGGTGTGTAGTATCATTGTCGACATCTTTTTCTAAGTTACGTCCATTGAGTAATTTTGGATAAACATCCTTGATTCT T TTGATTTGCTCGTTTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGCACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAAGTGACTATGTAATTCAGACTTAAATTTGGCAAATAAATCTTTTCCATACATTGATTTGTATTTTTGTACGATCATTACACGTTGATCAACAGTTCGATGACCCATTACTTCGATGATCTCTTTTTCATTTGCTCCTAATCCAGCCATAGCCTTTTTTAAACGT ] [-] EMBL CD084393 [ GATTCGTATCTACAAATGTAGATTCGTCTCTATTTGCTTGCAGCAAAGCGAATACATATACGTTTAAAATGGTGTGTAGTATCATTGTCGACATCTTTTTCTAAGTTACGTCCATTGAGTAATTTTGGATAAACATCCTTGATTCTATGTTGATTTGCTCGTTTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTAATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTATACGAAGTTCAATTGCATCAAATTa ] [-] EMBL CD084020 [ TAAACATCCTTGATTCT T TTGATTTGCTCGTTTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAAGTGACTATGTAATTCAGACTTAAATTTGGCAAATAAATCTTTTCCATACATTGATTTGTATTTTTGTACGATCATTACACGTTGATCAACAGTTCGATGACCCATTACTTCGATGATCTCTTTTTCATTTGCTCCTAATCCAGCCATAGCCTTTTTTAAACGTTCACAGTCTCGTTCAACACAGAAATTAGGTGTTGCTCTTAAAGTTGGCTCCATATATCTTCGTGTGGAGCTGATTCAGCAAACCCATAAACTCTGCATGAGCCCCTCG] [+] EMBL CD161983 [ taacTGTCCTTGAACAAAGAATTTCAATCAATGCATCTTCATCAGTACCAGCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAAGTGACTATGTAATTCAAAACTAAAATTGGC ] [+] EMBL CD161461 [ GCTCCTCTCATTGCTCTACGAAGTTCAATTGCATCAAATTCCGCTGGTGAATAACACAACGCGATCACACAGTCTTCTAAGTGACTATGTAATTCAGACTTAAATTTGGCAAATAAACCTTTTCCATACATTGATTTGTATTTTTGTACGATCATTACACGTTGATCAACAGTTCGATGACCC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||