These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8185#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 657 fasta sequence [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCAAATGGTACAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCACAAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACGTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTATTCTTGAG-TAGTTATGTTATCGATTTTCNNNCGAAAANTAAGAGAAGAANATANGAAAAGAANAGAAAAAAGAAANCCAGTTGAAGAGGACAATNGTNACGACGAAAGCGAATTTCTACCTCGATAATAACTTCTCTCTATAAGTTTCTTTTCTTTTTTCACTAAATAACACTGTCATACCCTTCATTCTTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTCTCTATCTACCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATTCTTTCTCTATAGTTTATTCCATTGAATATATATATCTATATATCC] [+] EMBL AI110979 [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCAAATGGTACAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCACAAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACNTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTNCTTATTCGTTACTATTATTATTCTTGAG TAGTTATGTTATCGATTTTCNNNCGAAAANTAAGAGAAGAANATANGAAAAGAANAGAAAAAAGAAANCCAGTTGAAGAGGACAATNGTNACGACGAAAGCGAATTTCTACCTCGATAATAACTTCTCTCTATAAGTTTCTTTTCTTTTTTCACTAAATAACACTGTCATACCCTTCATTCTTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTCTCTATCTACCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATTCTTTCTCTATAGTTTATTCCATTGAATATATATATCTATATATCC] [+] EMBL AI111118 [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACNTCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCAAATGGTACAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCNCAAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACGTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTATTCTTGAG TAGTTATGTTATCGATT ] [+] EMBL AI111072 [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTNGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCNAATGGTACAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCNCNAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTNAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACNATCACGTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTA TCTTGAG TTGTTATGTTATCGATT ] [+] EMBL AI111046 [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCAAATGGTACAATAGAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTAGCACAAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACGTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTATTCTTGAGTTAGTTATGTTA ] [+] EMBL AI111137 [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCNAATGGTNCAATAGAAGATGAAGAATTATCNGGATTTCTTAAAGATTTGTTNGAATTAGCACAAGAAGATTATGATGAAGATGATTTAGAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTAATCGTGATGAATTAAAAATGATGCTTATGCAACAATCACGTTTATTAAGTGATAAAATTTAGAAAAATTTGATTGAATTACTTATTCGTTACTATTATTATTCTTGAG TAGTTATGTTA ] [+] EMBL AI111100 [CACGATTACTTCCTGTTAAGGAGAACTATTTATGTAGACCAATTTTTAAGAATGCTTCAAAAATTACATCAGCTGATATTGATCGAGCATTTTCACTTTATGATTTAGATGCNAATGGTACAATANAAGATGAAGAATTATCAGGATTTCTTAAAGATTTGTTAGAATTANCACAAGAAGATTATGATGAANATNATTTNNAATTTTTTAAAAAAGTTATCCTTAATCAATGGGATGTAAATAATGATGGTAAAATTANTCGTGATGANTTAAAAATGATGCTTATGC ACAATCACGTTTATT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||