These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8196#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1167 fasta sequence [AGCACCCTGCTCAAATGAATCTGGATTTACCTCCTGGAGTGGTATTTACAAATTTGTCTGGACGACAGTGTGTAGCCAAATTTGACTTCAATGCTGAGTTTCAAGAAGAAATGTCATTTCGTCAGGGAGATCGTCTTCGATTGCTTGGTGAAGAAGATGAAAATTGGTGGTTTGCTGAATTAATAACTCATGCTTCTAGTGGTCAACCAACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATGTCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGTAATCCTTCTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGGTTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGTTTTTATCTGCTCTTGTGGATGAACTTTCATGTGATAAGTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTATTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTACCCCTAAGTTTCGTGATTTGTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTTTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAATGAAATATTAGTTTTTCTGATCTACGTTTGCGAATACTTATGTATATGGGCTAAAATGTTTCTGATGCATGTACTGGNNTCTANGTTATGTCATTGTTTAATGCATAATTGTCCATGTGTATTGTTACCATCAACATACTCACATTCTCTTATTACTCTTATTAAATAATTCTTTATAGAAATTACTTTTTACAGCAGGCCAATAAATAGTGGTTGTATAAAAAAACACCCAAGGTTTCTCCAGAAAGCTCTCGTCTTTGTTTCGTTGACTGATATACCATTATGACTATCTCTGTTGTACGGTTTTTTATAGTCTGTGTTAAAACTAAATTTCCTTTCGAATAGTCATGTTTTCTTGAGATTTATCCACAAGTTGAATAAAAACAAT] [+] EMBL AI975337 [AGCACCCTGCTCAAATGAATCTGGATTTACCTCCTGGAGTGGTATTTACAAATTTGTCTGGACGACAGTGTGTAGCCAAATTTGACTTCAATGCTGAGTTTCAAGAAGAAATGTCATTTCGTCAGGGAGATCGTCTTCGATTGCTTGGTGAAGAAGATGAAAATTGGTGGTTTGCTGAATTAATAACTCATGCTTCTAGTGGTCAACCAACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATGTCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGTAATCCTTCTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGGTTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGTTTTTATCTGCTCTTGTGGATGAACTTTCATGTGATAAGTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTATTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTTCTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTACCCCTAAat ] [+] EMBL AI976926 [AGCACCCTGCTCAAATGAATCTGGATTTACCTCCTGGAGTGGTATTTACAAATTTGTCTGGACGACAGTGTGTAGCCAAATTTGACTTCAATGCTGAGTTTCAAGAAGAAATGTCATTTCGTCAGGGAGATCGTCTTCGATTGCTTGGTGAAGAAGATGAAAATTGGTGGTTTGCTGAATTAATAACTCATGCTTCTAGTGGTCAACCAACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATGTCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGTAATCCTTCTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATGTATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGGTTTCCACAGCTTGGGTGTTTATTTCTATTATTGGTTTTATCTGCTCTTGGGGATGAAC ] [-] EMBL CD074675 [ GTGGTCAACCAACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATGTCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGTAATCCTTCTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGATTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGTTTTTATCTGCTCTTGTGGATGAACTTTCATGTGATAAGTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTATTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTACCCCTAAGTTTCGTGATTTGTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTTTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAATGAAATATTAGTTT ] [+] EMBL CD082546 [ ACTCCTCAAGGCTTGATTCCTGCTAATTATGTCAAACTCTTATCAAATAATACGTCTAGTTCCACAGTTTCTAACATGCGTAGCAATCCTTCTAAAGTTCCACAACCCTCTGCTCAGATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGGTTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGTTTTTATCTGCTCTTGTGGATGAACTTTCATGTGATAACTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTATTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTATCCCTAAGTTTCGTGATTTGTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTNTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAATGAAATATTAGTTNTTCTGATCTACGTTTGCGAATACTTATGTATATGGGCTAAAATGTTTCTGATGCATGTACTGGNNTCTANGTTA ] [+] EMBL AI976199 [ ATCGCTCGTGCTACTTAACTTCTTTTGTATAAGTATAGCTGCAACACCAATATATGTACACTACATTGATATATTTGATGAATCAATCTAACCTTCTGGTTTCCACAGCTTGTGTGTTTATTTTTATTATTGCTTTTATCTGCTCTTGTGGATGAACTTTCATGTGATAAGTTTATGGTAAGTAACAGAAACTCATGCTCATCTCAGTGACTTATTCGAAGCTCAATCTGGATCTCATGTGGATTTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTACCCCTAAGTTTCGTGATTTGTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTTTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAATGAAATATTAGTTTTTCTGATCTACGTTTGCGAATACTTATGTATATGGGCTAAAATGTTT ] [-] EMBL CD076144 [ TTTCTATTTACCGAAAGCACATAATACGATCAATTTTTTGTCAGCAAATTTCATTTCAAATCTCAGAATTATTTGAATGTCTTTTTAAATGAAATAAATTGTACTACTGAGACTTATTGGTCATCTTATTATCCCTAAGTTTCGTGATTTGTATTTTTTTCCAGAATCAAAGCCTTGCTTTGGTTTTGTTTTTCACTTGTATTTTTAAATGAAATATTAGTTTTTCTGATCTACGTTTGCGAATACTTATGTATATGGGCTAAAATGTTTCTGATGCATGTACTTGGTTCTAGGTTATGTCATTGTTTAATGCATAATTGTCCATGTGTATTGTTACCATCAACATACTCACATTCTCTTATTACTCTTATTAAATAATTCTTTATAGAAATTACTTTTTACAGCAGGCCAATAAATAGTGGTTGTATAAAAAAACACCCAAGGTTTCTCCAGAAAGCTCTCGTCTTTGTTTCGTTGACTGATATACCATTATGACTATCTCTGTTGTACGGTTTTTTATAGTCTGTGTTAAAACTAAATTTCCTTTCGAATAGTCATGTTTTCTTGAGATTTATCCACAAGTTGAATAAAAACAAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||